More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_5339 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_1852  Resolvase domain  100 
 
 		 197 aa  381  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.064893  hitchhiker  0.000000000000388244 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4479  Resolvase domain protein  100 
 
 		 197 aa  381  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000147912 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1477  Resolvase domain  100 
 
 		 197 aa  381  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.79192  unclonable  0.0000000000000150315 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5339  DNA-invertase  100 
 
 		 192 aa  381  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.687343  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2111  Resolvase domain protein  91.4 
 
 		 191 aa  342  1e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.813305  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5424  Resolvase domain  67.93 
 
 		 194 aa  256  1e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5457  hypothetical protein  67.93 
 
 		 194 aa  256  1e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3497  resolvase domain-containing protein  68.48 
 
 		 219 aa  233  2.0000000000000002e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.503079  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1104  resolvase domain-containing protein  68.48 
 
 		 219 aa  233  2.0000000000000002e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3606  resolvase domain-containing protein  68.48 
 
 		 219 aa  233  2.0000000000000002e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  0.996271 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3570  resolvase domain-containing protein  68.13 
 
 		 197 aa  228  5e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3007  resolvase-like protein  48.39 
 
 		 204 aa  171  5.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0154323 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4042  serine-based site-specific recombinase activity  48.39 
 
 		 204 aa  171  5.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.890679  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4975  serine-based site-specific recombinase activity  48.39 
 
 		 204 aa  171  5.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.283487  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3694  resolvase domain-containing protein  48.92 
 
 		 206 aa  165  2.9999999999999998e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2347  Resolvase domain protein  48.94 
 
 		 204 aa  164  5e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4249  resolvase domain-containing protein  60.43 
 
 		 191 aa  160  1e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.251845 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2147  Resolvase domain protein  60.43 
 
 		 191 aa  160  1e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9833  Resolvase Protein  49.15 
 
 		 210 aa  156  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6307  resolvase domain-containing protein  50.86 
 
 		 209 aa  156  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  44.74 
 
 		 191 aa  155  3e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4685  resolvase domain-containing protein  50.3 
 
 		 193 aa  155  4e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0019  ISSod9, DNA-invertase  48.31 
 
 		 185 aa  153  1e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0170  ISSod9, DNA-invertase  48.31 
 
 		 185 aa  153  1e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.579928  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  47.7 
 
 		 188 aa  153  1e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2668  helix-turn-helix, Fis-type  48.02 
 
 		 204 aa  152  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00804941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1568  helix-turn-helix, Fis-type  48.02 
 
 		 204 aa  152  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  48.55 
 
 		 188 aa  151  5e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3714  resolvase domain-containing protein  48.48 
 
 		 188 aa  151  7e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.566828  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  48.3 
 
 		 197 aa  150  8e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  44.2 
 
 		 188 aa  150  1e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  47.27 
 
 		 188 aa  150  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  47.09 
 
 		 182 aa  150  1e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6748  resolvase domain-containing protein  49.44 
 
 		 201 aa  150  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.167425 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  47.27 
 
 		 187 aa  149  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  46.56 
 
 		 194 aa  149  2e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  47.27 
 
 		 190 aa  149  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3683  resolvase domain-containing protein  48.6 
 
 		 215 aa  149  2e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  46.41 
 
 		 199 aa  149  3e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  47.98 
 
 		 185 aa  148  5e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  41.95 
 
 		 192 aa  147  7e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0854  invertase/recombinase like protein  46.11 
 
 		 198 aa  146  2.0000000000000003e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.160403  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  47.4 
 
 		 185 aa  146  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  46.59 
 
 		 184 aa  145  3e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.623719 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0409  resolvase domain-containing protein  44.57 
 
 		 186 aa  145  3e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000318958  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  46.07 
 
 		 188 aa  144  6e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  51.37 
 
 		 184 aa  144  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1397  invertase/recombinase like protein  54.55 
 
 		 176 aa  144  9e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5431  Resolvase domain protein  45.66 
 
 		 185 aa  144  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  46.24 
 
 		 185 aa  142  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0235  resolvase domain-containing protein  44.51 
 
 		 187 aa  142  3e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2823  resolvase domain-containing protein  41.95 
 
