56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3847 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_3847  transcriptional activator ligand binding domain protein  100 
 
 		 148 aa  299  9e-81  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3263  transcription activator effector binding  45.64 
 
 		 151 aa  150  4e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4810  transcription activator effector binding  29.3 
 
 		 274 aa  69.3  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.858088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0385  transcription activator, effector binding  29.87 
 
 		 286 aa  64.7  0.0000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1231  transcription activator effector binding  30.13 
 
 		 155 aa  63.9  0.0000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0816033 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3560  MerR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 287 aa  62.8  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.453881 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3506  transcription activator, effector binding  27.39 
 
 		 274 aa  62.8  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.771694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3825  transcriptional activator ligand binding domain protein  32.53 
 
 		 280 aa  60.8  0.000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3503  transcriptional regulator, putative  37.74 
 
 		 273 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.590051  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0318  transcription activator effector binding  30.28 
 
 		 157 aa  58.5  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.289482 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2895  transcriptional regulator, MerR family  31.21 
 
 		 269 aa  58.9  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0684  MerR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 279 aa  57.4  0.00000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0010  hypothetical protein  33.87 
 
 		 270 aa  57.4  0.00000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3205  MerR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 273 aa  53.1  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.208736  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3493  transcriptional regulator, MerR family  32.09 
 
 		 273 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2317  MerR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 269 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0566035  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2581  transcriptional regulator, putative  27.22 
 
 		 212 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0799223  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2598  transcriptional regulator, MerR family  36.04 
 
 		 271 aa  52  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000630559  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3611  transcriptional regulator, MerR family  27.03 
 
 		 267 aa  51.6  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2576  MerR family transcriptional regulator  25 
 
 		 269 aa  51.2  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.473387  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2401  MerR family transcriptional regulator  25 
 
 		 269 aa  51.2  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.908212  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2588  transcriptional regulator, MerR family  25.95 
 
 		 269 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.40806e-18 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2354  MerR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 269 aa  50.8  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000403249  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2630  transcriptional regulator, MerR family  25.95 
 
 		 269 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00281071  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0345  transcription activator effector binding  27.01 
 
 		 156 aa  50.4  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1206  transcription activator, effector binding  32.17 
 
 		 132 aa  50.4  0.000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2780  transcriptional regulator, MerR family  25.64 
 
 		 269 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000880145 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2545  transcriptional regulator, MerR family  25.64 
 
 		 269 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1820  MerR family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 270 aa  49.3  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.404333  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6982  MerR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 270 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0754  transcription activator, effector binding  26.61 
 
 		 156 aa  48.9  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.287281  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1754  transcriptional regulator, MerR family  38.04 
 
 		 257 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.99712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5047  MerR family transcriptional regulator  24.81 
 
 		 276 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.574995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2087  transcription activator effector binding  25.2 
 
 		 166 aa  47.4  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000102768 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2735  putative transcriptional regulator, MerR family  26.72 
 
 		 264 aa  47.4  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0721242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0250  transcription activator effector binding  25.17 
 
 		 260 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.495724  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0371  hypothetical protein  32 
 
 		 240 aa  46.2  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.548098  normal  0.611025 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0358  transcription activator, effector binding  25.17 
 
 		 243 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.923721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3507  MerR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 292 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.401792  normal  0.0867153 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0304  transcription activator, effector binding  24.29 
 
 		 158 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3830  transcriptional regulator, MerR family  33.02 
 
 		 274 aa  45.8  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6884  transcriptional regulator, AraC family  27.56 
 
 		 301 aa  46.2  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4607  transcription activator, effector binding  27.19 
 
 		 156 aa  45.4  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0684789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1361  transcriptional regulator, MerR family  27.1 
 
 		 314 aa  45.1  0.0004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000180624  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2481  transcriptional regulator, MerR family  31.3 
 
 		 269 aa  44.7  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.564945  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3767  transcriptional regulator, MerR family  23.58 
 
 		 264 aa  44.3  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.237591  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0216  transcription activator, effector binding  33.72 
 
 		 252 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.05327  hitchhiker  0.00731322 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1974  transcriptional regulator, MerR family  31.52 
 
 		 283 aa  42.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00000269645  unclonable  0.0000000367636 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2529  transcriptional regulator, MerR family  28.07 
 
 		 270 aa  42.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0593  transcription activator, effector binding  28.45 
 
 		 153 aa  42.4  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2324  hypothetical protein  26.32 
 
 		 321 aa  42  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0188345  normal  0.69843 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4179  transcriptional activator ligand binding domain protein  35.62 
 
 		 279 aa  41.2  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.803381 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4099  transcription activator effector binding protein  25.6 
 
 		 276 aa  40.8  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3576  transcription activator, effector binding  29.33 
 
 		 242 aa  40.8  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1851  transcription activator effector binding  28.4 
 
 		 241 aa  40.4  0.007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.493771 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03030  predicted transcriptional regulator  32.05 
 
 		 276 aa  40  0.01  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>