More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2264 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2264  resolvase-like protein  100 
 
 		 183 aa  355  1.9999999999999998e-97  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0723164  hitchhiker  0.00531394 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4764  resolvase domain-containing protein  78.89 
 
 		 189 aa  280  8.000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2351  resolvase-like protein  81.76 
 
 		 235 aa  279  1e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.329475 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6187  resolvase-like protein  75.9 
 
 		 186 aa  254  7e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0984609  hitchhiker  0.0000107923 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1494  resolvase-like protein  74.85 
 
 		 186 aa  246  2e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.493325 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3982  resolvase domain-containing protein  73.62 
 
 		 201 aa  240  1e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.364011  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0631  resolvase domain-containing protein  73.62 
 
 		 201 aa  240  1e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0037  transposon Tn21 resolvase  71.78 
 
 		 205 aa  236  9e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.335597 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1206  Resolvase domain protein  70.12 
 
 		 186 aa  236  1e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1256  resolvase domain-containing protein  71.17 
 
 		 185 aa  236  1e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.249423  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2680  resolvase domain-containing protein  71.17 
 
 		 185 aa  236  2e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4473  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  68.67 
 
 		 186 aa  236  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0992302  decreased coverage  0.00348712 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4599  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  68.67 
 
 		 186 aa  236  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000321893  hitchhiker  0.00456228 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15430  putative resolvase, essential for transposition  68.67 
 
 		 186 aa  236  2e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  7.34084e-16  unclonable  6.55355e-22 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3829  resolvase domain-containing protein  71.17 
 
 		 185 aa  236  2e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3846  resolvase domain-containing protein  71.17 
 
 		 185 aa  236  2e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.40246  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1914  resolvase domain-containing protein  71.17 
 
 		 185 aa  236  2e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2322  resolvase domain-containing protein  69.94 
 
 		 186 aa  234  7e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4319  resolvase domain-containing protein  68.07 
 
 		 186 aa  234  7e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0053  transposon Tn21 resolvase  68.07 
 
 		 186 aa  234  7e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.509225 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3464  resolvase domain-containing protein  69.94 
 
 		 185 aa  232  3e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4489  Resolvase domain protein  66.87 
 
 		 186 aa  229  2e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000146883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4352  Resolvase domain protein  66.87 
 
 		 186 aa  229  2e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00813261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0166  Resolvase domain protein  67.47 
 
 		 188 aa  223  1e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2033  resolvase domain-containing protein  65.48 
 
 		 192 aa  221  4e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3928  resolvase domain-containing protein  61.54 
 
 		 191 aa  221  4.9999999999999996e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.272515  hitchhiker  0.0000753359 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4598  Resolvase domain protein  67.48 
 
 		 188 aa  221  6e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1125  resolvase domain-containing protein  65.85 
 
 		 184 aa  219  9.999999999999999e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.577602  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0043  hypothetical protein  59.64 
 
 		 188 aa  212  2.9999999999999995e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3170  resolvase domain-containing protein  59.66 
 
 		 200 aa  187  5.999999999999999e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00430122 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5336  transposon Tn21 resolvase  73.81 
 
 		 129 aa  187  9e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3523  resolvase, N-terminal:resolvase helix-turn-helix region  59.3 
 
 		 184 aa  186  1e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000257012  decreased coverage  0.00040401 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1445  Resolvase domain  54.82 
 
 		 188 aa  185  3e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1312  resolvase, N-terminal:resolvase helix-turn-helix region  57.32 
 
 		 187 aa  177  1e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.183881 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0884  Resolvase domain protein  51.53 
 
 		 187 aa  176  2e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000364698  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1325  resolvase domain-containing protein  51.48 
 
 		 192 aa  169  2e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2803  putative resolvase  53.33 
 
 		 188 aa  162  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.545302  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1735  putative resolvase  52.73 
 
 		 188 aa  161  5.0000000000000005e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16170  resolvase  50.31 
 
 		 207 aa  151  5e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.982528  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1811  Resolvase domain protein  42.6 
 
 		 183 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0297206  hitchhiker  0.00833685 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2319  resolvase, putative  47.33 
 
 		 137 aa  121  7e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000512602  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  39.16 
 
 		 192 aa  115  3e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21550  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  42.22 
 
 		 218 aa  115  3e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.850113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3678  Resolvase domain  38.41 
 
 		 190 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134045  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1711  integrative genetic element Gsu5, resolvase  40.12 
 
 		 190 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4091  Resolvase domain  39.52 
 
