More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0888 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_0888  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 270 aa  558  1e-158  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00108118  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0993  MerR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 267 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1063  MerR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 267 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0978  MerR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 267 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00933333  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0980  MerR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 267 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.812542  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1146  transcriptional regulator, MerR family  30.43 
 
 		 267 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4810  transcription activator effector binding  34.51 
 
 		 274 aa  73.6  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.858088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3506  transcription activator, effector binding  33.93 
 
 		 274 aa  71.6  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.771694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2808  transcriptional regulator, MerR family  41.86 
 
 		 276 aa  72  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.44001  normal  0.316047 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1527  MerR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 276 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1523  MerR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 276 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.193632  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1495  MerR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 276 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00542237  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1485  MerR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 276 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0543962  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1641  MerR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 276 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1708  transcriptional regulator, MerR family  35.58 
 
 		 276 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1731  MerR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 276 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.867101  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1782  transcriptional regulator, MerR family  35.58 
 
 		 276 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.381283  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1677  transcriptional regulator, MerR family  35.58 
 
 		 276 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128581  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3667  transcriptional regulator, MerR family  35.58 
 
 		 276 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.372345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0331  MerR family transcriptional regulator  21.96 
 
 		 281 aa  65.5  0.0000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7266  transcriptional regulator, MerR family  46.97 
 
 		 274 aa  63.9  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3507  MerR family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 292 aa  63.2  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.401792  normal  0.0867153 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2354  MerR family transcriptional regulator  23.44 
 
 		 269 aa  60.8  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000403249  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0379  transcriptional regulator, MerR family  37.5 
 
 		 327 aa  61.2  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2588  transcriptional regulator, MerR family  23.44 
 
 		 269 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.40806e-18 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3825  transcriptional activator ligand binding domain protein  31.07 
 
 		 280 aa  60.1  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0455  MerR family transcriptional regulator  30 
 
 		 261 aa  60.1  0.00000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00278493  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0445  MerR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 261 aa  60.1  0.00000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0194713  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5047  MerR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 276 aa  59.3  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.574995  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2317  MerR family transcriptional regulator  22.92 
 
 		 269 aa  58.9  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0566035  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1739  MerR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 141 aa  58.2  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.784519 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1820  MerR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 270 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.404333  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2144  transcriptional regulator, MerR family  29.57 
 
 		 272 aa  57.8  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64500  putative transcriptional regulator  30.65 
 
 		 270 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4179  transcriptional activator ligand binding domain protein  37.84 
 
 		 279 aa  57.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.803381 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2735  putative transcriptional regulator, MerR family  42.03 
 
 		 264 aa  57.8  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0721242  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1629  transcriptional regulator, MerR family  42.25 
 
 		 306 aa  57  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0882685  normal  0.393491 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6982  MerR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 270 aa  56.6  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0247  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 287 aa  56.2  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3833  MerR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 270 aa  56.2  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000100059  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2529  transcriptional regulator, MerR family  39.19 
 
 		 270 aa  56.2  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3560  MerR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 287 aa  55.8  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.453881 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0226  transcriptional regulator, MerR family  32.88 
 
 		 276 aa  55.8  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000814651  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4623  transcriptional regulator, MerR family  42.03 
 
 		 297 aa  55.8  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2494  transcriptional regulator, MerR family  31.25 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.453842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3620  transcriptional regulator, MerR family  31.25 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2545  transcriptional regulator, MerR family  25.38 
 
 		 269 aa  55.5  0.0000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2780  transcriptional regulator, MerR family  25.38 
 
 		 269 aa  55.5  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000880145 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2895  transcriptional regulator, MerR family  46.3 
 
 		 269 aa  54.7  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2528  transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 		 293 aa  55.5  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2263  transcriptional regulator, MerR family  26.39 
 
 		 281 aa  54.7  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1915  MerR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 136 aa  54.7  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0245  transcriptional regulator, MerR family  25.33 
 
