216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_E0054 on replicon NC_009790
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009790  EcE24377A_E0054  resolvase domain-containing protein  100 
 
 		 213 aa  441  1e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4402  resolvase domain-containing protein  92.96 
 
 		 213 aa  409  1e-113  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0077  resolvase family site-specific recombinase  49.75 
 
 		 211 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.349046  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_44  putative resolvase  46.89 
 
 		 211 aa  197  1.0000000000000001e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0377389  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_03  resolvase  45.45 
 
 		 209 aa  193  2e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4246  Resolvase domain protein  54.29 
 
 		 205 aa  188  5.999999999999999e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01413  resolvase, putative  48.04 
 
 		 207 aa  186  2e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0571  resolvase domain-containing protein  52.57 
 
 		 210 aa  185  4e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0298  resolvase, putative  49.51 
 
 		 205 aa  185  5e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4266  resolvase domain-containing protein  45.97 
 
 		 231 aa  184  9e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000000000120246  unclonable  5.20349e-19 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0123  putative resolvase  45.81 
 
 		 206 aa  183  2.0000000000000003e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.922970000000001e-26 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0078  TnpR  50.28 
 
 		 220 aa  180  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.569126 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0024  resolvase, putative  47.09 
 
 		 206 aa  176  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000663819  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0021  resolvase, putative  47.09 
 
 		 221 aa  176  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00853796  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4161  Resolvase domain  45.32 
 
 		 206 aa  174  7e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3278  resolvase domain-containing protein  47.06 
 
 		 208 aa  174  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.312644  n/a   
 
 
-
 
NC_009516  PsycPRwf_2397  resolvase domain-containing protein  49.71 
 
 		 210 aa  172  2.9999999999999996e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1306  resolvase domain-containing protein  46.57 
 
 		 205 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.92579  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3979  resolvase domain-containing protein  53.14 
 
 		 208 aa  171  6.999999999999999e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0873  Resolvase domain protein  46.11 
 
 		 206 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4533  resolvase domain-containing protein  43.13 
 
 		 214 aa  164  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6887  resolvase domain-containing protein  41.98 
 
 		 210 aa  162  3e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4666  resolvase domain-containing protein  45.71 
 
 		 202 aa  160  1e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000148612  normal  0.936039 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4343  Resolvase domain protein  45.71 
 
 		 202 aa  160  1e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000112202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4408  resolvase domain-containing protein  45.71 
 
 		 202 aa  160  1e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000545957  normal  0.0701498 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0950  resolvase domain-containing protein  44.33 
 
 		 207 aa  158  7e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001518  resolvase  42.93 
 
 		 204 aa  156  3e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000153211  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3590  resolvase domain protein  45.71 
 
 		 208 aa  154  7e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000308956 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4460  Resolvase domain protein  46.86 
 
 		 209 aa  154  1e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4562  resolvase domain-containing protein  45.14 
 
 		 209 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.338072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4455  resolvase domain-containing protein  46.29 
 
 		 203 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4355  Resolvase domain protein  45.14 
 
 		 200 aa  152  4e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4386  resolvase domain-containing protein  44.57 
 
 		 209 aa  151  8.999999999999999e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2180  resolvase domain-containing protein  46.47 
 
 		 212 aa  149  2e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.52939  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2559  resolvase-like protein  40 
 
 		 222 aa  141  8e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.22678 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1801  resolvase domain-containing protein  40.98 
 
 		 228 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.118365 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2477  resolvase-like protein  40.39 
 
 		 198 aa  133  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.131622  normal  0.782919 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0719  resolvase domain-containing protein  38.92 
 
 		 197 aa  128  7.000000000000001e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000179161 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1355  resolvase-like protein  39.09 
 
 		 190 aa  125  4.0000000000000003e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.141663 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0094  resolvase  37.44 
 
 		 245 aa  120  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.86084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0037  resolvase  37.44 
 
 		 245 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.489197  normal  0.472165 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3355  resolvase domain-containing protein  35.96 
 
 		 301 aa  115  6.9999999999999995e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0978291  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6519  resolvase  34.13 
 
 		 283 aa  107  9.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20410  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  29 
 
 		 194 aa  70.5  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0661103 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2479  hypothetical protein  32.09 
 
 		 138 aa  70.1  0.00000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.802993 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0039  resolvase  30.21 
 
 		 181 aa  65.1  0.0000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3124  resolvase domain-containing protein  27.72 
 
 		 194 aa  65.1  0.0000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0904767  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0222  transposon resolvase  28.64 
 
 		 199 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000952158 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1967  resolvase domain-containing protein  30.14 
 
 		 252 aa  60.5  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0204  transposon resolvase  27.14 
 
