18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_22660 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012803  Mlut_22660  transcriptional regulator, effector-binding domain/component  100 
 
 		 168 aa  332  2e-90  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28460  transcriptional regulator, effector-binding domain/component  39.74 
 
 		 176 aa  92.4  3e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.19805  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2087  transcription activator effector binding  40.67 
 
 		 166 aa  84.3  6e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000102768 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0754  transcription activator, effector binding  36.08 
 
 		 156 aa  79  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.287281  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3492  transcriptional activator ligand binding domain protein  39.86 
 
 		 155 aa  78.2  0.00000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6173  transcriptional activator ligand binding domain protein  34.62 
 
 		 158 aa  77.4  0.00000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0354767  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1364  hypothetical protein  28.57 
 
 		 152 aa  60.1  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.33275  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4607  transcription activator, effector binding  31.65 
 
 		 156 aa  57.4  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0684789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0304  transcription activator, effector binding  26.43 
 
 		 158 aa  52.4  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1132  transcription activator, effector binding  37.5 
 
 		 164 aa  49.3  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0318  transcription activator effector binding  22.98 
 
 		 157 aa  48.1  0.00005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.289482 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0345  transcription activator effector binding  23.31 
 
 		 156 aa  46.6  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6884  transcriptional regulator, AraC family  28.67 
 
 		 301 aa  46.2  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2214  transcriptional activator ligand binding domain protein  34.62 
 
 		 210 aa  45.8  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.307481  normal  0.371698 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0684  MerR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 279 aa  45.1  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3920  transcription activator, effector binding  30.5 
 
 		 161 aa  44.3  0.0009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1653  transcriptional activator ligand binding domain protein  30.99 
 
 		 173 aa  43.5  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0385055  normal  0.0308654 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0263  transcription activator, effector binding protein  28.81 
 
 		 166 aa  42.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>