35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_3263 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_3263  transcription activator effector binding  100 
 
 		 151 aa  309  7.999999999999999e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3847  transcriptional activator ligand binding domain protein  45.64 
 
 		 148 aa  150  4e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4810  transcription activator effector binding  26.88 
 
 		 274 aa  65.5  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.858088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3506  transcription activator, effector binding  28.75 
 
 		 274 aa  65.1  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.771694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0250  transcription activator effector binding  29.14 
 
 		 260 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.495724  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0358  transcription activator, effector binding  28.57 
 
 		 243 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.923721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1231  transcription activator effector binding  26.28 
 
 		 155 aa  52.4  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0816033 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0318  transcription activator effector binding  28.8 
 
 		 157 aa  52  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.289482 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0345  transcription activator effector binding  26.81 
 
 		 156 aa  50.1  0.000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6884  transcriptional regulator, AraC family  26.58 
 
 		 301 aa  50.4  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0754  transcription activator, effector binding  28.81 
 
 		 156 aa  50.1  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.287281  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0005  hypothetical protein  26.09 
 
 		 157 aa  48.5  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.251807  normal  0.30014 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3560  MerR family transcriptional regulator  30 
 
 		 287 aa  47.8  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.453881 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0371  hypothetical protein  25.83 
 
 		 240 aa  47  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.548098  normal  0.611025 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0304  transcription activator, effector binding  26.42 
 
 		 158 aa  46.6  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2087  transcription activator effector binding  28.57 
 
 		 166 aa  47  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000102768 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0513  transcription activator, effector binding  29.46 
 
 		 268 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.482512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0385  transcription activator, effector binding  28.3 
 
 		 286 aa  45.4  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3825  transcriptional activator ligand binding domain protein  32.81 
 
 		 280 aa  44.3  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4623  transcriptional regulator, MerR family  26.67 
 
 		 297 aa  44.3  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3920  transcription activator, effector binding  30.26 
 
 		 161 aa  44.3  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1364  hypothetical protein  26.36 
 
 		 152 aa  42.4  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.33275  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0216  transcription activator, effector binding  27.52 
 
 		 252 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.05327  hitchhiker  0.00731322 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2324  hypothetical protein  25.83 
 
 		 321 aa  42.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0188345  normal  0.69843 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2780  transcriptional regulator, MerR family  23.72 
 
 		 269 aa  42  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000880145 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0010  hypothetical protein  27.34 
 
 		 270 aa  41.2  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2545  transcriptional regulator, MerR family  23.72 
 
 		 269 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0225  putative transcriptional regulator, MerR family  30.65 
 
 		 262 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2401  MerR family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 269 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.908212  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2588  transcriptional regulator, MerR family  32.98 
 
 		 269 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.40806e-18 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2576  MerR family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 269 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.473387  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2317  MerR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 269 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0566035  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2354  MerR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 269 aa  41.2  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000403249  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2895  transcriptional regulator, MerR family  26.97 
 
 		 269 aa  40.4  0.009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3576  transcription activator, effector binding  26.92 
 
 		 242 aa  40  0.01  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>