18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0263 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_0263  transcription activator, effector binding protein  100 
 
 		 166 aa  332  1e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1132  transcription activator, effector binding  42.24 
 
 		 164 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6627  transcriptional activator ligand binding domain protein  35.15 
 
 		 164 aa  105  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.787104  normal  0.146802 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1653  transcriptional activator ligand binding domain protein  37.72 
 
 		 173 aa  105  4e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0385055  normal  0.0308654 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20280  transcriptional regulator, effector-binding domain/component  32.73 
 
 		 167 aa  102  2e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0307549  normal  0.329792 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1123  transcriptional activator ligand binding domain protein  35.96 
 
 		 177 aa  92.4  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4913  transcriptional activator ligand binding domain protein  30.95 
 
 		 164 aa  83.2  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00232908  normal  0.22679 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2813  hypothetical protein  32.95 
 
 		 111 aa  60.5  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.239957  normal  0.0833184 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6173  transcriptional activator ligand binding domain protein  32.28 
 
 		 158 aa  57.8  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0354767  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0754  transcription activator, effector binding  32.08 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.287281  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4607  transcription activator, effector binding  31.55 
 
 		 156 aa  53.9  0.0000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0684789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2214  transcriptional activator ligand binding domain protein  30.28 
 
 		 210 aa  48.5  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.307481  normal  0.371698 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1364  hypothetical protein  25.16 
 
 		 152 aa  47.4  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.33275  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0853  transcriptional regulator, AraC family  37.5 
 
 		 284 aa  45.1  0.0004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6884  transcriptional regulator, AraC family  30 
 
 		 301 aa  45.1  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2087  transcription activator effector binding  28.38 
 
 		 166 aa  43.9  0.0009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000102768 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0005  hypothetical protein  25.62 
 
 		 157 aa  43.1  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.251807  normal  0.30014 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0318  transcription activator effector binding  29.51 
 
 		 157 aa  41.2  0.006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.289482 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>