 		 191 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000159954 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0216  transposon resolvase  28.14 
 
 		 199 aa  58.5  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.159168 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1811  Resolvase domain protein  26.24 
 
 		 183 aa  57.8  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0297206  hitchhiker  0.00833685 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  27.57 
 
 		 199 aa  57.4  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  27.44 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0068  resolvase  27.54 
 
 		 181 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0902003  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0233  resolvase  27.8 
 
 		 183 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0202  resolvase  27.8 
 
 		 183 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1711  integrative genetic element Gsu5, resolvase  25.29 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1445  Resolvase domain  25.93 
 
 		 188 aa  55.1  0.0000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2019  resolvase family site-specific recombinase  46.3 
 
 		 91 aa  55.1  0.0000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0037  transposon Tn21 resolvase  27.16 
 
 		 205 aa  54.7  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.335597 
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0002  resolvase  24.88 
 
 		 190 aa  55.1  0.0000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141759  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3670  resolvase domain-containing protein  27.81 
 
 		 185 aa  54.7  0.0000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0026  resolvase family site-specific recombinase  46.3 
 
 		 102 aa  54.3  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  decreased coverage  0.000122476  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3464  resolvase domain-containing protein  26.34 
 
 		 185 aa  54.3  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1132  Resolvase domain  24.26 
 
 		 184 aa  54.3  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008264  CPR_B0006  resolvase  25.62 
 
 		 189 aa  53.9  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00548662  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4319  resolvase domain-containing protein  25.93 
 
 		 186 aa  53.5  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0014  resolvase domain-containing protein  25.38 
 
 		 184 aa  53.5  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.125158  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0053  transposon Tn21 resolvase  25.93 
 
 		 186 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.509225 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0206  transposon resolvase  28.31 
 
 		 169 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000314886 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0041  resolvase domain-containing protein  26.4 
 
 		 184 aa  53.9  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.0000573211 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2582  resolvase domain-containing protein  24.55 
 
 		 185 aa  52.8  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2680  resolvase domain-containing protein  25.93 
 
 		 185 aa  52.8  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3829  resolvase domain-containing protein  25.93 
 
 		 185 aa  52.8  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3846  resolvase domain-containing protein  25.93 
 
 		 185 aa  52.8  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.40246  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1914  resolvase domain-containing protein  25.93 
 
 		 185 aa  52.8  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0797  resolvase domain-containing protein  29.27 
 
 		 251 aa  52.8  0.000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000013388 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1256  resolvase domain-containing protein  25.93 
 
 		 185 aa  52.8  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.249423  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0876  resolvase domain-containing protein  28.78 
 
 		 251 aa  52.4  0.000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0740279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1490  resolvase domain-containing protein  26.4 
 
 		 183 aa  52.4  0.000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.832501  hitchhiker  0.00333462 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3112  Resolvase domain protein  27.94 
 
 		 184 aa  52  0.000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1754  site-specific recombinase resolvase family protein PinR  27.78 
 
 		 196 aa  52.4  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0427296  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01345  predicted site-specific recombinase  27.78 
 
 		 196 aa  52  0.000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01504  predicted site-specific recombinase  27.78 
 
 		 196 aa  52  0.000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.133152  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2272  Resolvase domain protein  27.78 
 
 		 196 aa  52  0.000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.861059  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2113  resolvase domain-containing protein  27.78 
 
 		 196 aa  52  0.000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0120982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  34.26 
 
 		 515 aa  52  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01515  hypothetical protein  27.78 
 
 		 196 aa  52  0.000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.088804  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0019  Resolvase domain protein  27.27 
 
 		 195 aa  52  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01357  hypothetical protein  27.78 
 
 		 196 aa  52  0.000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4473  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  27.78 
 
 		 186 aa  51.6  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0992302  decreased coverage  0.00348712 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4599  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  27.78 
 
 		 186 aa  51.6  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000321893  hitchhiker  0.00456228 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15430  putative resolvase, essential for transposition  27.78 
 
 		 186 aa  51.6  0.000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  7.34084e-16  unclonable  6.55355e-22 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1006  Resolvase domain protein  25.75 
 
 		 189 aa  51.6  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1635  site-specific recombinase resolvase family protein PinR  27.78 
 
 		 196 aa  51.6  0.000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00540929  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0260  resolvase family site-specific recombinase  25.49 
 
 		 205 aa  51.6  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1082  resolvase family site-specific recombinase  25.49 
 
 		 205 aa  51.6  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271311  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1494  resolvase-like protein  28.4 
 
 		 186 aa  51.2  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.493325 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0466  Resolvase domain  25.98 
 
 		 205 aa  51.2  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.418385  normal  0.0169839 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>