250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_4533 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_4533  resolvase domain-containing protein  100 
 
 		 214 aa  431  1e-120  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3278  resolvase domain-containing protein  65.07 
 
 		 208 aa  249  3e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.312644  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1306  resolvase domain-containing protein  64.42 
 
 		 205 aa  244  8e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.92579  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4161  Resolvase domain  60.95 
 
 		 206 aa  236  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6887  resolvase domain-containing protein  63.94 
 
 		 210 aa  231  7.000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4666  resolvase domain-containing protein  52.66 
 
 		 202 aa  212  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000148612  normal  0.936039 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4408  resolvase domain-containing protein  52.66 
 
 		 202 aa  212  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000545957  normal  0.0701498 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4343  Resolvase domain protein  52.66 
 
 		 202 aa  212  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000112202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4266  resolvase domain-containing protein  52.29 
 
 		 231 aa  205  3e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000000000120246  unclonable  5.20349e-19 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0950  resolvase domain-containing protein  51.18 
 
 		 207 aa  200  9.999999999999999e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0077  resolvase family site-specific recombinase  50 
 
 		 211 aa  198  6e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.349046  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_44  putative resolvase  50.48 
 
 		 211 aa  196  2.0000000000000003e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0377389  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0078  TnpR  49.51 
 
 		 220 aa  196  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.569126 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_03  resolvase  50 
 
 		 209 aa  194  7e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009516  PsycPRwf_2397  resolvase domain-containing protein  48.57 
 
 		 210 aa  193  1e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0571  resolvase domain-containing protein  47.22 
 
 		 210 aa  190  1e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4386  resolvase domain-containing protein  46.86 
 
 		 209 aa  186  2e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4562  resolvase domain-containing protein  45.71 
 
 		 209 aa  184  7e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.338072  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0298  resolvase, putative  48.79 
 
 		 205 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0123  putative resolvase  46.67 
 
 		 206 aa  184  1.0000000000000001e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.922970000000001e-26 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4460  Resolvase domain protein  45.89 
 
 		 209 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4355  Resolvase domain protein  46.38 
 
 		 200 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2180  resolvase domain-containing protein  46.38 
 
 		 212 aa  182  3e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.52939  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4455  resolvase domain-containing protein  45.41 
 
 		 203 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4246  Resolvase domain protein  47.37 
 
 		 205 aa  182  5.0000000000000004e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0024  resolvase, putative  47.83 
 
 		 206 aa  176  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000663819  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0021  resolvase, putative  47.34 
 
 		 221 aa  176  3e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00853796  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01413  resolvase, putative  42.72 
 
 		 207 aa  171  1e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3979  resolvase domain-containing protein  47.37 
 
 		 208 aa  166  2e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4402  resolvase domain-containing protein  43.6 
 
 		 213 aa  165  4e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0054  resolvase domain-containing protein  43.13 
 
 		 213 aa  164  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001518  resolvase  41.9 
 
 		 204 aa  161  6e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000153211  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3590  resolvase domain protein  42.72 
 
 		 208 aa  156  2e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000308956 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2559  resolvase-like protein  42.72 
 
 		 222 aa  155  4e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.22678 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0873  Resolvase domain protein  42.72 
 
 		 206 aa  153  2e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1801  resolvase domain-containing protein  44.87 
 
 		 228 aa  136  2e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.118365 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2477  resolvase-like protein  37.98 
 
 		 198 aa  130  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.131622  normal  0.782919 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0719  resolvase domain-containing protein  37.02 
 
 		 197 aa  124  1e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000179161 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1355  resolvase-like protein  35.47 
 
 		 190 aa  105  4e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.141663 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0037  resolvase  33.17 
 
 		 245 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.489197  normal  0.472165 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3355  resolvase domain-containing protein  31.78 
 
 		 301 aa  99.4  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0978291  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0094  resolvase  32.68 
 
 		 245 aa  98.2  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.86084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2479  hypothetical protein  45.1 
 
 		 138 aa  95.5  5e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.802993 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6519  resolvase  31.19 
 
 		 283 aa  95.5  6e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0260  resolvase family site-specific recombinase  31.16 
 
 		 205 aa  72  0.000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1082  resolvase family site-specific recombinase  31.16 
 
