More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2735 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2735  putative transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 264 aa  517  1e-146  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0721242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2529  transcriptional regulator, MerR family  73.76 
 
 		 270 aa  365  1e-100  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6982  MerR family transcriptional regulator  63.88 
 
 		 270 aa  330  2e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3507  MerR family transcriptional regulator  60.84 
 
 		 292 aa  317  1e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.401792  normal  0.0867153 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5047  MerR family transcriptional regulator  59.32 
 
 		 276 aa  304  7e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.574995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2808  transcriptional regulator, MerR family  51.52 
 
 		 276 aa  235  6e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.44001  normal  0.316047 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7266  transcriptional regulator, MerR family  49.07 
 
 		 274 aa  234  1.0000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4623  transcriptional regulator, MerR family  45.04 
 
 		 297 aa  200  1.9999999999999998e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4163  transcriptional regulator, MerR family  40.37 
 
 		 275 aa  190  2e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0932  MerR family transcriptional regulator  39.63 
 
 		 290 aa  187  1e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3767  transcriptional regulator, MerR family  39.08 
 
 		 264 aa  144  1e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.237591  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0225  putative transcriptional regulator, MerR family  38.58 
 
 		 262 aa  120  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4799  transcriptional regulator, MerR family  36.4 
 
 		 258 aa  112  5e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4810  transcription activator effector binding  30.88 
 
 		 274 aa  110  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.858088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2638  transcriptional regulator, MerR family  30.4 
 
 		 273 aa  102  5e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3506  transcription activator, effector binding  29.2 
 
 		 274 aa  102  9e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.771694  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2317  MerR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 269 aa  101  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0566035  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1820  MerR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 270 aa  101  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.404333  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2401  MerR family transcriptional regulator  24.72 
 
 		 269 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.908212  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2576  MerR family transcriptional regulator  24.72 
 
 		 269 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.473387  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2545  transcriptional regulator, MerR family  24.35 
 
 		 269 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2780  transcriptional regulator, MerR family  24.35 
 
 		 269 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000880145 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0684  MerR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 279 aa  98.2  1e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3205  MerR family transcriptional regulator  24.36 
 
 		 273 aa  96.7  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.208736  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3493  transcriptional regulator, MerR family  23.64 
 
 		 273 aa  96.7  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2354  MerR family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 269 aa  96.3  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000403249  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2588  transcriptional regulator, MerR family  25.19 
 
 		 269 aa  96.3  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.40806e-18 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4179  transcriptional activator ligand binding domain protein  33.33 
 
 		 279 aa  95.9  5e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.803381 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3503  transcriptional regulator, putative  24 
 
 		 273 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.590051  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2630  transcriptional regulator, MerR family  24.07 
 
 		 269 aa  93.2  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00281071  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2159  MerR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 265 aa  92  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2598  transcriptional regulator, MerR family  24.82 
 
 		 271 aa  86.7  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000630559  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2144  transcriptional regulator, MerR family  24.72 
 
 		 272 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0331  MerR family transcriptional regulator  23.32 
 
 		 281 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3830  transcriptional regulator, MerR family  24.26 
 
 		 274 aa  82  0.000000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3611  transcriptional regulator, MerR family  21.98 
 
 		 267 aa  81.3  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4099  transcription activator effector binding protein  29.93 
 
 		 276 aa  80.1  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0247  MerR family transcriptional regulator  30 
 
 		 287 aa  79  0.00000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0385  transcription activator, effector binding  30.32 
 
 		 286 aa  79  0.00000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2305  transcriptional regulator, MerR family  30.5 
 
 		 268 aa  78.6  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.643594 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1731  MerR family transcriptional regulator  22.1 
 
 		 276 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.867101  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7229  putative transcriptional regulator, MerR family  32.16 
 
 		 272 aa  78.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.385629 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3560  MerR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 287 aa  77.4  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.453881 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1523  MerR family transcriptional regulator  22.58 
 
 		 276 aa  77  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.193632  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1527  MerR family transcriptional regulator  21.48 
 
 		 276 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1641  MerR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 276 aa  75.5  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1495  MerR family transcriptional regulator  22.26 
 
 		 276 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00542237  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1708  transcriptional regulator, MerR family  22.22 
 
 		 276 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8866  putative transcriptional regulator, MerR family  44.86 
 
 		 279 aa  75.1  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.249264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3667  transcriptional regulator, MerR family  22.63 
 
