129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1111 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1111  DNA binding domain-containing protein  100 
 
 		 215 aa  426  1e-119  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.385151  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1513  DNA binding domain protein, excisionase family  88.21 
 
 		 213 aa  387  1e-107  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2716  DNA binding domain protein, excisionase family  88.21 
 
 		 213 aa  387  1e-107  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00788025  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0842  resolvase domain-containing protein  49.03 
 
 		 196 aa  186  3e-46  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1174  DNA binding domain protein, excisionase family  44.75 
 
 		 219 aa  174  7e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.122691  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1808  DNA binding domain protein, excisionase family  46.19 
 
 		 219 aa  174  7e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0484  DNA binding domain protein, excisionase family  44.93 
 
 		 216 aa  172  2.9999999999999996e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.114276  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0122  DNA binding domain protein, excisionase family  45.15 
 
 		 216 aa  172  2.9999999999999996e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0131  DNA binding domain protein, excisionase family  45.15 
 
 		 216 aa  172  2.9999999999999996e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000948008  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0390  DNA binding domain protein, excisionase family  44.93 
 
 		 216 aa  171  5.999999999999999e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0112175  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0818  DNA binding domain protein, excisionase family  45.41 
 
 		 216 aa  171  7.999999999999999e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1911  DNA binding domain-containing protein  44.44 
 
 		 216 aa  169  2e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1190  DNA binding domain protein, excisionase family  44.17 
 
 		 216 aa  168  6e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0522  DNA binding domain protein, excisionase family  43.48 
 
 		 244 aa  167  8e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0170413  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2574  DNA binding domain protein, excisionase family  44.33 
 
 		 194 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.235149  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2645  DNA binding domain protein, excisionase family  43.84 
 
 		 192 aa  163  2.0000000000000002e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0895  DNA binding domain protein, excisionase family  45.7 
 
 		 192 aa  161  7e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1118  Resolvase domain protein  41.59 
 
 		 229 aa  159  4e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220769  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0272  Resolvase domain protein  41.31 
 
 		 229 aa  157  9e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000593088  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2048  Resolvase domain protein  44.09 
 
 		 193 aa  155  3e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0322526  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0911  DNA binding domain protein, excisionase family  44.32 
 
 		 192 aa  155  4e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.00000302589  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2150  DNA binding domain protein, excisionase family  44.86 
 
 		 195 aa  155  4e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2443  DNA binding domain protein, excisionase family  45.7 
 
 		 193 aa  155  4e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.453884  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1913  Resolvase domain protein  43.78 
 
 		 208 aa  154  9e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0744  Resolvase domain protein  40.38 
 
 		 229 aa  151  8.999999999999999e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000124642  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2194  Resolvase domain protein  42.7 
 
 		 208 aa  150  1e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.72008  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1710  resolvase domain-containing protein  40.47 
 
 		 222 aa  148  5e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0941  resolvase domain-containing protein  39.49 
 
 		 208 aa  145  3e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0143335  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2393  DNA binding domain protein, excisionase family  43.78 
 
 		 191 aa  135  5e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3324  resolvase domain-containing protein  39.8 
 
 		 197 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.296266  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1070  resolvase domain-containing protein  41.88 
 
 		 197 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.709621  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0754  Resolvase domain protein  38.97 
 
 		 207 aa  132  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0947  Resolvase domain protein  38.54 
 
 		 195 aa  132  5e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000151254  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0658  hypothetical protein  38.83 
 
 		 215 aa  132  5e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1564  hypothetical protein  38.83 
 
 		 215 aa  132  5e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.20655  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1000  Resolvase domain protein  39.49 
 
 		 206 aa  131  9e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0589477 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2935  Resolvase domain protein  39.49 
 
 		 206 aa  131  9e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0236  Resolvase domain protein  38.54 
 
 		 195 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000223632  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1449  Resolvase domain protein  37.63 
 
 		 207 aa  125  5e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0392946  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0785  Resolvase domain protein  38.74 
 
 		 202 aa  125  6e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00525149  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1717  regulatory protein MerR  40.33 
 
 		 201 aa  123  2e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.212526  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2513  Resolvase domain protein  36.73 
 
 		 195 aa  123  2e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2781  Resolvase domain protein  40.31 
 
 		 222 aa  122  3e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.912906 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1270  Resolvase domain protein  37.04 
 
 		 195 aa  122  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1033  transposon resolvase  37.29 
 
 		 204 aa  121  8e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.412274  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0851  regulatory protein MerR  39.79 
 
 		 222 aa  121  8e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0751  Resolvase domain protein  39.9 
 
 		 209 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1241  Resolvase domain protein  39.38 
 
