282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_16760 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_16760  predicted transcriptional regulator  100 
 
 		 306 aa  633  1e-180  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.342499  normal  0.498002 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0993  MerR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 267 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0978  MerR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 267 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00933333  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0980  MerR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 267 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.812542  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1063  MerR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 267 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1146  transcriptional regulator, MerR family  36.54 
 
 		 267 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4163  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 275 aa  67.8  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0226  transcriptional regulator, MerR family  42.35 
 
 		 276 aa  65.9  0.0000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000814651  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1609  MerR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 272 aa  65.9  0.0000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.822901  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1523  MerR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 276 aa  62.8  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.193632  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1708  transcriptional regulator, MerR family  33.65 
 
 		 276 aa  62.8  0.000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1641  MerR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 276 aa  62.8  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1495  MerR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 276 aa  62.8  0.000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00542237  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1731  MerR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 276 aa  62.4  0.000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.867101  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1485  MerR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 276 aa  62.4  0.000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0543962  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1527  MerR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 276 aa  62.4  0.000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1677  transcriptional regulator, MerR family  33.65 
 
 		 276 aa  62.4  0.000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128581  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0932  MerR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 290 aa  62.4  0.000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1782  transcriptional regulator, MerR family  33.65 
 
 		 276 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.381283  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3667  transcriptional regulator, MerR family  33.65 
 
 		 276 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.372345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6982  MerR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 270 aa  62  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1701  MerR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 280 aa  61.2  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.126124  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3611  transcriptional regulator, MerR family  40.79 
 
 		 267 aa  61.2  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5012  MerR family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 289 aa  59.7  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.147011  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5047  MerR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 276 aa  59.7  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.574995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3506  transcription activator, effector binding  31.65 
 
 		 274 aa  59.3  0.00000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.771694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2529  transcriptional regulator, MerR family  31.15 
 
 		 270 aa  59.3  0.00000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3507  MerR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 292 aa  59.3  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.401792  normal  0.0867153 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0323  transcription regulator family  39.73 
 
 		 253 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4810  transcription activator effector binding  36.78 
 
 		 274 aa  58.5  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.858088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1458  MerR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 161 aa  57.4  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0168574  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3620  transcriptional regulator, MerR family  37.36 
 
 		 148 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0445  MerR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 261 aa  57.4  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0194713  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1866  transcriptional regulator  37.63 
 
 		 247 aa  57.4  0.0000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000190425  hitchhiker  0.000000000849298 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2494  transcriptional regulator, MerR family  37.36 
 
 		 148 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.453842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0455  MerR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 261 aa  57  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00278493  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0331  MerR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 281 aa  56.6  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0065  transcriptional regulator, MerR family  44.93 
 
 		 252 aa  56.6  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3833  MerR family transcriptional regulator  32 
 
 		 270 aa  56.2  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000100059  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2735  putative transcriptional regulator, MerR family  30.88 
 
 		 264 aa  55.8  0.0000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0721242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2144  transcriptional regulator, MerR family  23.68 
 
 		 272 aa  55.1  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2895  transcriptional regulator, MerR family  37.35 
 
 		 269 aa  55.5  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2808  transcriptional regulator, MerR family  33.91 
 
 		 276 aa  55.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.44001  normal  0.316047 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0247  MerR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 287 aa  55.1  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1663  MerR family transcriptional regulator  26.69 
 
 		 343 aa  54.7  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350781  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2898  transcriptional regulator, MerR family  34.74 
 
 		 282 aa  54.3  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2992  transcriptional regulator, MerR family  29.01 
 
 		 282 aa  54.3  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.663692  normal  0.0173107 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2528  transcriptional regulator, MerR family  32.14 
 
 		 293 aa  53.9  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0225  putative transcriptional regulator, MerR family  42.25 
 
 		 262 aa  54.3  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0888  transcriptional regulator, MerR family  35.16 
 
 		 270 aa  53.5  0.000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00108118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19550  serine/threonine protein phosphatase  36.27 
 
 		 361 aa  53.5  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.17725  normal  0.381768 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7266  transcriptional regulator, MerR family  29.93 
 
