84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1105 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_1105  transposon resolvase  100 
 
 		 196 aa  401  1e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.600674  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2513  Resolvase domain protein  60 
 
 		 195 aa  235  3e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12805  resolvase  55.62 
 
 		 193 aa  199  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00189559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2683  resolvase-like protein  58.29 
 
 		 190 aa  199  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.300522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1224  putative site-specific integrase-resolvase  52.08 
 
 		 197 aa  198  3.9999999999999996e-50  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.997311  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5676  resolvase domain-containing protein  59.06 
 
 		 190 aa  194  6e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0684  resolvase domain-containing protein  59.06 
 
 		 190 aa  194  6e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.245344 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3431  resolvase-like protein  58.48 
 
 		 197 aa  194  7e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12994  resolvase  51.05 
 
 		 194 aa  185  4e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000478883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10616  resolvase  53.93 
 
 		 202 aa  184  8e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000496522  normal  0.221326 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13862  resolvase  50.54 
 
 		 203 aa  181  9.000000000000001e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10939  resolvase  51.09 
 
 		 193 aa  178  4e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1614  resolvase domain-containing protein  58.02 
 
 		 182 aa  176  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00182311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5986  resolvase domain-containing protein  59.15 
 
 		 162 aa  154  9e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00224994  normal  0.0280728 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1033  transposon resolvase  41.62 
 
 		 204 aa  145  4.0000000000000006e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.412274  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12900  resolvase  47.98 
 
 		 295 aa  126  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0601752  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2716  DNA binding domain protein, excisionase family  36.36 
 
 		 213 aa  115  3e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00788025  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1513  DNA binding domain protein, excisionase family  36.36 
 
 		 213 aa  115  3e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1111  DNA binding domain-containing protein  37.5 
 
 		 215 aa  115  3e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.385151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2776  putative resolvase  62.22 
 
 		 116 aa  112  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.481265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1118  Resolvase domain protein  37.75 
 
 		 229 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220769  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0744  Resolvase domain protein  38.24 
 
 		 229 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000124642  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0272  Resolvase domain protein  37.25 
 
 		 229 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000593088  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1710  resolvase domain-containing protein  34.92 
 
 		 222 aa  110  2.0000000000000002e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0941  resolvase domain-containing protein  38.41 
 
 		 208 aa  107  7.000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0143335  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1070  resolvase domain-containing protein  35.56 
 
 		 197 aa  102  3e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.709621  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0948  site-specific integrase/resolvase  41.79 
 
 		 209 aa  102  5e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.531266  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1564  hypothetical protein  41.04 
 
 		 215 aa  100  1e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.20655  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0658  hypothetical protein  41.04 
 
 		 215 aa  100  1e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0465  resolvase-like protein  32.28 
 
 		 219 aa  99  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.123984  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2645  DNA binding domain protein, excisionase family  34.27 
 
 		 192 aa  98.2  8e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0754  Resolvase domain protein  38.13 
 
 		 207 aa  97.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0895  DNA binding domain protein, excisionase family  33.89 
 
 		 192 aa  97.1  1e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3324  resolvase domain-containing protein  40.3 
 
 		 197 aa  96.7  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.296266  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1425  putative resolvase  47.11 
 
 		 126 aa  94  1e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1241  Resolvase domain protein  36.15 
 
 		 222 aa  94.4  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0456632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1304  transposon resolvase  32.98 
 
 		 209 aa  93.2  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0311544  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0785  Resolvase domain protein  32.6 
 
 		 202 aa  93.6  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00525149  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1913  Resolvase domain protein  35.26 
 
 		 208 aa  93.2  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2194  Resolvase domain protein  34.74 
 
 		 208 aa  92.4  3e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.72008  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0911  DNA binding domain protein, excisionase family  32.78 
 
 		 192 aa  92.4  4e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.00000302589  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2048  Resolvase domain protein  32.6 
 
 		 193 aa  91.7  6e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0322526  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2935  Resolvase domain protein  37.23 
 
 		 206 aa  91.7  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1000  Resolvase domain protein  37.23 
 
