More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_5122 on replicon NC_009507
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009507  Swit_5122  resolvase domain-containing protein  100 
 
 		 290 aa  592  1e-168  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5066  resolvase domain-containing protein  82.07 
 
 		 313 aa  501  1e-141  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.436238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4606  resolvase domain-containing protein  87.86 
 
 		 140 aa  249  3e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5519  Resolvase domain  67.2 
 
 		 197 aa  249  5e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.176111  normal  0.515657 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6417  resolvase domain-containing protein  67.22 
 
 		 196 aa  241  9e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5628  Resolvase domain  67.22 
 
 		 198 aa  239  4e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.526216 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0747  resolvase domain-containing protein  58.99 
 
 		 181 aa  209  4e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0268  resolvase domain-containing protein  58.43 
 
 		 181 aa  207  2e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.268273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4885  resolvase domain-containing protein  57.53 
 
 		 187 aa  204  2e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010374  M446_7059  hypothetical protein  48.31 
 
 		 183 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6405  resolvase domain-containing protein  45.95 
 
 		 185 aa  161  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7006  hypothetical protein  48.31 
 
 		 183 aa  160  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5397  Resolvase domain protein  46.11 
 
 		 185 aa  159  5e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0816  resolvase domain-containing protein  46.41 
 
 		 185 aa  158  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6810  Resolvase domain protein  46.41 
 
 		 185 aa  156  4e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.67902  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0011  RlgA  44.02 
 
 		 186 aa  156  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.928686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0611  Resolvase domain protein  44.38 
 
 		 186 aa  151  1e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0580  resolvase domain-containing protein  44.38 
 
 		 186 aa  151  1e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0605  resolvase domain-containing protein  44.38 
 
 		 186 aa  151  1e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.177837 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3112  Resolvase domain protein  46.37 
 
 		 184 aa  149  5e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0108  hypothetical protein  32.49 
 
 		 309 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2702  resolvase domain-containing protein  32.06 
 
 		 307 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.264305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2944  resolvase domain-containing protein  32.06 
 
 		 307 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.857733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  41.18 
 
 		 197 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1326  resolvase domain-containing protein  41.81 
 
 		 180 aa  129  6e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  41.49 
 
 		 194 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5399  resolvase domain-containing protein  44.2 
 
 		 186 aa  126  5e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00909416  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1006  Resolvase domain protein  41.71 
 
 		 189 aa  125  7e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01209  bacteriocin production protein  37.97 
 
 		 198 aa  125  7e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000702686  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  41.01 
 
 		 188 aa  125  8.000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3670  resolvase domain-containing protein  40.45 
 
 		 185 aa  124  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3678  Resolvase domain  38.2 
 
 		 190 aa  124  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134045  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2582  resolvase domain-containing protein  36.11 
 
 		 185 aa  123  3e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5431  Resolvase domain protein  40.45 
 
 		 185 aa  123  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  40.45 
 
 		 184 aa  123  4e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.623719 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  39.89 
 
 		 188 aa  122  5e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0466  resolvase  39.78 
 
 		 193 aa  122  6e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.736746  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1711  integrative genetic element Gsu5, resolvase  39.89 
 
 		 190 aa  122  7e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  40.34 
 
 		 184 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3714  resolvase domain-containing protein  38.2 
 
 		 188 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.566828  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  39.04 
 
 		 192 aa  119  7e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3440  invertase/recombinase protein  43.09 
 
 		 188 aa  119  7.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.115695  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0409  resolvase domain-containing protein  39.11 
 
 		 186 aa  119  7.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000318958  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4123  resolvase domain-containing protein  39.25 
 
 		 185 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0694671 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2245  resolvase domain-containing protein  43.5 
 
 		 183 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0071186  normal  0.011182 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  37.22 
 
 		 191 aa  117  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0235  resolvase domain-containing protein  38.46 
 
 		 187 aa  117  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  40.98 
 
 		 219 aa  117  3e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  37.84 
 
 		 185 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0545  hypothetical protein  40.78 
 
 		 186 aa  116  3.9999999999999997e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0606652 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0090  resolvase TnpR  37.22 
 
