16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4616 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4616  transcriptional activator ligand binding domain protein  100 
 
 		 153 aa  312  9.999999999999999e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.189304 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2777  transcription activator, effector binding  26.53 
 
 		 242 aa  48.9  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0772774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0345  transcription activator effector binding  22.76 
 
 		 156 aa  46.6  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0593  transcription activator, effector binding  20.69 
 
 		 153 aa  44.7  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2087  transcription activator effector binding  31.43 
 
 		 166 aa  44.3  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000102768 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3576  transcription activator, effector binding  25.69 
 
 		 242 aa  43.9  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0358  transcription activator, effector binding  30.84 
 
 		 243 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.923721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0250  transcription activator effector binding  24.66 
 
 		 260 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.495724  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4131  transcriptional activator ligand binding domain protein  23.85 
 
 		 154 aa  43.5  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0304  transcription activator, effector binding  22.45 
 
 		 158 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0318  transcription activator effector binding  29.17 
 
 		 157 aa  42.7  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.289482 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2159  MerR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 265 aa  42  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2459  transcriptional activator ligand binding domain protein  36.47 
 
 		 550 aa  42.4  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000187562  normal  0.0403698 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1132  transcription activator, effector binding  28.57 
 
 		 164 aa  41.2  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0371  hypothetical protein  27.42 
 
 		 240 aa  40.8  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.548098  normal  0.611025 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0513  transcription activator, effector binding  28.24 
 
 		 268 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.482512  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>