22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1653 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1653  transcriptional activator ligand binding domain protein  100 
 
 		 173 aa  345  2e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0385055  normal  0.0308654 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1132  transcription activator, effector binding  37.35 
 
 		 164 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0263  transcription activator, effector binding protein  37.72 
 
 		 166 aa  105  4e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6627  transcriptional activator ligand binding domain protein  37.72 
 
 		 164 aa  99  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.787104  normal  0.146802 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1123  transcriptional activator ligand binding domain protein  40.34 
 
 		 177 aa  90.5  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4913  transcriptional activator ligand binding domain protein  32.34 
 
 		 164 aa  79.7  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00232908  normal  0.22679 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6173  transcriptional activator ligand binding domain protein  36.16 
 
 		 158 aa  76.3  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0354767  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20280  transcriptional regulator, effector-binding domain/component  33.58 
 
 		 167 aa  62.4  0.000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0307549  normal  0.329792 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4607  transcription activator, effector binding  32 
 
 		 156 aa  54.7  0.0000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0684789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0513  transcription activator, effector binding  29.31 
 
 		 268 aa  50.8  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.482512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0345  transcription activator effector binding  24.4 
 
 		 156 aa  50.1  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0754  transcription activator, effector binding  29.32 
 
 		 156 aa  48.9  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.287281  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2214  transcriptional activator ligand binding domain protein  30.22 
 
 		 210 aa  49.3  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.307481  normal  0.371698 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6884  transcriptional regulator, AraC family  28.75 
 
 		 301 aa  48.1  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2087  transcription activator effector binding  27.78 
 
 		 166 aa  47.4  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000102768 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0358  transcription activator, effector binding  30.97 
 
 		 243 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.923721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0250  transcription activator effector binding  26.67 
 
 		 260 aa  44.7  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.495724  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4179  transcriptional activator ligand binding domain protein  37.78 
 
 		 279 aa  43.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.803381 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0318  transcription activator effector binding  22.02 
 
 		 157 aa  42.7  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.289482 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1364  hypothetical protein  20.5 
 
 		 152 aa  43.5  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.33275  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0005  hypothetical protein  26.52 
 
 		 157 aa  42  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.251807  normal  0.30014 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2813  hypothetical protein  33.8 
 
 		 111 aa  40.8  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.239957  normal  0.0833184 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>