 		 186 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2746  resolvase domain-containing protein  39.16 
 
 		 197 aa  111  5e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2823  resolvase domain-containing protein  39.16 
 
 		 197 aa  111  5e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2355  Resolvase domain protein  42.86 
 
 		 186 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.230305  normal  0.6636 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  38.2 
 
 		 188 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_010504  Mrad2831_6517  resolvase domain-containing protein  38.15 
 
 		 185 aa  108  6e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2095  Resolvase domain protein  38.95 
 
 		 203 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2179  resolvase domain-containing protein  47.83 
 
 		 188 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0190993  hitchhiker  0.0022624 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2946  resolvase domain-containing protein  47.83 
 
 		 188 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0986415  normal  0.227448 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2027  resolvase domain-containing protein  35.29 
 
 		 185 aa  107  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0260  resolvase family site-specific recombinase  38.46 
 
 		 205 aa  106  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1082  resolvase family site-specific recombinase  38.46 
 
 		 205 aa  106  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271311  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2239  resolvase domain-containing protein  36.53 
 
 		 187 aa  106  2e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  37.35 
 
 		 188 aa  105  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4459  resolvase  37.95 
 
 		 190 aa  105  3e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4290  resolvase  37.95 
 
 		 190 aa  105  3e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4190  resolvase  37.95 
 
 		 190 aa  105  3e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0471  resolvase  40.24 
 
 		 197 aa  105  3e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  42.68 
 
 		 194 aa  105  4e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1006  Resolvase domain protein  38.12 
 
 		 189 aa  105  4e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0955  Resolvase domain protein  41.98 
 
 		 194 aa  105  5e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0090  resolvase TnpR  34.97 
 
 		 183 aa  104  6e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.707126  normal  0.345515 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  37.42 
 
 		 188 aa  104  6e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D15  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  38.1 
 
 		 184 aa  104  7e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0991  resolvase domain-containing protein  37.89 
 
 		 205 aa  104  8e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0378771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3670  resolvase domain-containing protein  37.8 
 
 		 185 aa  103  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1852  Resolvase domain  41.51 
 
 		 197 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.064893  hitchhiker  0.000000000000388244 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5339  DNA-invertase  41.51 
 
 		 192 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.687343  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4479  Resolvase domain protein  41.51 
 
 		 197 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000147912 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1132  Resolvase domain  38.37 
 
 		 184 aa  103  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2582  resolvase domain-containing protein  39.24 
 
 		 185 aa  102  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1477  Resolvase domain  41.51 
 
 		 197 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.79192  unclonable  0.0000000000000150315 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1052  Resolvase domain  35.26 
 
 		 186 aa  102  3e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1397  Resolvase domain protein  41.61 
 
 		 209 aa  102  4e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.954133  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  38.69 
 
 		 191 aa  101  5e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3694  resolvase domain-containing protein  38.51 
 
 		 206 aa  102  5e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5457  hypothetical protein  39.29 
 
 		 194 aa  100  8e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5424  Resolvase domain  39.29 
 
 		 194 aa  100  8e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3876  resolvase domain-containing protein  38.24 
 
 		 199 aa  100  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.3792 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  36.42 
 
 		 185 aa  100  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3680  resolvase domain-containing protein  38.24 
 
 		 199 aa  100  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4081  resolvase domain-containing protein  38.24 
 
 		 199 aa  100  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0381075 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25710  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  40.61 
 
 		 201 aa  100  1e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2111  Resolvase domain protein  40.25 
 
 		 191 aa  99.8  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.813305  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3007  resolvase-like protein  37.04 
 
 		 204 aa  100  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0154323 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4042  serine-based site-specific recombinase activity  37.04 
 
 		 204 aa  100  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.890679  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4975  serine-based site-specific recombinase activity  37.04 
 
 		 204 aa  100  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.283487  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  36.42 
 
 		 185 aa  100  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6388  resolvase domain-containing protein  37.8 
 
 		 191 aa  99  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9833  Resolvase Protein  38.65 
 
 		 210 aa  99.4  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0466  Resolvase domain  36.53 
 
 		 205 aa  99  3e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.418385  normal  0.0169839 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2144  Resolvase domain protein  39.07 
 
 		 196 aa  99.4  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0618608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2363  resolvase-like protein  38.99 
 
 		 228 aa  98.6  4e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.379523  normal  0.343568 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1579  transposon Tn3 resolvase  36.36 
 
 		 185 aa  98.6  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.159821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4137  resolvase domain-containing protein  37.35 
 
 		 224 aa  99  4e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.130251  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>