More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3501 on replicon NC_009469
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009469  Acry_3501  resolvase domain-containing protein  100 
 
 		 324 aa  635    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.654072  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4796  resolvase domain-containing protein  64.86 
 
 		 310 aa  343  2e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.271999  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9004  DNA invertase  58.12 
 
 		 313 aa  342  7e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4357  resolvase-like protein  58.14 
 
 		 309 aa  337  1.9999999999999998e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4026  resolvase domain-containing protein  57.28 
 
 		 298 aa  327  1.0000000000000001e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.884346  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3748  resolvase domain-containing protein  59.26 
 
 		 293 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.57685  normal  0.861996 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4105  resolvase domain-containing protein  58.59 
 
 		 293 aa  326  3e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.571135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_2482  TonB-dependent receptor protein  59.26 
 
 		 294 aa  326  4.0000000000000003e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4189  TonB-dependent receptor protein  58.92 
 
 		 294 aa  324  1e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3853  resolvase domain-containing protein  57.62 
 
 		 326 aa  324  1e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.363521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4320  hypothetical protein  59.6 
 
 		 293 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.264253 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5280  resolvase domain-containing protein  46.43 
 
 		 305 aa  236  4e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3914  resolvase domain-containing protein  47.16 
 
 		 293 aa  228  9e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.789856  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  54.74 
 
 		 188 aa  150  3e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  54.01 
 
 		 197 aa  149  5e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  54.01 
 
 		 184 aa  149  8e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.623719 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  53.28 
 
 		 184 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  49.03 
 
 		 188 aa  142  9e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0202  resolvase  44.59 
 
 		 183 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  48.75 
 
 		 219 aa  141  9.999999999999999e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0233  resolvase  44.59 
 
 		 183 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3714  resolvase domain-containing protein  46.96 
 
 		 188 aa  141  9.999999999999999e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.566828  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4479  Resolvase domain protein  51.53 
 
 		 197 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000147912 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0854  invertase/recombinase like protein  48.48 
 
 		 198 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.160403  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1477  Resolvase domain  51.53 
 
 		 197 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.79192  unclonable  0.0000000000000150315 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1852  Resolvase domain  51.53 
 
 		 197 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.064893  hitchhiker  0.000000000000388244 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2984  putative site-specific recombinases, DNA invertase Pin  45.26 
 
 		 203 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200056  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2392  Resolvase domain  46.15 
 
 		 197 aa  140  3e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000064315  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0108  hypothetical protein  51.45 
 
 		 309 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3045  Resolvase domain protein  51.09 
 
 		 189 aa  139  1e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5459  resolvase domain-containing protein  52.17 
 
 		 190 aa  137  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2396  resolvase domain-containing protein  53.9 
 
 		 163 aa  137  4e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.718289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  52.17 
 
 		 190 aa  136  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  52.17 
 
 		 187 aa  135  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  52.17 
 
 		 188 aa  135  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4991  resolvase domain-containing protein  51.63 
 
 		 189 aa  135  9.999999999999999e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1397  invertase/recombinase like protein  47.24 
 
 		 176 aa  135  9.999999999999999e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1052  Resolvase domain  49.64 
 
 		 186 aa  135  9.999999999999999e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0167  resolvase domain-containing protein  46.31 
 
 		 196 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  49.68 
 
 		 194 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6748  resolvase domain-containing protein  51.97 
 
 		 201 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.167425 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2702  resolvase domain-containing protein  50 
 
 		 307 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.264305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2944  resolvase domain-containing protein  50 
 
 		 307 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.857733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6307  resolvase domain-containing protein  49.67 
 
 		 209 aa  134  3e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4685  resolvase domain-containing protein  52.94 
 
 		 193 aa  134  3e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4249  resolvase domain-containing protein  54.74 
 
 		 191 aa  133  3.9999999999999996e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.251845 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2147  Resolvase domain protein  54.74 
 
 		 191 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0466  resolvase  45.56 
 
 		 193 aa  133  5e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.736746  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0052  hypothetical protein  50 
 
 		 201 aa  132  6e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5339  DNA-invertase  51.27 
 
 		 192 aa  132  6e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.687343  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  41.67 
 
