More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1090 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1090  resolvase domain-containing protein  100 
 
 		 159 aa  315  2e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2245  resolvase domain-containing protein  94.94 
 
 		 183 aa  296  6e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0071186  normal  0.011182 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5450  resolvase domain-containing protein  73.38 
 
 		 184 aa  223  6e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3553  resolvase domain-containing protein  66.45 
 
 		 181 aa  199  9.999999999999999e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.467372  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3338  resolvase domain-containing protein  52.45 
 
 		 186 aa  140  8e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5399  resolvase domain-containing protein  45.28 
 
 		 186 aa  131  3.9999999999999996e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00909416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3847  resolvase-like protein  43.79 
 
 		 191 aa  128  3e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.388128  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1615  resolvase family site-specific recombinase  46.41 
 
 		 197 aa  122  2e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  42.31 
 
 		 188 aa  120  7e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  45.45 
 
 		 182 aa  119  1.9999999999999998e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  42.41 
 
 		 188 aa  117  9e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5093  resolvase domain-containing protein  43.23 
 
 		 201 aa  113  8.999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.993134 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  41.14 
 
 		 197 aa  110  9e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2147  Resolvase domain protein  44.37 
 
 		 191 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5459  resolvase domain-containing protein  40.65 
 
 		 190 aa  108  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4249  resolvase domain-containing protein  44.37 
 
 		 191 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.251845 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0167  resolvase domain-containing protein  41.4 
 
 		 196 aa  107  6e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2355  Resolvase domain protein  40 
 
 		 186 aa  107  6e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.230305  normal  0.6636 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  38.82 
 
 		 191 aa  107  6e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  33.33 
 
 		 199 aa  107  7.000000000000001e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21550  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  41.51 
 
 		 218 aa  107  8.000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.850113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5396  resolvase domain-containing protein  37.25 
 
 		 180 aa  106  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.859533  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20410  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  38.82 
 
 		 194 aa  106  1e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0661103 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  40.38 
 
 		 184 aa  104  5e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.623719 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2144  Resolvase domain protein  41.94 
 
 		 196 aa  104  5e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0618608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2258  resolvase domain-containing protein  40.91 
 
 		 195 aa  104  6e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.880923  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  39.74 
 
 		 184 aa  103  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  41.56 
 
 		 219 aa  103  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0854  invertase/recombinase like protein  38.16 
 
 		 198 aa  102  2e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.160403  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1006  Resolvase domain protein  38.06 
 
 		 189 aa  102  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0235  resolvase domain-containing protein  38.56 
 
 		 187 aa  102  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1326  resolvase domain-containing protein  41.94 
 
 		 180 aa  102  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2363  resolvase-like protein  42.04 
 
 		 228 aa  102  3e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.379523  normal  0.343568 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  32.68 
 
 		 201 aa  102  3e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2392  Resolvase domain  38.16 
 
 		 197 aa  102  3e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000064315  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2550  Resolvase domain  41.94 
 
 		 196 aa  101  4e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.819685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0002  resolvase  35.53 
 
 		 190 aa  101  5e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141759  n/a   
 
 
-
 
NC_008264  CPR_B0006  resolvase  35.29 
 
 		 189 aa  100  6e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00548662  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  37.58 
 
 		 201 aa  100  8e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1052  Resolvase domain  35.48 
 
 		 186 aa  100  8e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01209  bacteriocin production protein  39.61 
 
 		 198 aa  100  9e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000702686  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1490  resolvase domain-containing protein  34.21 
 
 		 183 aa  99.8  1e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.832501  hitchhiker  0.00333462 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  37.97 
 
 		 188 aa  100  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009660  Krad_4707  resolvase domain-containing protein  44.16 
 
 		 190 aa  100  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  38.56 
 
 		 199 aa  100  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3045  Resolvase domain protein  36.71 
 
 		 189 aa  99.8  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0019  ISSod9, DNA-invertase  37.34 
 
 		 185 aa  99.8  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0170  ISSod9, DNA-invertase  37.34 
 
 		 185 aa  99.8  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.579928  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0039  resolvase  34.42 
 
 		 181 aa  99.4  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  37.97 
 
 		 185 aa  99  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4319  resolvase-like protein  36.6 
 
 		 206 aa  99.4  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2582  resolvase domain-containing protein  40.26 
 