 		 197 aa  141  5e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2746  resolvase domain-containing protein  41.95 
 
 		 197 aa  141  5e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2332  resolvase domain-containing protein  43.23 
 
 		 227 aa  141  6e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  45.93 
 
 		 219 aa  141  6e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4991  resolvase domain-containing protein  45.6 
 
 		 189 aa  140  9e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2392  Resolvase domain  44.19 
 
 		 197 aa  139  1.9999999999999998e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000064315  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0991  resolvase domain-containing protein  40.96 
 
 		 205 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0378771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5037  resolvase domain-containing protein  42.47 
 
 		 201 aa  140  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.931406  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0466  resolvase  47.27 
 
 		 193 aa  139  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.736746  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0167  resolvase domain-containing protein  43.93 
 
 		 196 aa  139  3e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  45.4 
 
 		 188 aa  137  6e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3440  invertase/recombinase protein  43.82 
 
 		 188 aa  137  7.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.115695  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4123  resolvase domain-containing protein  46.06 
 
 		 185 aa  137  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0694671 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6403  resolvase domain-containing protein  45.86 
 
 		 193 aa  136  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6373  resolvase domain-containing protein  45.86 
 
 		 193 aa  136  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5459  resolvase domain-containing protein  44.44 
 
 		 190 aa  136  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6497  resolvase domain-containing protein  45.3 
 
 		 193 aa  134  5e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4383  resolvase  44.63 
 
 		 193 aa  135  5e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0108  hypothetical protein  42.94 
 
 		 309 aa  135  5e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3045  Resolvase domain protein  42.53 
 
 		 189 aa  134  6.0000000000000005e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5126  Resolvase domain protein  44.44 
 
 		 197 aa  133  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.114051 
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2813  resolvase-like protein  43.09 
 
 		 184 aa  133  9.999999999999999e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.493253  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3501  resolvase domain-containing protein  51.27 
 
 		 324 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.654072  n/a   
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6450  resolvase domain-containing protein  44.75 
 
 		 193 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3562  resolvase domain-containing protein  41.27 
 
 		 208 aa  132  3e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2172  recombinase  45.98 
 
 		 214 aa  132  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0678128  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2944  resolvase domain-containing protein  42.94 
 
 		 307 aa  132  3e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.857733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2702  resolvase domain-containing protein  42.94 
 
 		 307 aa  132  3e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.264305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D15  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  42.2 
 
 		 184 aa  131  5e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  46.48 
 
 		 201 aa  131  6.999999999999999e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6608  resolvase domain-containing protein  45.98 
 
 		 189 aa  130  9e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.525053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5093  resolvase domain-containing protein  43.18 
 
 		 201 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.993134 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5525  hypothetical protein  73.56 
 
 		 158 aa  128  5.0000000000000004e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0536  resolvase domain-containing protein  45.18 
 
 		 203 aa  127  7.000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201567  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2144  Resolvase domain protein  42.54 
 
 		 196 aa  127  8.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0618608  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0052  hypothetical protein  42.37 
 
 		 201 aa  127  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5436  Resolvase domain  43.17 
 
 		 193 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4105  resolvase domain-containing protein  50 
 
 		 293 aa  126  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.571135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29040  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  42.47 
 
 		 197 aa  126  2.0000000000000002e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.436309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4319  resolvase-like protein  45.88 
 
 		 206 aa  126  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3853  resolvase domain-containing protein  50 
 
 		 326 aa  126  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.363521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009660  Krad_4707  resolvase domain-containing protein  50.59 
 
 		 190 aa  124  6e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4835  Resolvase domain protein  42.54 
 
 		 201 aa  124  6e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.291279 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1052  Resolvase domain  42.53 
 
 		 186 aa  124  7e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21550  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  42.53 
 
 		 218 aa  124  9e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.850113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4026  resolvase domain-containing protein  49.28 
 
 		 298 aa  124  9e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.884346  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0022  resolvase-like protein  51.97 
 
 		 133 aa  123  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.119432  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2363  resolvase-like protein  45.78 
 
 		 228 aa  122  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.379523  normal  0.343568 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2258  resolvase domain-containing protein  40 
 
 		 195 aa  122  3e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.880923  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>