More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_5399 on replicon NC_009507
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009507  Swit_5399  resolvase domain-containing protein  100 
 
 		 186 aa  379  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00909416  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1615  resolvase family site-specific recombinase  56.35 
 
 		 197 aa  189  2e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3338  resolvase domain-containing protein  60 
 
 		 186 aa  174  8e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2245  resolvase domain-containing protein  47.83 
 
 		 183 aa  161  4.0000000000000004e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0071186  normal  0.011182 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0039  resolvase  46.96 
 
 		 181 aa  159  3e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5396  resolvase domain-containing protein  48.88 
 
 		 180 aa  157  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.859533  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5450  resolvase domain-containing protein  46.63 
 
 		 184 aa  150  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3553  resolvase domain-containing protein  45.3 
 
 		 181 aa  149  3e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.467372  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1052  Resolvase domain  45.6 
 
 		 186 aa  149  3e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0041  resolvase domain-containing protein  43.17 
 
 		 184 aa  147  9e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.0000573211 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0014  resolvase domain-containing protein  43.96 
 
 		 184 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.125158  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3124  resolvase domain-containing protein  49.06 
 
 		 194 aa  146  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0904767  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  43.55 
 
 		 191 aa  145  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  44.75 
 
 		 182 aa  144  6e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  45.3 
 
 		 194 aa  144  8.000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0167  resolvase domain-containing protein  41.85 
 
 		 196 aa  143  1e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2172  recombinase  45.25 
 
 		 214 aa  143  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0678128  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3440  invertase/recombinase protein  41.49 
 
 		 188 aa  142  3e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.115695  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3847  resolvase-like protein  41.44 
 
 		 191 aa  141  4e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.388128  n/a   
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0002  resolvase  41.4 
 
 		 190 aa  142  4e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141759  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  40.76 
 
 		 199 aa  141  5e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3670  resolvase domain-containing protein  43.75 
 
 		 185 aa  141  7e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  43.96 
 
 		 188 aa  140  9.999999999999999e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1490  resolvase domain-containing protein  47.1 
 
 		 183 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.832501  hitchhiker  0.00333462 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0536  resolvase domain-containing protein  43.62 
 
 		 203 aa  139  3e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201567  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1711  integrative genetic element Gsu5, resolvase  40.88 
 
 		 190 aa  139  3e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  40.66 
 
 		 192 aa  138  3.9999999999999997e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  40.22 
 
 		 201 aa  138  3.9999999999999997e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  44.32 
 
 		 188 aa  138  4.999999999999999e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0052  hypothetical protein  42.54 
 
 		 201 aa  137  7e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2813  resolvase-like protein  40.98 
 
 		 184 aa  136  1e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.493253  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2984  putative site-specific recombinases, DNA invertase Pin  41.44 
 
 		 203 aa  136  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200056  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0108  hypothetical protein  42.54 
 
 		 309 aa  137  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6307  resolvase domain-containing protein  43.26 
 
 		 209 aa  136  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  41.62 
 
 		 201 aa  135  4e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008264  CPR_B0006  resolvase  40.32 
 
 		 189 aa  135  4e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00548662  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2144  Resolvase domain protein  44.26 
 
 		 196 aa  133  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0618608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2702  resolvase domain-containing protein  40.88 
 
 		 307 aa  132  3e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.264305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2944  resolvase domain-containing protein  40.88 
 
 		 307 aa  132  3e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.857733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5436  Resolvase domain  43.02 
 
 		 193 aa  131  5e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1090  resolvase domain-containing protein  45.28 
 
 		 159 aa  131  6e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20410  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  41.3 
 
 		 194 aa  131  6e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0661103 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4319  resolvase-like protein  40.11 
 
 		 206 aa  131  6e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5066  resolvase domain-containing protein  43.65 
 
 		 313 aa  131  6.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.436238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  41.57 
 
 		 184 aa  130  7.999999999999999e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.623719 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  41.62 
 
 		 197 aa  130  7.999999999999999e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  40.76 
 
 		 185 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6403  resolvase domain-containing protein  41.9 
 
 		 193 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  41.11 
 
 		 188 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6497  resolvase domain-containing protein  41.9 
 
