More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_1992 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_0189  resolvase domain-containing protein  100 
 
 		 206 aa  422  1e-117  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1992  resolvase domain-containing protein  100 
 
 		 206 aa  422  1e-117  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4560  resolvase domain-containing protein  96.84 
 
 		 192 aa  377  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3477  resolvase domain-containing protein  98.39 
 
 		 196 aa  377  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0086  resolvase family site-specific recombinase  97.31 
 
 		 196 aa  374  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.464664  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01209  bacteriocin production protein  51.63 
 
 		 198 aa  187  1e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000702686  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5141  resolvase domain-containing protein  60.94 
 
 		 135 aa  162  4.0000000000000004e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.748263  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3678  Resolvase domain  48.6 
 
 		 190 aa  153  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134045  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3670  resolvase domain-containing protein  44.39 
 
 		 185 aa  152  4e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010374  M446_7059  hypothetical protein  42.7 
 
 		 183 aa  147  9e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6405  resolvase domain-containing protein  44.86 
 
 		 185 aa  147  9e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0816  resolvase domain-containing protein  44.86 
 
 		 185 aa  145  6e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1006  Resolvase domain protein  44.81 
 
 		 189 aa  144  9e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6810  Resolvase domain protein  44.32 
 
 		 185 aa  144  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.67902  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7006  hypothetical protein  42.86 
 
 		 183 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1711  integrative genetic element Gsu5, resolvase  42.02 
 
 		 190 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2582  resolvase domain-containing protein  42.16 
 
 		 185 aa  140  9.999999999999999e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1132  Resolvase domain  41.49 
 
 		 184 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2355  Resolvase domain protein  43.58 
 
 		 186 aa  139  3e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.230305  normal  0.6636 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5397  Resolvase domain protein  42.7 
 
 		 185 aa  138  6e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0068  resolvase  38.42 
 
 		 181 aa  138  7e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0902003  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0466  Resolvase domain  42.39 
 
 		 205 aa  135  5e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.418385  normal  0.0169839 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2095  Resolvase domain protein  41.85 
 
 		 203 aa  135  5e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1326  resolvase domain-containing protein  42.54 
 
 		 180 aa  134  8e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0260  resolvase family site-specific recombinase  41.57 
 
 		 205 aa  134  9.999999999999999e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1082  resolvase family site-specific recombinase  41.57 
 
 		 205 aa  134  9.999999999999999e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271311  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4091  Resolvase domain  37.04 
 
 		 186 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010504  Mrad2831_6517  resolvase domain-containing protein  41.67 
 
 		 185 aa  132  3e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6388  resolvase domain-containing protein  40 
 
 		 191 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3112  Resolvase domain protein  40.98 
 
 		 184 aa  131  6e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0011  RlgA  42.02 
 
 		 186 aa  131  9e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.928686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4137  resolvase domain-containing protein  39.67 
 
 		 224 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.130251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4459  resolvase  40.32 
 
 		 190 aa  130  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4290  resolvase  40.32 
 
 		 190 aa  130  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4190  resolvase  40.32 
 
 		 190 aa  130  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6748  resolvase domain-containing protein  38.59 
 
 		 201 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.167425 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  38.04 
 
 		 188 aa  129  2.0000000000000002e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4685  resolvase domain-containing protein  36.46 
 
 		 193 aa  129  3e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3992  resolvase domain-containing protein  40.1 
 
 		 195 aa  129  3e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.378658  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2984  putative site-specific recombinases, DNA invertase Pin  38.62 
 
 		 203 aa  128  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200056  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0884  Resolvase domain protein  38.67 
 
 		 187 aa  128  6e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000364698  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5399  resolvase domain-containing protein  39.23 
 
 		 186 aa  128  6e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00909416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2363  resolvase-like protein  35.29 
 
 		 228 aa  128  7.000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.379523  normal  0.343568 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  37.78 
 
 		 182 aa  128  7.000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0605  resolvase domain-containing protein  40.64 
 
 		 186 aa  127  8.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.177837 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0580  resolvase domain-containing protein  40.64 
 
 		 186 aa  127  8.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0611  Resolvase domain protein  40.64 
 
