83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1224 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_1224  putative site-specific integrase-resolvase  100 
 
 		 197 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.997311  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2513  Resolvase domain protein  51.28 
 
 		 195 aa  208  3e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1105  transposon resolvase  52.08 
 
 		 196 aa  198  5e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.600674  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2683  resolvase-like protein  49.72 
 
 		 190 aa  171  7.999999999999999e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.300522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12805  resolvase  46.74 
 
 		 193 aa  165  4e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00189559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12994  resolvase  45.64 
 
 		 194 aa  164  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000478883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0684  resolvase domain-containing protein  47.46 
 
 		 190 aa  162  3e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.245344 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5676  resolvase domain-containing protein  47.46 
 
 		 190 aa  162  3e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13862  resolvase  45.5 
 
 		 203 aa  160  8.000000000000001e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10939  resolvase  47.18 
 
 		 193 aa  159  2e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3431  resolvase-like protein  46.89 
 
 		 197 aa  156  2e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10616  resolvase  43.72 
 
 		 202 aa  148  5e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000496522  normal  0.221326 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1614  resolvase domain-containing protein  47.31 
 
 		 182 aa  142  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00182311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5986  resolvase domain-containing protein  49.66 
 
 		 162 aa  134  6.0000000000000005e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00224994  normal  0.0280728 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1033  transposon resolvase  36.22 
 
 		 204 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.412274  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2776  putative resolvase  64.44 
 
 		 116 aa  115  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.481265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0948  site-specific integrase/resolvase  42.47 
 
 		 209 aa  109  3e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.531266  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12900  resolvase  41.01 
 
 		 295 aa  106  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0601752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0658  hypothetical protein  41.78 
 
 		 215 aa  107  2e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1564  hypothetical protein  41.78 
 
 		 215 aa  107  2e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.20655  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3324  resolvase domain-containing protein  39.73 
 
 		 197 aa  104  7e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.296266  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2716  DNA binding domain protein, excisionase family  30.85 
 
 		 213 aa  91.3  9e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00788025  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1513  DNA binding domain protein, excisionase family  30.85 
 
 		 213 aa  91.3  9e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0941  resolvase domain-containing protein  35.04 
 
 		 208 aa  90.9  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0143335  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1426  site-specific integrase-resolvase-like protein  74.14 
 
 		 81 aa  90.5  1e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.765769  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0465  resolvase-like protein  35.71 
 
 		 219 aa  90.1  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.123984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1111  DNA binding domain-containing protein  30.32 
 
 		 215 aa  90.1  2e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.385151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1304  transposon resolvase  31.69 
 
 		 209 aa  89  4e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0311544  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2194  Resolvase domain protein  32.8 
 
 		 208 aa  87.4  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.72008  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2645  DNA binding domain protein, excisionase family  34.51 
 
 		 192 aa  87.4  1e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1425  putative resolvase  41.73 
 
 		 126 aa  87  2e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1913  Resolvase domain protein  32.8 
 
 		 208 aa  85.9  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0895  DNA binding domain protein, excisionase family  34.51 
 
 		 192 aa  84.3  0.000000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1241  Resolvase domain protein  30.73 
 
 		 222 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0456632  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0911  DNA binding domain protein, excisionase family  33.8 
 
 		 192 aa  80.1  0.00000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.00000302589  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3670  DNA binding domain-containing protein  36.09 
 
 		 201 aa  79.3  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.635315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1710  resolvase domain-containing protein  34.03 
 
 		 222 aa  79  0.00000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2935  Resolvase domain protein  32.35 
 
 		 206 aa  77.8  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1000  Resolvase domain protein  32.35 
 
 		 206 aa  77.8  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0589477 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1219  DNA binding domain protein, excisionase family  27.75 
 
 		 201 aa  77  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2443  DNA binding domain protein, excisionase family  34.72 
 
 		 193 aa  76.6  0.0000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.453884  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2574  DNA binding domain protein, excisionase family  32.17 
 
 		 194 aa  76.6  0.0000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.235149  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2781  Resolvase domain protein  33.85 
 