 		 256 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00512795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13400  predicted transcriptional regulator  36.76 
 
 		 346 aa  54.3  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2316  regulatory protein, MerR  37.88 
 
 		 369 aa  54.3  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.280801  normal  0.123157 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2598  transcriptional regulator, MerR family  27.94 
 
 		 271 aa  54.7  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000630559  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5383  transcriptional regulator, MerR family  44.44 
 
 		 266 aa  54.3  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.94507 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2059  transcriptional regulator, MerR family  29.73 
 
 		 145 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.477962 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0323  transcription regulator family  35.9 
 
 		 253 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2401  MerR family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 269 aa  53.5  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.908212  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1357  MerR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 342 aa  53.9  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.744828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2576  MerR family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 269 aa  53.5  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.473387  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16760  predicted transcriptional regulator  35.16 
 
 		 306 aa  53.5  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.342499  normal  0.498002 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1395  MerR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 146 aa  53.9  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.686505  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0479  MerR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 354 aa  53.5  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.369084 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2831  MerR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 175 aa  53.5  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.116752 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4799  transcriptional regulator, MerR family  43.08 
 
 		 258 aa  53.5  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0225  putative transcriptional regulator, MerR family  29.41 
 
 		 262 aa  53.5  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3304  MCP methyltransferase, CheR-type  27.64 
 
 		 398 aa  53.5  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2638  transcriptional regulator, MerR family  26.72 
 
 		 273 aa  53.1  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0442  transcriptional regulator, MerR family  31.53 
 
 		 132 aa  52.8  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.856657  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1595  putative heavy metal regulator HmrR  26.96 
 
 		 137 aa  53.1  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1993  transcriptional regulator, MerR family  39.68 
 
 		 272 aa  52.8  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0303  transcriptional regulator, MerR family  43.24 
 
 		 154 aa  52.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00540997  normal  0.988288 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3623  MerR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 142 aa  52.8  0.000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3961  MerR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 142 aa  52.8  0.000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.146237  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5280  transcriptional regulator CadR  40.58 
 
 		 148 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5012  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 289 aa  52.4  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.147011  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2992  transcriptional regulator, MerR family  34.72 
 
 		 282 aa  51.6  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.663692  normal  0.0173107 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3767  transcriptional regulator, MerR family  33.72 
 
 		 264 aa  52  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.237591  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3105  transcriptional regulator, MerR family  23.97 
 
 		 255 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0154295  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0932  MerR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 290 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20290  predicted transcriptional regulator  37.14 
 
 		 277 aa  51.2  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0400625  normal  0.347976 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3434  MerR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 128 aa  50.8  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.87421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1609  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 272 aa  50.8  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.822901  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2159  MerR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 265 aa  50.8  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4163  transcriptional regulator, MerR family  31.33 
 
 		 275 aa  51.2  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16670  putative transcriptional regulator CadR  39.13 
 
 		 156 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0385  transcription activator, effector binding  39.73 
 
 		 286 aa  50.8  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3611  transcriptional regulator, MerR family  36.23 
 
 		 267 aa  51.2  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4838  regulatory protein, MerR  40.58 
 
 		 148 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5545  MerR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 139 aa  50.8  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.71393 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7229  putative transcriptional regulator, MerR family  29.92 
 
 		 272 aa  50.4  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.385629 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4226  MerR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 150 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.795335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4099  transcription activator effector binding protein  30.97 
 
 		 276 aa  50.4  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5255  MerR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 128 aa  50.4  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107337  normal  0.171715 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2241  MerR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 134 aa  50.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.388969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2402  transcriptional regulator, MerR family  46.15 
 
 		 272 aa  50.1  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.290341  hitchhiker  0.00583984 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1449  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  39.13 
 
 		 156 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4214  putative transcriptional regulator, MerR family  32.47 
 
 		 319 aa  50.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.290445  hitchhiker  0.000447036 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>