244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1717 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1717  regulatory protein MerR  100 
 
 		 201 aa  402  1e-111  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.212526  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1564  hypothetical protein  44.04 
 
 		 215 aa  164  1.0000000000000001e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.20655  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0658  hypothetical protein  44.04 
 
 		 215 aa  164  1.0000000000000001e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1118  Resolvase domain protein  41.71 
 
 		 229 aa  161  7e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220769  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0272  Resolvase domain protein  41.21 
 
 		 229 aa  159  2e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000593088  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3324  resolvase domain-containing protein  44.57 
 
 		 197 aa  160  2e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.296266  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0744  Resolvase domain protein  40.7 
 
 		 229 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000124642  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0948  site-specific integrase/resolvase  44.57 
 
 		 209 aa  148  5e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.531266  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0465  resolvase-like protein  40.91 
 
 		 219 aa  137  1e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.123984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3670  DNA binding domain-containing protein  41.84 
 
 		 201 aa  133  1.9999999999999998e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.635315  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2574  DNA binding domain protein, excisionase family  43.96 
 
 		 194 aa  131  6e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.235149  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1710  resolvase domain-containing protein  35.71 
 
 		 222 aa  131  6e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0131  DNA binding domain protein, excisionase family  35.42 
 
 		 216 aa  125  3e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000948008  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0122  DNA binding domain protein, excisionase family  35.42 
 
 		 216 aa  125  3e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2645  DNA binding domain protein, excisionase family  44.32 
 
 		 192 aa  125  4.0000000000000003e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0390  DNA binding domain protein, excisionase family  35.94 
 
 		 216 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0112175  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0754  Resolvase domain protein  38.42 
 
 		 207 aa  125  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0911  DNA binding domain protein, excisionase family  43.78 
 
 		 192 aa  124  7e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.00000302589  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1190  DNA binding domain protein, excisionase family  34.9 
 
 		 216 aa  124  7e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0895  DNA binding domain protein, excisionase family  44.32 
 
 		 192 aa  124  1e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1513  DNA binding domain protein, excisionase family  40.33 
 
 		 213 aa  124  1e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2716  DNA binding domain protein, excisionase family  40.33 
 
 		 213 aa  124  1e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00788025  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2443  DNA binding domain protein, excisionase family  40.93 
 
 		 193 aa  123  2e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.453884  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0941  resolvase domain-containing protein  38.92 
 
 		 208 aa  123  2e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0143335  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1111  DNA binding domain-containing protein  40.33 
 
 		 215 aa  123  2e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.385151  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2150  DNA binding domain protein, excisionase family  43.78 
 
 		 195 aa  121  7e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0522  DNA binding domain protein, excisionase family  32.81 
 
 		 244 aa  121  9e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0170413  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0818  DNA binding domain protein, excisionase family  34.38 
 
 		 216 aa  120  9.999999999999999e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0484  DNA binding domain protein, excisionase family  33.85 
 
 		 216 aa  120  9.999999999999999e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.114276  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1219  DNA binding domain protein, excisionase family  32.14 
 
 		 201 aa  118  6e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1070  resolvase domain-containing protein  38.07 
 
 		 197 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.709621  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2048  Resolvase domain protein  42.16 
 
 		 193 aa  115  3.9999999999999997e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0322526  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0947  Resolvase domain protein  33.88 
 
 		 195 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000151254  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1449  Resolvase domain protein  33.88 
 
 		 207 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0392946  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1304  transposon resolvase  32.28 
 
 		 209 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0311544  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3893  DNA binding domain protein, excisionase family  31.03 
 
 		 203 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1808  DNA binding domain protein, excisionase family  33.99 
 
 		 219 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3943  DNA binding domain protein, excisionase family  31.03 
 
 		 203 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000130893  normal  0.0337021 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2002  regulatory protein, MerR  43.75 
 
 		 148 aa  110  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0785  Resolvase domain protein  35.23 
 
 		 202 aa  109  3e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00525149  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2781  Resolvase domain protein  35.32 
 
 		 222 aa  108  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.912906 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1174  DNA binding domain protein, excisionase family  34.72 
 
 		 219 aa  108  5e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.122691  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1911  DNA binding domain-containing protein  35.15 
 
 		 216 aa  108  5e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0851  regulatory protein MerR  36.22 
 
 		 222 aa  108  7.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1270  Resolvase domain protein  34.43 
 
 		 195 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0236  Resolvase domain protein  32.79 
 
 		 195 aa  107  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000223632  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0751  Resolvase domain protein  34.83 
 
 		 209 aa  106  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1241  Resolvase domain protein  34.52 
 
 		 222 aa  105  5e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0456632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1220  DNA binding domain protein, excisionase family  31.12 
 