 		 222 aa  75.5  0.0000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.912906 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2048  Resolvase domain protein  32.17 
 
 		 193 aa  75.1  0.0000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0322526  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2150  DNA binding domain protein, excisionase family  30.34 
 
 		 195 aa  74.7  0.0000000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1118  Resolvase domain protein  33.56 
 
 		 229 aa  74.7  0.0000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220769  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0272  Resolvase domain protein  33.56 
 
 		 229 aa  74.7  0.0000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000593088  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0751  Resolvase domain protein  33.85 
 
 		 209 aa  74.7  0.0000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0851  regulatory protein MerR  33.08 
 
 		 222 aa  73.2  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0785  Resolvase domain protein  33.33 
 
 		 202 aa  73.9  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00525149  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0754  Resolvase domain protein  29.37 
 
 		 207 aa  73.2  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0744  Resolvase domain protein  34.93 
 
 		 229 aa  72.8  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000124642  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0947  Resolvase domain protein  35.07 
 
 		 195 aa  72.8  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000151254  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0236  Resolvase domain protein  35.07 
 
 		 195 aa  73.2  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000223632  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1070  resolvase domain-containing protein  33.33 
 
 		 197 aa  72.4  0.000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.709621  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1717  regulatory protein MerR  32.03 
 
 		 201 aa  71.6  0.000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.212526  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1449  Resolvase domain protein  34.56 
 
 		 207 aa  71.2  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0392946  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0484  DNA binding domain protein, excisionase family  35.11 
 
 		 216 aa  70.1  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.114276  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2000  DNA binding domain protein, excisionase family  29.68 
 
 		 212 aa  69.3  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.27976  normal  0.357405 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0390  DNA binding domain protein, excisionase family  30.85 
 
 		 216 aa  69.7  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0112175  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1911  DNA binding domain-containing protein  32.62 
 
 		 216 aa  68.6  0.00000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2393  DNA binding domain protein, excisionase family  34.51 
 
 		 191 aa  68.2  0.00000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0818  DNA binding domain protein, excisionase family  33.59 
 
 		 216 aa  66.6  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0122  DNA binding domain protein, excisionase family  30.85 
 
 		 216 aa  66.2  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0131  DNA binding domain protein, excisionase family  30.85 
 
 		 216 aa  66.2  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000948008  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1808  DNA binding domain protein, excisionase family  32.64 
 
 		 219 aa  65.5  0.0000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1960  site-specific integrase-resolvase-like  47.95 
 
 		 147 aa  65.1  0.0000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.4652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1174  DNA binding domain protein, excisionase family  33.85 
 
 		 219 aa  64.3  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.122691  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1270  Resolvase domain protein  27.33 
 
 		 195 aa  63.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3943  DNA binding domain protein, excisionase family  29.55 
 
 		 203 aa  62.4  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000130893  normal  0.0337021 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3893  DNA binding domain protein, excisionase family  29.55 
 
 		 203 aa  62.4  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1190  DNA binding domain protein, excisionase family  29.26 
 
 		 216 aa  60.1  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2002  regulatory protein, MerR  37 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0522  DNA binding domain protein, excisionase family  29.77 
 
 		 244 aa  56.6  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0170413  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4506  hypothetical protein  60 
 
 		 132 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1891  transposase OrfA  35.29 
 
 		 74 aa  48.1  0.00008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4533  resolvase domain-containing protein  41.05 
 
 		 214 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008264  CPR_B0006  resolvase  34.31 
 
 		 189 aa  45.4  0.0006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00548662  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0842  resolvase domain-containing protein  26.23 
 
 		 196 aa  43.1  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.419  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1082  resolvase family site-specific recombinase  38.89 
 
 		 205 aa  42.7  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271311  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0260  resolvase family site-specific recombinase  38.89 
 
 		 205 aa  42.7  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2258  resolvase domain-containing protein  33.8 
 
 		 74 aa  42.4  0.004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.216039  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3278  resolvase domain-containing protein  35.71 
 
 		 208 aa  42.4  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.312644  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>