 		 205 aa  72  0.000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271311  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0026  resolvase family site-specific recombinase  38.1 
 
 		 102 aa  67  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  decreased coverage  0.000122476  n/a   
 
 
-
 
NC_010715  Nther_2949  Resolvase domain  25.81 
 
 		 202 aa  65.5  0.0000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.587528  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4473  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  28.37 
 
 		 186 aa  63.2  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0992302  decreased coverage  0.00348712 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4599  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  28.37 
 
 		 186 aa  63.2  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000321893  hitchhiker  0.00456228 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15430  putative resolvase, essential for transposition  28.37 
 
 		 186 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  7.34084e-16  unclonable  6.55355e-22 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2019  resolvase family site-specific recombinase  40.91 
 
 		 91 aa  62.4  0.000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0053  transposon Tn21 resolvase  26.92 
 
 		 186 aa  62  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.509225 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4319  resolvase domain-containing protein  26.92 
 
 		 186 aa  62  0.000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1206  Resolvase domain protein  28.16 
 
 		 186 aa  61.6  0.000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0127  resolvase family site-specific recombinase  47.37 
 
 		 87 aa  60.8  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.364122  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4419  resolvase domain-containing protein  29.36 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00736052  normal  0.464308 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2084  resolvase domain-containing protein  29.36 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2173  resolvase domain-containing protein  29.36 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3678  Resolvase domain  29.11 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134045  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0039  resolvase  26.21 
 
 		 181 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5792  resolvase TnpR  29.05 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.923438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6448  Resolvase domain protein  33.01 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0687  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  28.77 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.731539  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3170  resolvase domain-containing protein  31.01 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00430122 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2494  resolvase domain-containing protein  30.05 
 
 		 191 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2100  Resolvase domain protein  28.85 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000956779  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0037  transposon Tn21 resolvase  28.99 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.335597 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4223  resolvase domain-containing protein  27.78 
 
 		 194 aa  57.8  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.150601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1325  resolvase domain-containing protein  26.51 
 
 		 192 aa  58.2  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1754  site-specific recombinase resolvase family protein PinR  28.37 
 
 		 196 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0427296  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01345  predicted site-specific recombinase  28.37 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01504  predicted site-specific recombinase  28.37 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.133152  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2272  Resolvase domain protein  28.37 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.861059  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0068  resolvase  24.76 
 
 		 181 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0902003  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01357  hypothetical protein  28.37 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01515  hypothetical protein  28.37 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.088804  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3670  resolvase domain-containing protein  28.71 
 
 		 185 aa  57  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1635  site-specific recombinase resolvase family protein PinR  28.37 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00540929  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2113  resolvase domain-containing protein  28.37 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0120982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5396  resolvase domain-containing protein  26.09 
 
 		 180 aa  56.6  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.859533  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1445  Resolvase domain  29.27 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1811  Resolvase domain protein  25 
 
 		 183 aa  56.2  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0297206  hitchhiker  0.00833685 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1711  integrative genetic element Gsu5, resolvase  26.64 
 
 		 190 aa  55.5  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5298  DNA-invertase hin  27.54 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6187  resolvase-like protein  27.75 
 
 		 186 aa  55.8  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0984609  hitchhiker  0.0000107923 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0108  hypothetical protein  32.26 
 
 		 309 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1494  resolvase-like protein  29.13 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.493325 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2680  resolvase domain-containing protein  27.54 
 
 		 185 aa  55.5  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3829  resolvase domain-containing protein  27.54 
 
 		 185 aa  55.5  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3846  resolvase domain-containing protein  27.54 
 
 		 185 aa  55.5  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.40246  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1914  resolvase domain-containing protein  27.54 
 
 		 185 aa  55.5  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1256  resolvase domain-containing protein  27.54 
 
 		 185 aa  55.5  0.0000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.249423  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0105  resolvase, N-terminal:resolvase helix-turn-helix region  29.06 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2509  putative res  63.16 
 
 		 41 aa  55.1  0.0000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.963906 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2033  resolvase domain-containing protein  28.5 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0043  hypothetical protein  27.4 
 
 		 188 aa  55.1  0.0000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3124  resolvase domain-containing protein  25.48 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0904767  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20410  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  27.96 
 
 		 194 aa  54.7  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0661103 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1762  resolvase-like protein  28.08 
 
 		 192 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>