More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_2477 on replicon NC_007968
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007968  Pcryo_2477  resolvase-like protein  100 
 
 		 198 aa  400  1e-111  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.131622  normal  0.782919 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0719  resolvase domain-containing protein  88.66 
 
 		 197 aa  348  2e-95  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000179161 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1355  resolvase-like protein  86.24 
 
 		 190 aa  328  2e-89  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.141663 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0873  Resolvase domain protein  46.34 
 
 		 206 aa  171  9e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3590  resolvase domain protein  44.22 
 
 		 208 aa  140  8e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000308956 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_44  putative resolvase  41.38 
 
 		 211 aa  140  9.999999999999999e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0377389  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0298  resolvase, putative  45.76 
 
 		 205 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0078  TnpR  40.78 
 
 		 220 aa  138  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.569126 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4266  resolvase domain-containing protein  41.26 
 
 		 231 aa  136  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000000000120246  unclonable  5.20349e-19 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_03  resolvase  39.81 
 
 		 209 aa  136  2e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1801  resolvase domain-containing protein  40.98 
 
 		 228 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.118365 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0054  resolvase domain-containing protein  40.39 
 
 		 213 aa  133  9.999999999999999e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01413  resolvase, putative  39.71 
 
 		 207 aa  133  1.9999999999999998e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0123  putative resolvase  39.71 
 
 		 206 aa  131  6e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.922970000000001e-26 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4402  resolvase domain-containing protein  39.9 
 
 		 213 aa  131  6.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4533  resolvase domain-containing protein  37.98 
 
 		 214 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0077  resolvase family site-specific recombinase  38.73 
 
 		 211 aa  128  5.0000000000000004e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.349046  n/a   
 
 
-
 
NC_009516  PsycPRwf_2397  resolvase domain-containing protein  43.29 
 
 		 210 aa  125  5e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0950  resolvase domain-containing protein  37.75 
 
 		 207 aa  124  7e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4161  Resolvase domain  38.28 
 
 		 206 aa  124  7e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0024  resolvase, putative  39.11 
 
 		 206 aa  123  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000663819  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0021  resolvase, putative  39.11 
 
 		 221 aa  122  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00853796  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4246  Resolvase domain protein  44.44 
 
 		 205 aa  122  2e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001518  resolvase  38.61 
 
 		 204 aa  123  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000153211  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3278  resolvase domain-containing protein  42.18 
 
 		 208 aa  122  4e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.312644  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6887  resolvase domain-containing protein  39.51 
 
 		 210 aa  122  4e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1306  resolvase domain-containing protein  41.46 
 
 		 205 aa  120  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.92579  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0571  resolvase domain-containing protein  38.86 
 
 		 210 aa  119  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3979  resolvase domain-containing protein  41.48 
 
 		 208 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2559  resolvase-like protein  36.15 
 
 		 222 aa  117  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.22678 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4386  resolvase domain-containing protein  40.12 
 
 		 209 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4455  resolvase domain-containing protein  42.18 
 
 		 203 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2180  resolvase domain-containing protein  42.18 
 
 		 212 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.52939  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4355  Resolvase domain protein  42.18 
 
 		 200 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4408  resolvase domain-containing protein  39.31 
 
 		 202 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000545957  normal  0.0701498 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4666  resolvase domain-containing protein  39.31 
 
 		 202 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000148612  normal  0.936039 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4343  Resolvase domain protein  39.31 
 
 		 202 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000112202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4562  resolvase domain-containing protein  42.18 
 
 		 209 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.338072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4460  Resolvase domain protein  42.18 
 
 		 209 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6519  resolvase  35.86 
 
 		 283 aa  92.8  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3355  resolvase domain-containing protein  33 
 
 		 301 aa  87.4  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0978291  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0037  resolvase  30.39 
 
 		 245 aa  85.5  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.489197  normal  0.472165 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0094  resolvase  29.9 
 
 		 245 aa  82.8  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.86084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010715  Nther_2949  Resolvase domain  25.25 
 
 		 202 aa  74.3  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.587528  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0466  Resolvase domain  30.26 
 
 		 205 aa  72  0.000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.418385  normal  0.0169839 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1711  integrative genetic element Gsu5, resolvase  28.5 
 
 		 190 aa  69.7  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  29.15 
 
 		 201 aa  66.6  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2582  resolvase domain-containing protein  28.5 
 