 		 201 aa  132  7.999999999999999e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0068  resolvase  40.13 
 
 		 181 aa  132  9e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0902003  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  43.65 
 
 		 188 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5093  resolvase domain-containing protein  50.72 
 
 		 201 aa  130  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.993134 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  46.76 
 
 		 201 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  43.06 
 
 		 199 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2111  Resolvase domain protein  54.35 
 
 		 191 aa  129  8.000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.813305  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1006  Resolvase domain protein  41.94 
 
 		 189 aa  129  9.000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5431  Resolvase domain protein  48.91 
 
 		 185 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2813  resolvase-like protein  49.64 
 
 		 184 aa  127  3e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.493253  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4123  resolvase domain-containing protein  51.09 
 
 		 185 aa  127  3e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0694671 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  45.75 
 
 		 185 aa  127  3e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0041  resolvase domain-containing protein  39.24 
 
 		 184 aa  127  3e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.0000573211 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4835  Resolvase domain protein  50.78 
 
 		 201 aa  127  4.0000000000000003e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.291279 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  45.95 
 
 		 199 aa  127  4.0000000000000003e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  46.62 
 
 		 191 aa  126  5e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  45.52 
 
 		 188 aa  126  5e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0536  resolvase domain-containing protein  53.57 
 
 		 203 aa  126  6e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  42.31 
 
 		 185 aa  126  6e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2582  resolvase domain-containing protein  47.45 
 
 		 185 aa  126  6e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1711  integrative genetic element Gsu5, resolvase  45.99 
 
 		 190 aa  125  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5037  resolvase domain-containing protein  44.08 
 
 		 201 aa  125  1e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.931406  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4383  resolvase  50.74 
 
 		 193 aa  125  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3670  resolvase domain-containing protein  39.13 
 
 		 185 aa  125  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1202  resolvase domain-containing protein  45.51 
 
 		 194 aa  125  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  44.44 
 
 		 188 aa  124  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0235  resolvase domain-containing protein  45.89 
 
 		 187 aa  124  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0409  resolvase domain-containing protein  47.45 
 
 		 186 aa  124  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000318958  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6608  resolvase domain-containing protein  46.41 
 
 		 189 aa  124  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.525053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  48.18 
 
 		 185 aa  123  4e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2144  Resolvase domain protein  47.06 
 
 		 196 aa  123  4e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0618608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009660  Krad_4707  resolvase domain-containing protein  53.38 
 
 		 190 aa  123  4e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2096  resolvase domain-containing protein  49.62 
 
 		 190 aa  123  5e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0211835 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0014  resolvase domain-containing protein  39.62 
 
 		 184 aa  122  7e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.125158  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1818  Resolvase domain protein  50 
 
 		 184 aa  122  7e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.601257  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3662  Resolvase domain protein  40.99 
 
 		 188 aa  121  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1490  resolvase domain-containing protein  42.14 
 
 		 183 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.832501  hitchhiker  0.00333462 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6634  resolvase domain-containing protein  49.28 
 
 		 198 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000708994  hitchhiker  0.0000367715 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0019  ISSod9, DNA-invertase  42.46 
 
 		 185 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0170  ISSod9, DNA-invertase  42.46 
 
 		 185 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.579928  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3678  Resolvase domain  42 
 
 		 190 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134045  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3440  invertase/recombinase protein  46.36 
 
 		 188 aa  120  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.115695  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0095  resolvase domain-containing protein  44.87 
 
 		 189 aa  121  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3594  resolvase domain-containing protein  46.47 
 
 		 197 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.260682  hitchhiker  0.00636554 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5424  Resolvase domain  46.01 
 
 		 194 aa  120  3e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5457  hypothetical protein  46.01 
 
 		 194 aa  120  3e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1132  Resolvase domain  43.8 
 
 		 184 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0260  resolvase family site-specific recombinase  42.68 
 
 		 205 aa  119  7.999999999999999e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1082  resolvase family site-specific recombinase  42.68 
 
 		 205 aa  119  7.999999999999999e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271311  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2363  resolvase-like protein  48.32 
 
 		 228 aa  119  7.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.379523  normal  0.343568 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>