 		 183 aa  116  3.9999999999999997e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.707126  normal  0.345515 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0019  ISSod9, DNA-invertase  39.33 
 
 		 185 aa  116  5e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0170  ISSod9, DNA-invertase  39.33 
 
 		 185 aa  116  5e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.579928  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1579  transposon Tn3 resolvase  37.64 
 
 		 185 aa  115  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.159821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1494  resolvase-like protein  36.56 
 
 		 186 aa  115  6e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.493325 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1125  resolvase domain-containing protein  37.97 
 
 		 184 aa  115  6e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.577602  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0536  resolvase domain-containing protein  38.2 
 
 		 203 aa  115  6.9999999999999995e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4383  resolvase  39.78 
 
 		 193 aa  115  6.9999999999999995e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4991  resolvase domain-containing protein  37.7 
 
 		 189 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0011  resolvase, putative  41.24 
 
 		 181 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  38.55 
 
 		 188 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0466  Resolvase domain  39.78 
 
 		 205 aa  115  1.0000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.418385  normal  0.0169839 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  38.67 
 
 		 182 aa  114  1.0000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0096  resolvase domain-containing protein  38.98 
 
 		 185 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  35.79 
 
 		 201 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  37.84 
 
 		 185 aa  114  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  37.99 
 
 		 199 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4091  Resolvase domain  40 
 
 		 186 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2746  resolvase domain-containing protein  38.46 
 
 		 197 aa  113  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4473  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  34.95 
 
 		 186 aa  114  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0992302  decreased coverage  0.00348712 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4599  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  34.95 
 
 		 186 aa  114  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000321893  hitchhiker  0.00456228 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2239  resolvase domain-containing protein  38.55 
 
 		 187 aa  113  3e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15430  putative resolvase, essential for transposition  34.95 
 
 		 186 aa  114  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  7.34084e-16  unclonable  6.55355e-22 
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2823  resolvase domain-containing protein  38.46 
 
 		 197 aa  113  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1104  Resolvase domain  38.64 
 
 		 196 aa  113  4.0000000000000004e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  38.07 
 
 		 185 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1206  Resolvase domain protein  34.95 
 
 		 186 aa  113  4.0000000000000004e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  37.57 
 
 		 188 aa  113  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  37.02 
 
 		 187 aa  112  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2033  resolvase domain-containing protein  37.91 
 
 		 192 aa  112  5e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3045  Resolvase domain protein  37.78 
 
 		 189 aa  113  5e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4352  Resolvase domain protein  35.11 
 
 		 186 aa  112  6e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00813261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2355  Resolvase domain protein  38.1 
 
 		 186 aa  112  6e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.230305  normal  0.6636 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4685  resolvase domain-containing protein  34.67 
 
 		 193 aa  112  6e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4489  Resolvase domain protein  35.11 
 
 		 186 aa  112  6e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000146883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  37.02 
 
 		 190 aa  112  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2381  Resolvase domain  39.2 
 
 		 196 aa  112  7.000000000000001e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1256  resolvase domain-containing protein  35.48 
 
 		 185 aa  112  9e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.249423  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0260  resolvase family site-specific recombinase  40.78 
 
 		 205 aa  111  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1082  resolvase family site-specific recombinase  40.78 
 
 		 205 aa  111  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271311  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3992  resolvase domain-containing protein  34.54 
 
 		 195 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.378658  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2680  resolvase domain-containing protein  35.48 
 
 		 185 aa  111  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2147  Resolvase domain protein  38.2 
 
 		 191 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4249  resolvase domain-containing protein  38.2 
 
 		 191 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.251845 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2396  resolvase domain-containing protein  44.93 
 
 		 163 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.718289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6388  resolvase domain-containing protein  40.78 
 
 		 191 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5450  resolvase domain-containing protein  42.78 
 
 		 184 aa  110  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3829  resolvase domain-containing protein  35.48 
 
 		 185 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3846  resolvase domain-containing protein  35.48 
 
 		 185 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.40246  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1914  resolvase domain-containing protein  35.48 
 
 		 185 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>