 		 222 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0456632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3670  DNA binding domain-containing protein  37.75 
 
 		 201 aa  119  3e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.635315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1304  transposon resolvase  35.23 
 
 		 209 aa  118  6e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0311544  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2000  DNA binding domain protein, excisionase family  35.9 
 
 		 212 aa  116  3e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.27976  normal  0.357405 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1219  DNA binding domain protein, excisionase family  35.71 
 
 		 201 aa  116  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1105  transposon resolvase  37.5 
 
 		 196 aa  115  3.9999999999999997e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.600674  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0948  site-specific integrase/resolvase  36.96 
 
 		 209 aa  113  2.0000000000000002e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.531266  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3893  DNA binding domain protein, excisionase family  33.33 
 
 		 203 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3943  DNA binding domain protein, excisionase family  33.33 
 
 		 203 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000130893  normal  0.0337021 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10939  resolvase  33.15 
 
 		 193 aa  103  1e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0465  resolvase-like protein  34.22 
 
 		 219 aa  103  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.123984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0684  resolvase domain-containing protein  32.77 
 
 		 190 aa  103  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.245344 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5676  resolvase domain-containing protein  32.77 
 
 		 190 aa  103  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12805  resolvase  31.82 
 
 		 193 aa  101  1e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00189559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12994  resolvase  30 
 
 		 194 aa  100  1e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000478883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2683  resolvase-like protein  32.22 
 
 		 190 aa  99.8  3e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.300522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3431  resolvase-like protein  31.82 
 
 		 197 aa  99.4  4e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1220  DNA binding domain protein, excisionase family  31.28 
 
 		 201 aa  97.1  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10616  resolvase  31.25 
 
 		 202 aa  92.8  3e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000496522  normal  0.221326 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1224  putative site-specific integrase-resolvase  30.32 
 
 		 197 aa  90.1  2e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.997311  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13862  resolvase  28.88 
 
 		 203 aa  86.3  3e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2002  regulatory protein, MerR  36.11 
 
 		 148 aa  85.1  8e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1614  resolvase domain-containing protein  26.97 
 
 		 182 aa  82.8  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00182311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5986  resolvase domain-containing protein  32.52 
 
 		 162 aa  82.4  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00224994  normal  0.0280728 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1191  Resolvase domain protein  25.89 
 
 		 205 aa  74.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1218  resolvase domain protein  28.5 
 
 		 205 aa  74.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12900  resolvase  28.9 
 
 		 295 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0601752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2120  Resolvase domain protein  34.81 
 
 		 217 aa  67.4  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1548  molybdenum-pterin binding protein  40.35 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.207471  normal  0.138773 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2776  putative resolvase  29.7 
 
 		 116 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.481265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2343  resolvase domain-containing protein  28.89 
 
 		 218 aa  54.7  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0795867  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  30.77 
 
 		 515 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3445  site-specific recombinase  28.89 
 
 		 218 aa  52.8  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3396  site-specific recombinase  28.89 
 
 		 218 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3707  site-specific recombinase, resolvase family  28.89 
 
 		 218 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000349891 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3480  resolvase family site-specific recombinase  28.89 
 
 		 218 aa  51.6  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3753  resolvase family site-specific recombinase  28.89 
 
 		 218 aa  51.6  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3726  resolvase family site-specific recombinase  28.15 
 
 		 218 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3749  site-specific recombinase, resolvase family  28.15 
 
 		 218 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.016515  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3798  site-specific recombinase, resolvase family  28.15 
 
 		 218 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1517  site-specific recombinase, resolvase family  28.15 
 
 		 218 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.114467 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11450  Resolvase domain protein  40.74 
 
 		 219 aa  51.2  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000780792  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3376  resolvase domain-containing protein  28.15 
 
 		 218 aa  50.1  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.127652  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4253  resolvase-like protein  30.33 
 
 		 201 aa  49.7  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.35703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4263  resolvase-like protein  30.33 
 
 		 201 aa  49.7  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0463  Resolvase domain protein  29.46 
 
 		 475 aa  50.1  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0983248  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2084  regulatory protein MerR  43.08 
 
 		 94 aa  49.3  0.00005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0196  putative site-specific integrase-resolvase, degenerate  39.68 
 
 		 63 aa  48.9  0.00006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000193839  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2733  Resolvase domain protein  34.15 
 
 		 126 aa  48.1  0.00009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007411  Ava_A0025  resolvase  38.38 
 
 		 511 aa  48.1  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.712822  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1152  Resolvase domain protein  32.38 
 
 		 460 aa  47.8  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2432  resolvase domain-containing protein  28.03 
 
 		 281 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0183379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1425  putative resolvase  36.23 
 
 		 126 aa  47.8  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>