 		 274 aa  53.5  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4099  transcription activator effector binding protein  34.82 
 
 		 276 aa  53.5  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4916  multidrug-efflux transporter 1 regulator  40 
 
 		 64 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5383  transcriptional regulator, MerR family  35.87 
 
 		 266 aa  53.1  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.94507 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1008  MerR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 253 aa  53.1  0.000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1517  MerR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 342 aa  52.4  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0010  hypothetical protein  40.54 
 
 		 270 aa  52.8  0.000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1629  transcriptional regulator, MerR family  37.08 
 
 		 306 aa  52.4  0.000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0882685  normal  0.393491 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1777  MerR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 145 aa  52.4  0.000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2718  transcriptional regulator, MerR family  38.16 
 
 		 150 aa  52.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.654055  hitchhiker  0.0000347436 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0088  hypothetical protein  34.12 
 
 		 253 aa  52  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5038  MerR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 342 aa  52.4  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1755  MerR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 342 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.581641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6337  MerR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 342 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0079  transcriptional regulator  40.28 
 
 		 120 aa  52.4  0.00001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1742  MerR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 342 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1663  MerR family transcriptional regulator  26.69 
 
 		 343 aa  52.4  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2780  transcriptional regulator, MerR family  31.52 
 
 		 269 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000880145 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2322  transcriptional regulator, MerR family  36.17 
 
 		 129 aa  51.2  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1582  hypothetical protein  32.73 
 
 		 249 aa  51.2  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2545  transcriptional regulator, MerR family  31.52 
 
 		 269 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4179  transcriptional activator ligand binding domain protein  31.53 
 
 		 279 aa  51.6  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.803381 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0760  MerR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 267 aa  51.6  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0248072  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0275  transcriptional regulator, MerR family  30.63 
 
 		 107 aa  51.6  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.524855  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2419  protein serine/threonine phosphatase  43.28 
 
 		 355 aa  50.8  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.111892 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06160  serine/threonine protein phosphatase  43.75 
 
 		 361 aa  50.8  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2059  transcriptional regulator, MerR family  34.62 
 
 		 145 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.477962 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1993  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 272 aa  50.8  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6360  transcriptional regulator, MerR family  41.67 
 
 		 152 aa  50.1  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4237  MerR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 136 aa  50.1  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.428618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2402  transcriptional regulator, MerR family  51.11 
 
 		 272 aa  49.7  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.290341  hitchhiker  0.00583984 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1352  transcriptional regulator, MerR family  28.7 
 
 		 288 aa  49.7  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0877122  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4350  transcriptional regulator, MerR family  37.88 
 
 		 131 aa  49.7  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4209  putative transcriptional regulator, MerR family  35.87 
 
 		 145 aa  49.7  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370014  hitchhiker  0.000986554 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2401  MerR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 269 aa  49.3  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.908212  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2576  MerR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 269 aa  49.3  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.473387  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20290  predicted transcriptional regulator  42.42 
 
 		 277 aa  49.3  0.00009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0400625  normal  0.347976 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1361  transcriptional regulator, MerR family  30.43 
 
 		 314 aa  48.5  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000180624  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7229  putative transcriptional regulator, MerR family  34.29 
 
 		 272 aa  48.5  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.385629 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4873  MerR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 141 aa  48.5  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.825064 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4623  transcriptional regulator, MerR family  36.76 
 
 		 297 aa  48.9  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4471  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  36.46 
 
 		 145 aa  48.5  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00882257 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3184  transcriptional regulator, MerR family  36 
 
 		 142 aa  48.5  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2630  transcriptional regulator, MerR family  30.43 
 
 		 269 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00281071  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2316  regulatory protein, MerR  39.06 
 
 		 369 aa  48.9  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.280801  normal  0.123157 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4523  MerR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 149 aa  48.5  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4498  MerR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 129 aa  48.1  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.119505  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06140  predicted transcriptional regulator  32.11 
 
 		 129 aa  48.5  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25610  predicted transcriptional regulator  32.11 
 
 		 129 aa  48.5  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>