More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01413 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_01413  resolvase, putative  100 
 
 		 207 aa  418  1e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_44  putative resolvase  54.15 
 
 		 211 aa  223  2e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0377389  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_03  resolvase  51.98 
 
 		 209 aa  216  2e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0298  resolvase, putative  52.24 
 
 		 205 aa  214  9e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4266  resolvase domain-containing protein  52.2 
 
 		 231 aa  209  2e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000000000120246  unclonable  5.20349e-19 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0024  resolvase, putative  49.26 
 
 		 206 aa  206  2e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000663819  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0021  resolvase, putative  49.26 
 
 		 221 aa  206  2e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00853796  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0123  putative resolvase  49.5 
 
 		 206 aa  198  3.9999999999999996e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.922970000000001e-26 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0077  resolvase family site-specific recombinase  50 
 
 		 211 aa  198  5e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.349046  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3979  resolvase domain-containing protein  48.31 
 
 		 208 aa  192  4e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009516  PsycPRwf_2397  resolvase domain-containing protein  48.26 
 
 		 210 aa  191  5e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0571  resolvase domain-containing protein  46.86 
 
 		 210 aa  190  1e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4161  Resolvase domain  48.02 
 
 		 206 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0054  resolvase domain-containing protein  48.04 
 
 		 213 aa  186  2e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4246  Resolvase domain protein  46.34 
 
 		 205 aa  185  4e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4402  resolvase domain-containing protein  48.04 
 
 		 213 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4666  resolvase domain-containing protein  46.8 
 
 		 202 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000148612  normal  0.936039 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4408  resolvase domain-containing protein  46.8 
 
 		 202 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000545957  normal  0.0701498 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4343  Resolvase domain protein  46.8 
 
 		 202 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000112202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1306  resolvase domain-containing protein  51.74 
 
 		 205 aa  180  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.92579  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3278  resolvase domain-containing protein  50.75 
 
 		 208 aa  178  4e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.312644  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0078  TnpR  44.62 
 
 		 220 aa  177  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.569126 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0873  Resolvase domain protein  44.12 
 
 		 206 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4533  resolvase domain-containing protein  42.72 
 
 		 214 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0950  resolvase domain-containing protein  43.9 
 
 		 207 aa  167  1e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3590  resolvase domain protein  42.86 
 
 		 208 aa  165  4e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000308956 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6887  resolvase domain-containing protein  42.36 
 
 		 210 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2559  resolvase-like protein  41.98 
 
 		 222 aa  162  5.0000000000000005e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.22678 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001518  resolvase  43.15 
 
 		 204 aa  157  8e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000153211  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4460  Resolvase domain protein  41.55 
 
 		 209 aa  151  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2180  resolvase domain-containing protein  41.29 
 
 		 212 aa  151  8e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.52939  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4562  resolvase domain-containing protein  41.26 
 
 		 209 aa  151  8.999999999999999e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.338072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4355  Resolvase domain protein  40.8 
 
 		 200 aa  149  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4455  resolvase domain-containing protein  41.29 
 
 		 203 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4386  resolvase domain-containing protein  40.3 
 
 		 209 aa  148  5e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1801  resolvase domain-containing protein  40.69 
 
 		 228 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.118365 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0719  resolvase domain-containing protein  39.6 
 
 		 197 aa  135  4e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000179161 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2477  resolvase-like protein  39.71 
 
 		 198 aa  133  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.131622  normal  0.782919 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1355  resolvase-like protein  39.09 
 
 		 190 aa  130  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.141663 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0094  resolvase  34.5 
 
 		 245 aa  114  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.86084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0037  resolvase  34 
 
 		 245 aa  113  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.489197  normal  0.472165 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6519  resolvase  34.85 
 
 		 283 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3355  resolvase domain-containing protein  32.34 
 
 		 301 aa  98.2  8e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0978291  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3124  resolvase domain-containing protein  31.46 
 
 		 194 aa  88.2  8e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0904767  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2479  hypothetical protein  42.86 
 
 		 138 aa  82  0.000000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.802993 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01209  bacteriocin production protein  30.26 
 
 		 198 aa  81.6  0.000000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000702686  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4473  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  31.28 
 
 		 186 aa  81.3  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0992302  decreased coverage  0.00348712 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4599  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  31.28 
 
 		 186 aa  81.3  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000321893  hitchhiker  0.00456228 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15430  putative resolvase, essential for transposition  31.28 
 
 		 186 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  7.34084e-16  unclonable  6.55355e-22 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4319  resolvase domain-containing protein  30.77 
 