 		 185 aa  99  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  38.46 
 
 		 188 aa  99  3e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2239  resolvase domain-containing protein  40.65 
 
 		 187 aa  98.2  4e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3678  Resolvase domain  37.82 
 
 		 190 aa  97.8  5e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134045  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0536  resolvase domain-containing protein  40.65 
 
 		 203 aa  97.8  5e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  37.34 
 
 		 185 aa  97.8  6e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  36.77 
 
 		 188 aa  97.4  7e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1711  integrative genetic element Gsu5, resolvase  40.26 
 
 		 190 aa  97.1  9e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2096  resolvase domain-containing protein  39.35 
 
 		 190 aa  97.1  9e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0211835 
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2813  resolvase-like protein  38.71 
 
 		 184 aa  96.3  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.493253  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3124  resolvase domain-containing protein  34.59 
 
 		 194 aa  96.7  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0904767  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0409  resolvase domain-containing protein  37.91 
 
 		 186 aa  96.3  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000318958  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0041  resolvase domain-containing protein  31.79 
 
 		 184 aa  96.7  1e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.0000573211 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2984  putative site-specific recombinases, DNA invertase Pin  38.31 
 
 		 203 aa  95.9  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200056  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5431  Resolvase domain protein  36.71 
 
 		 185 aa  95.5  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1397  invertase/recombinase like protein  39.23 
 
 		 176 aa  95.9  2e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0466  Resolvase domain  39.35 
 
 		 205 aa  95.5  2e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.418385  normal  0.0169839 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  36.71 
 
 		 185 aa  95.1  3e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0014  resolvase domain-containing protein  32.45 
 
 		 184 aa  94.7  4e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.125158  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3714  resolvase domain-containing protein  35.44 
 
 		 188 aa  94.4  5e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.566828  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4383  resolvase  36.71 
 
 		 193 aa  94.4  6e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0466  resolvase  36.08 
 
 		 193 aa  94  8e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.736746  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0052  hypothetical protein  39.35 
 
 		 201 aa  93.2  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2668  helix-turn-helix, Fis-type  38.61 
 
 		 204 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00804941  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0348  Resolvase domain protein  43.42 
 
 		 209 aa  92.4  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1568  helix-turn-helix, Fis-type  38.61 
 
 		 204 aa  92.8  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  33.54 
 
 		 188 aa  92  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4685  resolvase domain-containing protein  37.09 
 
 		 193 aa  92  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2027  resolvase domain-containing protein  37.74 
 
 		 185 aa  92  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D08  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  32.9 
 
 		 193 aa  92  3e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.942713  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4991  resolvase domain-containing protein  40.26 
 
 		 189 aa  92  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3562  resolvase domain-containing protein  36.3 
 
 		 208 aa  91.3  4e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6634  resolvase domain-containing protein  40.65 
 
 		 198 aa  91.7  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000708994  hitchhiker  0.0000367715 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5424  Resolvase domain  35.86 
 
 		 194 aa  91.3  4e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5457  hypothetical protein  35.86 
 
 		 194 aa  91.3  4e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  33.54 
 
 		 187 aa  91.7  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3670  resolvase domain-containing protein  36.13 
 
 		 185 aa  91.3  5e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  41.83 
 
 		 194 aa  90.9  6e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0086  resolvase family site-specific recombinase  36.71 
 
 		 196 aa  90.5  8e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.464664  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0189  resolvase domain-containing protein  36.71 
 
 		 206 aa  90.5  8e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  32.91 
 
 		 190 aa  90.5  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0108  hypothetical protein  37.42 
 
 		 309 aa  90.5  8e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1992  resolvase domain-containing protein  36.71 
 
 		 206 aa  90.5  8e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0260  resolvase family site-specific recombinase  36.31 
 
 		 205 aa  90.5  9e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1082  resolvase family site-specific recombinase  36.31 
 
 		 205 aa  90.5  9e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271311  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3477  resolvase domain-containing protein  36.71 
 
 		 196 aa  90.5  9e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4560  resolvase domain-containing protein  36.71 
 
 		 192 aa  89.7  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5126  Resolvase domain protein  38.56 
 
 		 197 aa  90.1  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.114051 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3683  resolvase domain-containing protein  38.71 
 
 		 215 aa  90.1  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>