 		 201 aa  105  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2393  DNA binding domain protein, excisionase family  37.31 
 
 		 191 aa  105  7e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1913  Resolvase domain protein  33.33 
 
 		 208 aa  99.4  3e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2194  Resolvase domain protein  31.91 
 
 		 208 aa  97.1  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.72008  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2935  Resolvase domain protein  33.51 
 
 		 206 aa  96.3  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1000  Resolvase domain protein  33.51 
 
 		 206 aa  96.3  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0589477 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2513  Resolvase domain protein  32 
 
 		 195 aa  87.4  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2000  DNA binding domain protein, excisionase family  29.56 
 
 		 212 aa  86.7  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.27976  normal  0.357405 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1218  resolvase domain protein  27.62 
 
 		 205 aa  84.7  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1191  Resolvase domain protein  26.52 
 
 		 205 aa  82.8  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2683  resolvase-like protein  28.19 
 
 		 190 aa  77  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.300522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1033  transposon resolvase  33.58 
 
 		 204 aa  73.9  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.412274  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1105  transposon resolvase  28.04 
 
 		 196 aa  73.9  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.600674  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1224  putative site-specific integrase-resolvase  32.03 
 
 		 197 aa  71.6  0.000000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.997311  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0842  resolvase domain-containing protein  30 
 
 		 196 aa  69.3  0.00000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5676  resolvase domain-containing protein  27.47 
 
 		 190 aa  68.9  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0684  resolvase domain-containing protein  27.47 
 
 		 190 aa  68.9  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.245344 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3431  resolvase-like protein  26.37 
 
 		 197 aa  68.6  0.00000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5986  resolvase domain-containing protein  31.4 
 
 		 162 aa  65.9  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00224994  normal  0.0280728 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12805  resolvase  29.23 
 
 		 193 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00189559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10939  resolvase  26.52 
 
 		 193 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12994  resolvase  27.69 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000478883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1614  resolvase domain-containing protein  27.84 
 
 		 182 aa  59.3  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00182311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10616  resolvase  26.06 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000496522  normal  0.221326 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4668  resolvase domain-containing protein  34.59 
 
 		 189 aa  57  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4775  resolvase domain-containing protein  34.59 
 
 		 189 aa  57  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1891  transposase OrfA  40.98 
 
 		 74 aa  53.1  0.000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2258  resolvase domain-containing protein  40.98 
 
 		 74 aa  52.8  0.000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.216039  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3839  zinc-responsive transcriptional regulator  39.29 
 
 		 171 aa  49.3  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.231012 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4035  zinc-responsive transcriptional regulator  39.29 
 
 		 176 aa  49.3  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0421  zinc-responsive transcriptional regulator  39.29 
 
 		 176 aa  49.3  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3912  zinc-responsive transcriptional regulator  39.29 
 
 		 171 aa  49.3  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3445  site-specific recombinase  32.82 
 
 		 218 aa  48.9  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3396  site-specific recombinase  32.82 
 
 		 218 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3707  site-specific recombinase, resolvase family  32.82 
 
 		 218 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000349891 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8866  putative transcriptional regulator, MerR family  39.71 
 
 		 279 aa  48.9  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.249264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0445  zinc-responsive transcriptional regulator  39.29 
 
 		 159 aa  48.5  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.261357 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3726  resolvase family site-specific recombinase  32.82 
 
 		 218 aa  48.5  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3749  site-specific recombinase, resolvase family  32.82 
 
 		 218 aa  48.5  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.016515  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1517  site-specific recombinase, resolvase family  32.82 
 
 		 218 aa  48.5  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.114467 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3798  site-specific recombinase, resolvase family  32.82 
 
 		 218 aa  48.5  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3400  zinc-responsive transcriptional regulator  39.29 
 
 		 156 aa  48.5  0.00007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1820  MerR family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 270 aa  47.8  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.404333  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3480  resolvase family site-specific recombinase  32.82 
 
 		 218 aa  47.8  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3753  resolvase family site-specific recombinase  32.82 
 
 		 218 aa  47.8  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3376  resolvase domain-containing protein  30.53 
 
 		 218 aa  47.8  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.127652  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7693  transcriptional regulator MerR family  43.48 
 
 		 271 aa  47.4  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.56372  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13862  resolvase  25.58 
 
 		 203 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4678  MerR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 276 aa  47.8  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.825044  normal  0.111013 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0445  MerR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 261 aa  46.6  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0194713  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0446  zinc-responsive transcriptional regulator  37.5 
 
 		 157 aa  47  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3583  zinc-responsive transcriptional regulator  37.5 
 
 		 157 aa  47  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>