 		 186 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0053  transposon Tn21 resolvase  30.77 
 
 		 186 aa  80.1  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.509225 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0043  hypothetical protein  33.84 
 
 		 188 aa  77.4  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1206  Resolvase domain protein  30.77 
 
 		 186 aa  77.8  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1445  Resolvase domain  31 
 
 		 188 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2179  resolvase domain-containing protein  31.16 
 
 		 188 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0190993  hitchhiker  0.0022624 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2946  resolvase domain-containing protein  31.16 
 
 		 188 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0986415  normal  0.227448 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2033  resolvase domain-containing protein  29.9 
 
 		 192 aa  75.5  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0687  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  32.7 
 
 		 200 aa  75.5  0.0000000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.731539  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3464  resolvase domain-containing protein  29.74 
 
 		 185 aa  74.7  0.0000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2680  resolvase domain-containing protein  29.74 
 
 		 185 aa  73.6  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3829  resolvase domain-containing protein  29.74 
 
 		 185 aa  73.6  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3846  resolvase domain-containing protein  29.74 
 
 		 185 aa  73.6  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.40246  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1914  resolvase domain-containing protein  29.74 
 
 		 185 aa  73.6  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1256  resolvase domain-containing protein  29.74 
 
 		 185 aa  73.2  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.249423  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20410  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  31.98 
 
 		 194 aa  72.8  0.000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0661103 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1811  Resolvase domain protein  30.5 
 
 		 183 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0297206  hitchhiker  0.00833685 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3112  Resolvase domain protein  31.5 
 
 		 184 aa  72  0.000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0037  transposon Tn21 resolvase  29.74 
 
 		 205 aa  72  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.335597 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2173  resolvase domain-containing protein  30.58 
 
 		 196 aa  72  0.000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4764  resolvase domain-containing protein  30.93 
 
 		 189 aa  72  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4419  resolvase domain-containing protein  30.58 
 
 		 196 aa  72  0.000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00736052  normal  0.464308 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2084  resolvase domain-containing protein  30.58 
 
 		 196 aa  72  0.000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4598  Resolvase domain protein  30.41 
 
 		 188 aa  70.9  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0580  resolvase domain-containing protein  28.14 
 
 		 186 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3678  Resolvase domain  28.91 
 
 		 190 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134045  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0611  Resolvase domain protein  28.14 
 
 		 186 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0605  resolvase domain-containing protein  28.14 
 
 		 186 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.177837 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1711  integrative genetic element Gsu5, resolvase  28.16 
 
 		 190 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
NC_010374  M446_7059  hypothetical protein  29.08 
 
 		 183 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1494  resolvase-like protein  29.74 
 
 		 186 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.493325 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0466  Resolvase domain  31.12 
 
 		 205 aa  70.5  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.418385  normal  0.0169839 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0166  Resolvase domain protein  29.9 
 
 		 188 aa  69.7  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  28.91 
 
 		 199 aa  69.7  0.00000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5397  Resolvase domain protein  28.57 
 
 		 185 aa  69.3  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6187  resolvase-like protein  29.23 
 
 		 186 aa  69.3  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0984609  hitchhiker  0.0000107923 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2264  resolvase-like protein  33.74 
 
 		 183 aa  68.9  0.00000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0723164  hitchhiker  0.00531394 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0246  resolvase domain-containing protein  31.31 
 
 		 179 aa  68.9  0.00000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.315323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2351  resolvase-like protein  29.74 
 
 		 235 aa  68.6  0.00000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.329475 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4775  resolvase domain-containing protein  30.39 
 
 		 189 aa  68.2  0.00000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4668  resolvase domain-containing protein  30.39 
 
 		 189 aa  68.2  0.00000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2781  resolvase domain-containing protein  30.81 
 
 		 190 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.183587  normal  0.43479 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1326  resolvase domain-containing protein  27.86 
 
 		 180 aa  67.4  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  28.44 
 
 		 201 aa  68.2  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2100  Resolvase domain protein  30.14 
 
 		 196 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000956779  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3553  resolvase domain-containing protein  29 
 
 		 181 aa  67  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.467372  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4352  Resolvase domain protein  28.28 
 
 		 186 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00813261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1125  resolvase domain-containing protein  28.21 
 
 		 184 aa  67  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.577602  n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4489  Resolvase domain protein  28.28 
 
 		 186 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000146883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1754  site-specific recombinase resolvase family protein PinR  30.05 
 
 		 196 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0427296  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3928  resolvase domain-containing protein  31.96 
 
 		 191 aa  66.6  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.272515  hitchhiker  0.0000753359 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>