More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_4319 on replicon NC_008538
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008538  Arth_4319  resolvase-like protein  100 
 
 		 206 aa  414  9.999999999999999e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1490  resolvase domain-containing protein  45.6 
 
 		 183 aa  165  5e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.832501  hitchhiker  0.00333462 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0014  resolvase domain-containing protein  45.9 
 
 		 184 aa  160  9e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.125158  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  43.33 
 
 		 199 aa  157  1e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  41.75 
 
 		 201 aa  156  2e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0041  resolvase domain-containing protein  44.51 
 
 		 184 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.0000573211 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  47.96 
 
 		 219 aa  154  1e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2392  Resolvase domain  46.74 
 
 		 197 aa  153  2e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000064315  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5396  resolvase domain-containing protein  44.13 
 
 		 180 aa  151  5.9999999999999996e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.859533  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2363  resolvase-like protein  50.86 
 
 		 228 aa  148  7e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.379523  normal  0.343568 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0466  resolvase  48.3 
 
 		 193 aa  148  7e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.736746  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0167  resolvase domain-containing protein  46.45 
 
 		 196 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0854  invertase/recombinase like protein  45.65 
 
 		 198 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.160403  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0409  resolvase domain-containing protein  47.22 
 
 		 186 aa  146  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000318958  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0052  hypothetical protein  46.77 
 
 		 201 aa  145  3e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0108  hypothetical protein  47.57 
 
 		 309 aa  145  3e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  46.93 
 
 		 191 aa  145  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5037  resolvase domain-containing protein  45.6 
 
 		 201 aa  145  3e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.931406  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  45.56 
 
 		 199 aa  144  6e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  47.49 
 
 		 188 aa  144  1e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2702  resolvase domain-containing protein  44.33 
 
 		 307 aa  144  1e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.264305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2944  resolvase domain-containing protein  44.33 
 
 		 307 aa  144  1e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.857733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4991  resolvase domain-containing protein  47.78 
 
 		 189 aa  144  1e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0039  resolvase  42.7 
 
 		 181 aa  142  4e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3714  resolvase domain-containing protein  43.55 
 
 		 188 aa  141  6e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.566828  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  48.6 
 
 		 182 aa  141  7e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  45.86 
 
 		 194 aa  141  7e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6307  resolvase domain-containing protein  47.16 
 
 		 209 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6634  resolvase domain-containing protein  48.6 
 
 		 198 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000708994  hitchhiker  0.0000367715 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  46.89 
 
 		 185 aa  140  9.999999999999999e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  43.17 
 
 		 201 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5431  Resolvase domain protein  46.33 
 
 		 185 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4383  resolvase  46.02 
 
 		 193 aa  140  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0235  resolvase domain-containing protein  45 
 
 		 187 aa  139  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2245  resolvase domain-containing protein  42.37 
 
 		 183 aa  140  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0071186  normal  0.011182 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4382  resolvase domain-containing protein  43.33 
 
 		 194 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21550  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  45.98 
 
 		 218 aa  139  3.9999999999999997e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.850113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  46.89 
 
 		 185 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1397  invertase/recombinase like protein  46.88 
 
 		 176 aa  137  8.999999999999999e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  40.96 
 
 		 192 aa  137  1e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2147  Resolvase domain protein  47.43 
 
 		 191 aa  137  1e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  43.92 
 
 		 188 aa  137  1e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009660  Krad_4707  resolvase domain-containing protein  51.67 
 
 		 190 aa  137  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4249  resolvase domain-containing protein  47.43 
 
 		 191 aa  137  1e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.251845 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  45.25 
 
 		 188 aa  137  2e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5126  Resolvase domain protein  46.41 
 
 		 197 aa  136  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.114051 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1615  resolvase family site-specific recombinase  47.75 
 
 		 197 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0536  resolvase domain-containing protein  46.41 
 
 		 203 aa  136  3.0000000000000003e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3553  resolvase domain-containing protein  44.07 
 
 		 181 aa  136  3.0000000000000003e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.467372  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0019  ISSod9, DNA-invertase  44.69 
 
 		 185 aa  134  8e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0170  ISSod9, DNA-invertase  44.69 
 