 		 206 aa  91.7  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0589477 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0484  DNA binding domain protein, excisionase family  41.54 
 
 		 216 aa  91.3  9e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.114276  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2781  Resolvase domain protein  35.71 
 
 		 222 aa  90.9  9e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.912906 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0751  Resolvase domain protein  33.56 
 
 		 209 aa  90.9  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0390  DNA binding domain protein, excisionase family  40.77 
 
 		 216 aa  90.1  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0112175  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2150  DNA binding domain protein, excisionase family  31.11 
 
 		 195 aa  89.7  2e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0236  Resolvase domain protein  39.55 
 
 		 195 aa  89.7  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000223632  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0818  DNA binding domain protein, excisionase family  40.77 
 
 		 216 aa  89.4  3e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0851  regulatory protein MerR  34.92 
 
 		 222 aa  89.4  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0947  Resolvase domain protein  38.81 
 
 		 195 aa  88.6  6e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000151254  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2574  DNA binding domain protein, excisionase family  32.22 
 
 		 194 aa  88.2  8e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.235149  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2443  DNA binding domain protein, excisionase family  33.52 
 
 		 193 aa  87.4  1e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.453884  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1808  DNA binding domain protein, excisionase family  33.33 
 
 		 219 aa  86.7  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1449  Resolvase domain protein  38.24 
 
 		 207 aa  87  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0392946  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1911  DNA binding domain-containing protein  34.05 
 
 		 216 aa  86.3  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1174  DNA binding domain protein, excisionase family  32.98 
 
 		 219 aa  85.5  5e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.122691  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3670  DNA binding domain-containing protein  37.41 
 
 		 201 aa  85.1  6e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.635315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0122  DNA binding domain protein, excisionase family  39.23 
 
 		 216 aa  84  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0131  DNA binding domain protein, excisionase family  39.23 
 
 		 216 aa  84  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000948008  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2393  DNA binding domain protein, excisionase family  33.89 
 
 		 191 aa  80.9  0.00000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1219  DNA binding domain protein, excisionase family  28.18 
 
 		 201 aa  78.2  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1190  DNA binding domain protein, excisionase family  36.92 
 
 		 216 aa  77.8  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0522  DNA binding domain protein, excisionase family  36.15 
 
 		 244 aa  77  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0170413  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1426  site-specific integrase-resolvase-like protein  56.25 
 
 		 81 aa  76.3  0.0000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.765769  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2000  DNA binding domain protein, excisionase family  31.1 
 
 		 212 aa  75.5  0.0000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.27976  normal  0.357405 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1270  Resolvase domain protein  31.62 
 
 		 195 aa  74.7  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2002  regulatory protein, MerR  35 
 
 		 148 aa  74.7  0.0000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1717  regulatory protein MerR  28.04 
 
 		 201 aa  73.9  0.000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.212526  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3893  DNA binding domain protein, excisionase family  28.78 
 
 		 203 aa  72.4  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3943  DNA binding domain protein, excisionase family  28.78 
 
 		 203 aa  72.4  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000130893  normal  0.0337021 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1960  site-specific integrase-resolvase-like  52.05 
 
 		 147 aa  65.9  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.4652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0842  resolvase domain-containing protein  29.01 
 
 		 196 aa  54.7  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2921  transposase, IS605 OrfB  38.16 
 
 		 249 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0840725 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1891  transposase OrfA  33.9 
 
 		 74 aa  47.4  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0072  transposase  46.81 
 
 		 50 aa  46.2  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.905697  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4506  hypothetical protein  55 
 
 		 132 aa  45.8  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4533  resolvase domain-containing protein  31.45 
 
 		 214 aa  45.1  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2258  resolvase domain-containing protein  32.2 
 
 		 74 aa  43.9  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.216039  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0196  putative site-specific integrase-resolvase, degenerate  33.33 
 
 		 63 aa  43.9  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000193839  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1942  Resolvase domain protein  28.28 
 
 		 561 aa  42.4  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11450  Resolvase domain protein  27.41 
 
 		 219 aa  41.6  0.008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000780792  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>