 		 276 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.372345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1424  MerR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 279 aa  73.9  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.140644 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3833  MerR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 270 aa  74.3  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000100059  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2528  transcriptional regulator, MerR family  30.45 
 
 		 293 aa  72.4  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1677  transcriptional regulator, MerR family  21.74 
 
 		 276 aa  72.4  0.000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128581  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3825  transcriptional activator ligand binding domain protein  25.09 
 
 		 280 aa  72  0.000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03030  predicted transcriptional regulator  26.38 
 
 		 276 aa  71.2  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1993  transcriptional regulator, MerR family  43.9 
 
 		 272 aa  71.6  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5012  MerR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 289 aa  70.9  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.147011  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1782  transcriptional regulator, MerR family  21.61 
 
 		 276 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.381283  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2895  transcriptional regulator, MerR family  24.82 
 
 		 269 aa  70.5  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1485  MerR family transcriptional regulator  22.3 
 
 		 276 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0543962  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2018  putative transcriptional regulator, MerR family  32.62 
 
 		 286 aa  70.1  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.253438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0010  hypothetical protein  25.18 
 
 		 270 aa  69.3  0.00000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2992  transcriptional regulator, MerR family  29.02 
 
 		 282 aa  68.2  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.663692  normal  0.0173107 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1754  transcriptional regulator, MerR family  23.13 
 
 		 257 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.99712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64500  putative transcriptional regulator  39.66 
 
 		 270 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4044  transcriptional regulator, MerR family  28.47 
 
 		 271 aa  66.2  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0218982 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0264  MerR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 250 aa  66.2  0.0000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1582  hypothetical protein  36.19 
 
 		 249 aa  66.2  0.0000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0379  transcriptional regulator, MerR family  37.74 
 
 		 327 aa  65.5  0.0000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0479  MerR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 354 aa  65.5  0.0000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.369084 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0098  MerR family transcriptional regulator  21.32 
 
 		 279 aa  64.7  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000252188  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1629  transcriptional regulator, MerR family  29.82 
 
 		 306 aa  65.1  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0882685  normal  0.393491 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0088  hypothetical protein  38.24 
 
 		 253 aa  65.1  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20290  predicted transcriptional regulator  36.57 
 
 		 277 aa  65.1  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0400625  normal  0.347976 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2311  putative transcriptional regulator, MerR family  37.74 
 
 		 399 aa  64.3  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0323  transcription regulator family  30.97 
 
 		 253 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1701  MerR family transcriptional regulator  24.47 
 
 		 280 aa  63.9  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.126124  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5383  transcriptional regulator, MerR family  43.96 
 
 		 266 aa  63.2  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.94507 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3675  MerR family transcriptional regulator  40.95 
 
 		 270 aa  62.8  0.000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.325472  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1411  hypothetical protein  34.29 
 
 		 250 aa  62  0.000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2419  protein serine/threonine phosphatase  35.16 
 
 		 355 aa  61.2  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.111892 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0445  MerR family transcriptional regulator  20.08 
 
 		 261 aa  60.8  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0194713  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0455  MerR family transcriptional regulator  21.91 
 
 		 261 aa  60.5  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00278493  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22860  predicted transcriptional regulator  32.84 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1410  MerR family transcriptional regulator  20.36 
 
 		 277 aa  60.5  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0980  MerR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 267 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.812542  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1146  transcriptional regulator, MerR family  22.22 
 
 		 267 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2481  transcriptional regulator, MerR family  37.89 
 
 		 269 aa  60.1  0.00000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.564945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19550  serine/threonine protein phosphatase  35.45 
 
 		 361 aa  59.3  0.00000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.17725  normal  0.381768 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18550  predicted transcriptional regulator  39.8 
 
 		 244 aa  58.9  0.00000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1655  MerR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 237 aa  58.5  0.0000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.112658  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0276  MerR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 288 aa  58.5  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000161709  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0993  MerR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 267 aa  57.4  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0978  MerR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 267 aa  58.2  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00933333  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0888  transcriptional regulator, MerR family  42.03 
 
 		 270 aa  57.8  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00108118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1063  MerR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 267 aa  57.4  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2898  transcriptional regulator, MerR family  42.11 
 
 		 282 aa  58.2  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1609  MerR family transcriptional regulator  20.58 
 
 		 272 aa  57.8  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.822901  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5600  putative transcriptional regulator  37.82 
 
 		 270 aa  57  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>