More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0246 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_0246  resolvase domain-containing protein  100 
 
 
179 aa  366  1e-101  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.315323  normal 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08245  resolvase  75.84 
 
 
179 aa  282  2.0000000000000002e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_42  putative resolvase  69.1 
 
 
181 aa  268  2e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0684051  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3670  resolvase domain-containing protein  40.91 
 
 
185 aa  134  9e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3678  Resolvase domain  39.2 
 
 
190 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134045  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2582  resolvase domain-containing protein  40.11 
 
 
185 aa  127  6e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1711  integrative genetic element Gsu5, resolvase  37.29 
 
 
190 aa  127  9.000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5628  Resolvase domain  40 
 
 
198 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.526216 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0090  resolvase TnpR  39.89 
 
 
183 aa  124  7e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.707126  normal  0.345515 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  39.46 
 
 
192 aa  123  2e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5519  Resolvase domain  39.13 
 
 
197 aa  121  4e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.176111  normal  0.515657 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01209  bacteriocin production protein  38.64 
 
 
198 aa  120  9e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000702686  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1579  transposon Tn3 resolvase  39.33 
 
 
185 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.159821  normal 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  35.91 
 
 
188 aa  119  3e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6417  resolvase domain-containing protein  39.11 
 
 
196 aa  118  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2823  resolvase domain-containing protein  38.59 
 
 
197 aa  117  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2746  resolvase domain-containing protein  38.59 
 
 
197 aa  117  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010504  Mrad2831_6517  resolvase domain-containing protein  38.12 
 
 
185 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1132  Resolvase domain  36.93 
 
 
184 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4885  resolvase domain-containing protein  37.43 
 
 
187 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  39.01 
 
 
182 aa  116  1.9999999999999998e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D08  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  39.33 
 
 
193 aa  115  1.9999999999999998e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.942713  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1006  Resolvase domain protein  36.16 
 
 
189 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4764  resolvase domain-containing protein  37.91 
 
 
189 aa  115  5e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5399  resolvase domain-containing protein  36.26 
 
 
186 aa  114  6.9999999999999995e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00909416  normal 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0011  resolvase, putative  39.11 
 
 
181 aa  114  8.999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2355  Resolvase domain protein  36.93 
 
 
186 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.230305  normal  0.6636 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0466  Resolvase domain  36.41 
 
 
205 aa  112  2.0000000000000002e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.418385  normal  0.0169839 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6810  Resolvase domain protein  40.11 
 
 
185 aa  112  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.67902  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  37.02 
 
 
188 aa  112  3e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2239  resolvase domain-containing protein  34.81 
 
 
187 aa  112  3e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4091  Resolvase domain  37.02 
 
 
186 aa  111  5e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1326  resolvase domain-containing protein  35.2 
 
 
180 aa  111  5e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0096  resolvase domain-containing protein  38.76 
 
 
185 aa  111  5e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0816  resolvase domain-containing protein  38.98 
 
 
185 aa  110  7.000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6307  resolvase domain-containing protein  37.85 
 
 
209 aa  110  9e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0545  hypothetical protein  36.31 
 
 
186 aa  109  2.0000000000000002e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0606652 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6405  resolvase domain-containing protein  38.98 
 
 
185 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2095  Resolvase domain protein  37.57 
 
 
203 aa  108  3e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3553  resolvase domain-containing protein  39.87 
 
 
181 aa  108  4.0000000000000004e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.467372  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1594  resolvase domain-containing protein  36.31 
 
 
189 aa  108  4.0000000000000004e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.94865  normal  0.455677 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  34.62 
 
 
191 aa  107  7.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5122  resolvase domain-containing protein  38.76 
 
 
290 aa  106  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0086  resolvase family site-specific recombinase  31.67 
 
 
196 aa  105  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.464664  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4228  resolvase family site-specific recombinase  41.48 
 
 
187 aa  106  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.623835  n/a   
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2813  resolvase-like protein  36.96 
 
 
184 aa  106  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.493253  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2351  resolvase-like protein  37.36 
 
 
235 aa  106  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.329475 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3477  resolvase domain-containing protein  32.22 
 
 
196 aa  105  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010374  M446_7059  hypothetical protein  35.75 
 
 
183 aa  106  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D15  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  38.04 
 