 		 185 aa  67  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0002  resolvase  29.5 
 
 		 190 aa  66.2  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141759  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08245  resolvase  30.57 
 
 		 179 aa  65.5  0.0000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010374  M446_7059  hypothetical protein  30 
 
 		 183 aa  65.1  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3680  resolvase domain-containing protein  28.36 
 
 		 199 aa  65.1  0.0000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3876  resolvase domain-containing protein  28.36 
 
 		 199 aa  65.1  0.0000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.3792 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4081  resolvase domain-containing protein  28.36 
 
 		 199 aa  65.1  0.0000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0381075 
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0065  DNA recombinase  26.29 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0246  resolvase domain-containing protein  30 
 
 		 179 aa  63.2  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.315323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20410  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  30.26 
 
 		 194 aa  62.8  0.000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0661103 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7006  hypothetical protein  28.21 
 
 		 183 aa  62.4  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1006  Resolvase domain protein  26.42 
 
 		 189 aa  62.4  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1138  resolvase-like protein  31.37 
 
 		 207 aa  62  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00747364  normal  0.0234159 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3170  resolvase domain-containing protein  26.26 
 
 		 200 aa  61.6  0.000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00430122 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  26.42 
 
 		 199 aa  61.6  0.000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6187  resolvase-like protein  29.15 
 
 		 186 aa  61.2  0.000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0984609  hitchhiker  0.0000107923 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  26.4 
 
 		 201 aa  61.2  0.000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4537  Resolvase domain protein  26.67 
 
 		 198 aa  60.8  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.41321 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3112  Resolvase domain protein  28.64 
 
 		 184 aa  60.8  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1494  resolvase-like protein  28.21 
 
 		 186 aa  59.7  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.493325 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2479  hypothetical protein  33.33 
 
 		 138 aa  60.1  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.802993 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2095  Resolvase domain protein  30.56 
 
 		 203 aa  58.9  0.00000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3678  Resolvase domain  29.41 
 
 		 190 aa  58.9  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134045  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3124  resolvase domain-containing protein  27.14 
 
 		 194 aa  58.5  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0904767  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6810  Resolvase domain protein  29.8 
 
 		 185 aa  58.5  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.67902  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0096  resolvase domain-containing protein  26.47 
 
 		 185 aa  58.2  0.00000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4598  Resolvase domain protein  29.08 
 
 		 188 aa  57.8  0.00000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  26.26 
 
 		 188 aa  58.2  0.00000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3670  resolvase domain-containing protein  26.87 
 
 		 185 aa  58.2  0.00000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1052  Resolvase domain  26.9 
 
 		 186 aa  57.8  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2033  resolvase domain-containing protein  27.55 
 
 		 192 aa  57.4  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_42  putative resolvase  27.6 
 
 		 181 aa  57.4  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0684051  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29040  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  28.64 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.436309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1206  Resolvase domain protein  27.84 
 
 		 186 aa  57  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2355  Resolvase domain protein  25.38 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.230305  normal  0.6636 
 
 
-
 
NC_008264  CPR_B0006  resolvase  28.06 
 
 		 189 aa  56.6  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00548662  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3928  resolvase domain-containing protein  31.96 
 
 		 191 aa  56.6  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.272515  hitchhiker  0.0000753359 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0854  invertase/recombinase like protein  25.77 
 
 		 198 aa  56.2  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.160403  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  29.8 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2322  resolvase domain-containing protein  26.67 
 
 		 186 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1326  resolvase domain-containing protein  28.02 
 
 		 180 aa  55.8  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1445  Resolvase domain  29.06 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0149  resolvase  27.94 
 
 		 189 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0466  resolvase  28.36 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.736746  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0463  Resolvase domain protein  31.61 
 
 		 475 aa  55.8  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0983248  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0816  resolvase domain-containing protein  28.43 
 
 		 185 aa  55.8  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1325  resolvase domain-containing protein  26.37 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4473  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  25.91 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0992302  decreased coverage  0.00348712 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4599  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  25.91 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000321893  hitchhiker  0.00456228 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0011  RlgA  28.43 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.928686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15430  putative resolvase, essential for transposition  25.91 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  7.34084e-16  unclonable  6.55355e-22 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0687  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  27.64 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.731539  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0039  resolvase  27.78 
 
 		 181 aa  55.1  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>