 		 186 aa  127  8.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2147  Resolvase domain protein  37.08 
 
 		 191 aa  125  3e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3714  resolvase domain-containing protein  37.43 
 
 		 188 aa  125  3e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.566828  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2027  resolvase domain-containing protein  41.53 
 
 		 185 aa  126  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4249  resolvase domain-containing protein  37.08 
 
 		 191 aa  125  3e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.251845 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0409  resolvase domain-containing protein  44.44 
 
 		 186 aa  125  4.0000000000000003e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000318958  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4991  resolvase domain-containing protein  37.63 
 
 		 189 aa  125  5e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  36.87 
 
 		 185 aa  125  6e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0095  resolvase domain-containing protein  36.76 
 
 		 189 aa  125  6e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  36.87 
 
 		 185 aa  124  7e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0202  resolvase  35.59 
 
 		 183 aa  124  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0233  resolvase  35.59 
 
 		 183 aa  124  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4123  resolvase domain-containing protein  36.61 
 
 		 185 aa  124  9e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0694671 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5431  Resolvase domain protein  36.31 
 
 		 185 aa  124  9e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318584  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5126  Resolvase domain protein  38.17 
 
 		 197 aa  124  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.114051 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5037  resolvase domain-containing protein  34.25 
 
 		 201 aa  124  1e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.931406  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  44.67 
 
 		 199 aa  123  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  38.2 
 
 		 191 aa  123  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  44.93 
 
 		 188 aa  123  2e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4835  Resolvase domain protein  35.94 
 
 		 201 aa  123  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.291279 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  36.87 
 
 		 185 aa  122  3e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  38.71 
 
 		 194 aa  122  3e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  37.99 
 
 		 188 aa  122  4e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0019  ISSod9, DNA-invertase  36.87 
 
 		 185 aa  121  6e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0170  ISSod9, DNA-invertase  36.87 
 
 		 185 aa  121  6e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.579928  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2245  resolvase domain-containing protein  40.66 
 
 		 183 aa  121  6e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0071186  normal  0.011182 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5396  resolvase domain-containing protein  39.44 
 
 		 180 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.859533  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3440  invertase/recombinase protein  35.52 
 
 		 188 aa  120  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.115695  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0235  resolvase domain-containing protein  42.36 
 
 		 187 aa  120  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2239  resolvase domain-containing protein  37.3 
 
 		 187 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  36.7 
 
 		 201 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  35.83 
 
 		 192 aa  119  3e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D08  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  39.13 
 
 		 193 aa  119  3e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.942713  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5450  resolvase domain-containing protein  40 
 
 		 184 aa  119  3.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0854  invertase/recombinase like protein  38.33 
 
 		 198 aa  118  6e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.160403  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3660  resolvase domain-containing protein  42 
 
 		 202 aa  118  7e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2258  resolvase domain-containing protein  35.71 
 
 		 195 aa  117  7.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.880923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  34.83 
 
 		 188 aa  117  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4228  resolvase family site-specific recombinase  40 
 
 		 187 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.623835  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1397  invertase/recombinase like protein  40.49 
 
 		 176 aa  117  9.999999999999999e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  34.83 
 
 		 187 aa  117  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  34.83 
 
 		 190 aa  117  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3553  resolvase domain-containing protein  38.29 
 
 		 181 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.467372  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6417  resolvase domain-containing protein  37.11 
 
 		 196 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3683  resolvase domain-containing protein  37.62 
 
 		 215 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4383  resolvase  34.44 
 
 		 193 aa  116  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0466  resolvase  34.44 
 
 		 193 aa  116  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.736746  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0052  hypothetical protein  34.16 
 
 		 201 aa  116  3e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5298  DNA-invertase hin  43.75 
 
 		 186 aa  115  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5519  Resolvase domain  37.5 
 
 		 197 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.176111  normal  0.515657 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5332  Resolvase domain protein  37.14 
 
 		 184 aa  115  3.9999999999999997e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4319  resolvase-like protein  35 
 
 		 206 aa  115  5e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  37.99 
 
 		 219 aa  114  7.999999999999999e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0149  resolvase  34.25 
 
 		 189 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>