 		 193 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6373  resolvase domain-containing protein  41.9 
 
 		 193 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0235  resolvase domain-containing protein  47.92 
 
 		 187 aa  130  1.0000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1006  Resolvase domain protein  41.48 
 
 		 189 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  41.01 
 
 		 184 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6608  resolvase domain-containing protein  39.89 
 
 		 189 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.525053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6450  resolvase domain-containing protein  41.34 
 
 		 193 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2147  Resolvase domain protein  42.29 
 
 		 191 aa  129  3e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0466  resolvase  41.34 
 
 		 193 aa  129  3e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.736746  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4249  resolvase domain-containing protein  42.29 
 
 		 191 aa  129  3e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.251845 
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2746  resolvase domain-containing protein  40.88 
 
 		 197 aa  128  4.0000000000000003e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2823  resolvase domain-containing protein  40.88 
 
 		 197 aa  128  4.0000000000000003e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  42.37 
 
 		 199 aa  129  4.0000000000000003e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  40.54 
 
 		 188 aa  128  5.0000000000000004e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0189  resolvase domain-containing protein  39.23 
 
 		 206 aa  128  5.0000000000000004e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1992  resolvase domain-containing protein  39.23 
 
 		 206 aa  128  5.0000000000000004e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D08  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  40.11 
 
 		 193 aa  128  6e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.942713  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  40.98 
 
 		 188 aa  128  6e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  41.11 
 
 		 185 aa  127  7.000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5126  Resolvase domain protein  38.04 
 
 		 197 aa  127  7.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.114051 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2550  Resolvase domain  47.87 
 
 		 196 aa  127  8.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.819685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5280  resolvase domain-containing protein  44 
 
 		 305 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3477  resolvase domain-containing protein  38.67 
 
 		 196 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5122  resolvase domain-containing protein  44.2 
 
 		 290 aa  126  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5459  resolvase domain-containing protein  41.62 
 
 		 190 aa  126  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4835  Resolvase domain protein  41.3 
 
 		 201 aa  126  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.291279 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  39.67 
 
 		 185 aa  126  2.0000000000000002e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  41.4 
 
 		 219 aa  126  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08245  resolvase  39.89 
 
 		 179 aa  125  4.0000000000000003e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4383  resolvase  39.67 
 
 		 193 aa  125  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4560  resolvase domain-containing protein  37.84 
 
 		 192 aa  124  8.000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0409  resolvase domain-containing protein  42.7 
 
 		 186 aa  124  8.000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000318958  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0019  ISSod9, DNA-invertase  41.08 
 
 		 185 aa  123  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0086  resolvase family site-specific recombinase  37.57 
 
 		 196 aa  123  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.464664  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0170  ISSod9, DNA-invertase  41.08 
 
 		 185 aa  123  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.579928  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0068  resolvase  39.23 
 
 		 181 aa  123  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0902003  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0854  invertase/recombinase like protein  40.44 
 
 		 198 aa  124  1e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.160403  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1132  Resolvase domain  38.25 
 
 		 184 aa  124  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2392  Resolvase domain  41.53 
 
 		 197 aa  123  1e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000064315  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0095  resolvase domain-containing protein  43.65 
 
 		 189 aa  123  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5037  resolvase domain-containing protein  38.12 
 
 		 201 aa  123  1e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.931406  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6748  resolvase domain-containing protein  39.66 
 
 		 201 aa  122  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.167425 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5431  Resolvase domain protein  39.46 
 
 		 185 aa  122  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3714  resolvase domain-containing protein  39.67 
 
 		 188 aa  122  3e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.566828  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4382  resolvase domain-containing protein  39.66 
 
 		 194 aa  122  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2582  resolvase domain-containing protein  37.99 
 
 		 185 aa  122  4e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0021  resolvase-like protein  42.54 
 
 		 189 aa  120  9.999999999999999e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4796  resolvase domain-containing protein  47.48 
 
 		 310 aa  120  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.271999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1326  resolvase domain-containing protein  38.25 
 
 		 180 aa  120  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21550  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  39.66 
 
 		 218 aa  120  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.850113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1202  resolvase domain-containing protein  39.67 
 
 		 194 aa  120  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>