 
184 aa  106  2e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2245  resolvase domain-containing protein  35.2 
 
 
183 aa  106  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0071186  normal  0.011182 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0039  resolvase  33.7 
 
 
181 aa  105  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5396  resolvase domain-containing protein  35.39 
 
 
180 aa  105  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.859533  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0747  resolvase domain-containing protein  37.64 
 
 
181 aa  105  3e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0268  resolvase domain-containing protein  36.52 
 
 
181 aa  105  4e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.268273  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4383  resolvase  35.96 
 
 
193 aa  105  4e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0189  resolvase domain-containing protein  31.67 
 
 
206 aa  104  5e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1992  resolvase domain-containing protein  31.67 
 
 
206 aa  104  5e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0235  resolvase domain-containing protein  35.59 
 
 
187 aa  104  6e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2258  resolvase domain-containing protein  36.11 
 
 
195 aa  104  8e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.880923  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1490  resolvase domain-containing protein  33.7 
 
 
183 aa  104  9e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.832501  hitchhiker  0.00333462 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4560  resolvase domain-containing protein  31.11 
 
 
192 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0052  hypothetical protein  35.87 
 
 
201 aa  103  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1445  Resolvase domain  34.97 
 
 
188 aa  103  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  35.71 
 
 
188 aa  103  2e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  35.56 
 
 
185 aa  102  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6388  resolvase domain-containing protein  35.16 
 
 
191 aa  102  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1615  resolvase family site-specific recombinase  37.78 
 
 
197 aa  102  4e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1104  Resolvase domain  34.83 
 
 
196 aa  102  4e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  35.56 
 
 
185 aa  101  5e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4382  resolvase domain-containing protein  31.84 
 
 
194 aa  101  6e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0233  resolvase  33.88 
 
 
183 aa  101  7e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0202  resolvase  33.88 
 
 
183 aa  101  7e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2637  resolvase domain-containing protein  37.99 
 
 
182 aa  100  9e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0771518 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3135  resolvase TnpR  34.78 
 
 
217 aa  100  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6187  resolvase-like protein  36.26 
 
 
186 aa  100  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0984609  hitchhiker  0.0000107923 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0466  resolvase  32.78 
 
 
193 aa  100  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.736746  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3562  resolvase domain-containing protein  36.67 
 
 
208 aa  100  1e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5450  resolvase domain-containing protein  34.25 
 
 
184 aa  100  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0019  ISSod9, DNA-invertase  35.16 
 
 
185 aa  99.8  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0170  ISSod9, DNA-invertase  35.16 
 
 
185 aa  99.8  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.579928  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0068  resolvase  32.6 
 
 
181 aa  99.8  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0902003  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2363  resolvase-like protein  36.11 
 
 
228 aa  100  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.379523  normal  0.343568 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2027  resolvase domain-containing protein  36.96 
 
 
185 aa  99.8  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0884  Resolvase domain protein  35.16 
 
 
187 aa  99.8  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000364698  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0605  resolvase domain-containing protein  36.93 
 
 
186 aa  99  3e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.177837 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2033  resolvase domain-containing protein  35.91 
 
 
192 aa  99  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0580  resolvase domain-containing protein  36.93 
 
 
186 aa  99  3e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0611  Resolvase domain protein  36.93 
 
 
186 aa  99  3e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2381  Resolvase domain  34.83 
 
 
196 aa  99  3e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1052  Resolvase domain  38.67 
 
 
186 aa  98.6  4e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5397  Resolvase domain protein  35.03 
 
 
185 aa  98.6  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0260  resolvase family site-specific recombinase  34.08 
 
 
205 aa  98.2  5e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1082  resolvase family site-specific recombinase  34.08 
 
 
205 aa  98.2  5e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271311  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7006  hypothetical protein  34.08 
 
 
183 aa  98.2  5e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  36.46 
 
 
197 aa  98.2  5e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2173  resolvase domain-containing protein  32.79 
 
 
196 aa  98.2  6e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4419  resolvase domain-containing protein  32.79 
 
 
196 aa  98.2  6e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00736052  normal  0.464308 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2084  resolvase domain-containing protein  32.79 
 
 
196 aa  98.2  6e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  33.9 
 
 
199 aa  98.2  6e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>