 		 185 aa  134  8e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.579928  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6748  resolvase domain-containing protein  45.86 
 
 		 201 aa  134  9e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.167425 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01209  bacteriocin production protein  40.1 
 
 		 198 aa  134  9.999999999999999e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000702686  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4685  resolvase domain-containing protein  44.38 
 
 		 193 aa  133  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  45.76 
 
 		 185 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1202  resolvase domain-containing protein  43.3 
 
 		 194 aa  133  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2813  resolvase-like protein  43.89 
 
 		 184 aa  132  3e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.493253  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6608  resolvase domain-containing protein  45.36 
 
 		 189 aa  132  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.525053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0095  resolvase domain-containing protein  44.79 
 
 		 189 aa  132  3e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4479  Resolvase domain protein  45.36 
 
 		 197 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000147912 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1852  Resolvase domain  45.36 
 
 		 197 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.064893  hitchhiker  0.000000000000388244 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1477  Resolvase domain  45.36 
 
 		 197 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.79192  unclonable  0.0000000000000150315 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9833  Resolvase Protein  43.62 
 
 		 210 aa  131  6e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5399  resolvase domain-containing protein  40.11 
 
 		 186 aa  131  6.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00909416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5424  Resolvase domain  46.37 
 
 		 194 aa  130  9e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5457  hypothetical protein  46.37 
 
 		 194 aa  130  9e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2746  resolvase domain-containing protein  40.41 
 
 		 197 aa  129  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2823  resolvase domain-containing protein  40.41 
 
 		 197 aa  129  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3007  resolvase-like protein  43.92 
 
 		 204 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0154323 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4042  serine-based site-specific recombinase activity  43.92 
 
 		 204 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.890679  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4975  serine-based site-specific recombinase activity  43.92 
 
 		 204 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.283487  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1093  Resolvase domain  46.74 
 
 		 196 aa  130  2.0000000000000002e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.531001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4123  resolvase domain-containing protein  44.07 
 
 		 185 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0694671 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2668  helix-turn-helix, Fis-type  43.39 
 
 		 204 aa  129  3e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00804941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3440  invertase/recombinase protein  45 
 
 		 188 aa  129  3e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.115695  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1568  helix-turn-helix, Fis-type  43.39 
 
 		 204 aa  129  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0002  resolvase  36.61 
 
 		 190 aa  128  6e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141759  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0233  resolvase  39.11 
 
 		 183 aa  128  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0202  resolvase  39.11 
 
 		 183 aa  128  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3694  resolvase domain-containing protein  44.15 
 
 		 206 aa  127  8.000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5450  resolvase domain-containing protein  42.94 
 
 		 184 aa  127  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008264  CPR_B0006  resolvase  36.96 
 
 		 189 aa  127  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00548662  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0068  resolvase  38.12 
 
 		 181 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0902003  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3847  resolvase-like protein  40.68 
 
 		 191 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.388128  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3045  Resolvase domain protein  40.78 
 
 		 189 aa  126  2.0000000000000002e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5339  DNA-invertase  45.88 
 
 		 192 aa  126  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.687343  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  40.45 
 
 		 188 aa  125  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20410  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  38.8 
 
 		 194 aa  125  5e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0661103 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3562  resolvase domain-containing protein  44.59 
 
 		 208 aa  125  5e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2172  recombinase  45.2 
 
 		 214 aa  125  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0678128  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  40.45 
 
 		 187 aa  124  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  40.45 
 
 		 190 aa  124  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0348  Resolvase domain protein  48.86 
 
 		 209 aa  124  1e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3683  resolvase domain-containing protein  43.62 
 
 		 215 aa  124  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4835  Resolvase domain protein  43.78 
 
 		 201 aa  124  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.291279 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1132  Resolvase domain  41.81 
 
 		 184 aa  124  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2111  Resolvase domain protein  45.29 
 
 		 191 aa  123  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.813305  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1006  Resolvase domain protein  40.68 
 
 		 189 aa  121  7e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2347  Resolvase domain protein  43.39 
 
 		 204 aa  121  9e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  40.78 
 
 		 188 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>