79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12994 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_12994  resolvase  100 
 
 		 194 aa  392  1e-108  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000478883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10616  resolvase  81.44 
 
 		 202 aa  295  4e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000496522  normal  0.221326 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12805  resolvase  82.58 
 
 		 193 aa  292  2e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00189559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13862  resolvase  74.86 
 
 		 203 aa  267  8e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2683  resolvase-like protein  71.67 
 
 		 190 aa  243  9e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.300522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5676  resolvase domain-containing protein  71.35 
 
 		 190 aa  235  4e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0684  resolvase domain-containing protein  71.35 
 
 		 190 aa  235  4e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.245344 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3431  resolvase-like protein  67.25 
 
 		 197 aa  225  3e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1614  resolvase domain-containing protein  65.43 
 
 		 182 aa  202  3e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00182311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2513  Resolvase domain protein  53.4 
 
 		 195 aa  201  7e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12900  resolvase  69.19 
 
 		 295 aa  200  9.999999999999999e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0601752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10939  resolvase  56.08 
 
 		 193 aa  198  3e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5986  resolvase domain-containing protein  70.62 
 
 		 162 aa  194  1e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00224994  normal  0.0280728 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1105  transposon resolvase  51.05 
 
 		 196 aa  185  4e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.600674  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1224  putative site-specific integrase-resolvase  45.64 
 
 		 197 aa  164  5e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.997311  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2776  putative resolvase  71.58 
 
 		 116 aa  143  2e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.481265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1033  transposon resolvase  34.39 
 
 		 204 aa  107  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.412274  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1513  DNA binding domain protein, excisionase family  31.98 
 
 		 213 aa  103  1e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2716  DNA binding domain protein, excisionase family  31.98 
 
 		 213 aa  103  1e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00788025  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1000  Resolvase domain protein  32.98 
 
 		 206 aa  102  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0589477 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2935  Resolvase domain protein  32.98 
 
 		 206 aa  102  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1425  putative resolvase  49.18 
 
 		 126 aa  101  8e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1111  DNA binding domain-containing protein  30 
 
 		 215 aa  100  1e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.385151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0272  Resolvase domain protein  36.23 
 
 		 229 aa  97.1  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000593088  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1118  Resolvase domain protein  36.54 
 
 		 229 aa  95.5  4e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220769  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1710  resolvase domain-containing protein  31.75 
 
 		 222 aa  95.5  5e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0744  Resolvase domain protein  36.06 
 
 		 229 aa  92  4e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000124642  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0948  site-specific integrase/resolvase  38.35 
 
 		 209 aa  92  5e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.531266  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0236  Resolvase domain protein  36.88 
 
 		 195 aa  91.3  8e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000223632  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1564  hypothetical protein  37.59 
 
 		 215 aa  90.5  1e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.20655  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0658  hypothetical protein  37.59 
 
 		 215 aa  90.5  1e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0947  Resolvase domain protein  31.44 
 
 		 195 aa  90.1  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000151254  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2194  Resolvase domain protein  33.67 
 
 		 208 aa  90.1  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.72008  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1241  Resolvase domain protein  31.85 
 
 		 222 aa  88.6  6e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0456632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1449  Resolvase domain protein  35.92 
 
 		 207 aa  87  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0392946  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2645  DNA binding domain protein, excisionase family  32.18 
 
 		 192 aa  87.4  1e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1913  Resolvase domain protein  32.65 
 
 		 208 aa  86.3  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3324  resolvase domain-containing protein  38.1 
 
 		 197 aa  86.3  3e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.296266  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0895  DNA binding domain protein, excisionase family  37.98 
 
 		 192 aa  85.9  3e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0465  resolvase-like protein  31.62 
 
 		 219 aa  85.9  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.123984  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2150  DNA binding domain protein, excisionase family  31.25 
 
 		 195 aa  85.1  5e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2781  Resolvase domain protein  31.06 
 
 		 222 aa  84  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.912906 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0785  Resolvase domain protein  36.3 
 
 		 202 aa  84.3  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00525149  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1070  resolvase domain-containing protein  31.11 
 
 		 197 aa  83.2  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.709621  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1174  DNA binding domain protein, excisionase family  34.48 
 
 		 219 aa  83.6  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.122691  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0751  Resolvase domain protein  30.37 
 
 		 209 aa  82.8  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1808  DNA binding domain protein, excisionase family  34.97 
 
 		 219 aa  82.4  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1911  DNA binding domain-containing protein  33.87 
 
 		 216 aa  82.8  0.000000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0911  DNA binding domain protein, excisionase family  30.11 
 
 		 192 aa  82  0.000000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.00000302589  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0851  regulatory protein MerR  30.3 
 
 		 222 aa  81.6  0.000000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2048  Resolvase domain protein  36.8 
 
 		 193 aa  80.5  0.00000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0322526  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0941  resolvase domain-containing protein  27.42 
 
 		 208 aa  80.9  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0143335  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3670  DNA binding domain-containing protein  31.25 
 
 		 201 aa  80.1  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.635315  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2574  DNA binding domain protein, excisionase family  29.78 
 
 		 194 aa  80.1  0.00000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.235149  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1304  transposon resolvase  31.22 
 
 		 209 aa  79.7  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0311544  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1960  site-specific integrase-resolvase-like  59.46 
 
 		 147 aa  79.7  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.4652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0818  DNA binding domain protein, excisionase family  34.2 
 
 		 216 aa  78.6  0.00000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0754  Resolvase domain protein  27.07 
 
 		 207 aa  78.2  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1270  Resolvase domain protein  28.11 
 
 		 195 aa  77.8  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1426  site-specific integrase-resolvase-like protein  59.02 
 
 		 81 aa  77.4  0.0000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.765769  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0484  DNA binding domain protein, excisionase family  32.64 
 
 		 216 aa  76.6  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.114276  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0390  DNA binding domain protein, excisionase family  33.16 
 
 		 216 aa  76.6  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0112175  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1219  DNA binding domain protein, excisionase family  30.94 
 
 		 201 aa  76.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0131  DNA binding domain protein, excisionase family  32.99 
 
 		 216 aa  76.3  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000948008  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0122  DNA binding domain protein, excisionase family  32.99 
 
 		 216 aa  76.3  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2443  DNA binding domain protein, excisionase family  30.11 
 
 		 193 aa  74.3  0.000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.453884  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2393  DNA binding domain protein, excisionase family  30.68 
 
 		 191 aa  70.1  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0522  DNA binding domain protein, excisionase family  32.09 
 
 		 244 aa  69.7  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0170413  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1190  DNA binding domain protein, excisionase family  31.44 
 
 		 216 aa  69.3  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2000  DNA binding domain protein, excisionase family  27.55 
 
 		 212 aa  67.8  0.00000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.27976  normal  0.357405 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3943  DNA binding domain protein, excisionase family  26.97 
 
 		 203 aa  66.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000130893  normal  0.0337021 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3893  DNA binding domain protein, excisionase family  26.97 
 
 		 203 aa  66.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1717  regulatory protein MerR  27.69 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.212526  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4506  hypothetical protein  70 
 
 		 132 aa  58.5  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2002  regulatory protein, MerR  35.71 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2921  transposase, IS605 OrfB  56.67 
 
 		 249 aa  53.1  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0840725 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1220  DNA binding domain protein, excisionase family  24.58 
 
 		 201 aa  52.4  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0842  resolvase domain-containing protein  33.71 
 
 		 196 aa  50.4  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1891  transposase OrfA  35.09 
 
 		 74 aa  41.6  0.007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>