More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0108 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0108  hypothetical protein  100 
 
 		 309 aa  631  1e-180  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2702  resolvase domain-containing protein  67.2 
 
 		 307 aa  397  1e-109  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.264305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2944  resolvase domain-containing protein  67.2 
 
 		 307 aa  397  1e-109  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.857733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6634  resolvase domain-containing protein  69.63 
 
 		 198 aa  265  1e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000708994  hitchhiker  0.0000367715 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0052  hypothetical protein  66.49 
 
 		 201 aa  258  7e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0167  resolvase domain-containing protein  62.5 
 
 		 196 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4835  Resolvase domain protein  64.92 
 
 		 201 aa  241  1e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.291279 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  55.5 
 
 		 201 aa  224  2e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  53.61 
 
 		 219 aa  206  5e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  56.28 
 
 		 191 aa  199  7e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  53.55 
 
 		 182 aa  186  4e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0854  invertase/recombinase like protein  53.72 
 
 		 198 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.160403  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2392  Resolvase domain  55.14 
 
 		 197 aa  184  1.0000000000000001e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000064315  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0235  resolvase domain-containing protein  48.94 
 
 		 187 aa  184  1.0000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  53.55 
 
 		 194 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  50.27 
 
 		 199 aa  184  2.0000000000000003e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6307  resolvase domain-containing protein  57.14 
 
 		 209 aa  183  3e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0466  resolvase  52.2 
 
 		 193 aa  182  6e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.736746  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3440  invertase/recombinase protein  51.87 
 
 		 188 aa  181  1e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.115695  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0409  resolvase domain-containing protein  50.54 
 
 		 186 aa  181  1e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000318958  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6748  resolvase domain-containing protein  53.85 
 
 		 201 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.167425 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5126  Resolvase domain protein  55.14 
 
 		 197 aa  178  8e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.114051 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2147  Resolvase domain protein  53.37 
 
 		 191 aa  178  1e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4249  resolvase domain-containing protein  53.37 
 
 		 191 aa  178  1e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.251845 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0068  resolvase  47.54 
 
 		 181 aa  177  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0902003  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5037  resolvase domain-containing protein  48.33 
 
 		 201 aa  177  2e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.931406  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4383  resolvase  52.2 
 
 		 193 aa  177  2e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0348  Resolvase domain protein  57.3 
 
 		 209 aa  177  3e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2668  helix-turn-helix, Fis-type  54.12 
 
 		 204 aa  176  5e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00804941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1568  helix-turn-helix, Fis-type  54.12 
 
 		 204 aa  176  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  58.39 
 
 		 188 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4991  resolvase domain-containing protein  50.84 
 
 		 189 aa  173  2.9999999999999996e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  50.27 
 
 		 192 aa  172  5e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4685  resolvase domain-containing protein  49.45 
 
 		 193 aa  172  6.999999999999999e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5431  Resolvase domain protein  49.73 
 
 		 185 aa  172  7.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  53.85 
 
 		 184 aa  171  1e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.623719 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1490  resolvase domain-containing protein  48.13 
 
 		 183 aa  171  2e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.832501  hitchhiker  0.00333462 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  45.5 
 
 		 188 aa  171  2e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2813  resolvase-like protein  50.27 
 
 		 184 aa  170  3e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.493253  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  60 
 
 		 184 aa  169  4e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1397  invertase/recombinase like protein  60.14 
 
 		 176 aa  169  6e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  61.27 
 
 		 197 aa  169  7e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0536  resolvase domain-containing protein  47.5 
 
 		 203 aa  168  8e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0014  resolvase domain-containing protein  48.13 
 
 		 184 aa  168  1e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.125158  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0041  resolvase domain-containing protein  47.59 
 
 		 184 aa  168  1e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.0000573211 
 
 
-
 
NC_009660  Krad_4707  resolvase domain-containing protein  56.22 
 
 		 190 aa  168  1e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3714  resolvase domain-containing protein  49.18 
 
 		 188 aa  168  1e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.566828  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2823  resolvase domain-containing protein  49.19 
 
 		 197 aa  167  2e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2746  resolvase domain-containing protein  49.19 
 
 		 197 aa  167  2e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0095  resolvase domain-containing protein  47.31 
 
 		 189 aa  167  2e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0021  resolvase-like protein  56.22 
 
 		 189 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4137  resolvase domain-containing protein  49.73 
 
 		 224 aa  166  4e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.130251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0233  resolvase  45.9 
 
 		 183 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0202  resolvase  45.9 
 
 		 183 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4123  resolvase domain-containing protein  49.18 
 
 		 185 aa  163  3e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0694671 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  47.87 
 
 		 188 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  56.74 
 
 		 190 aa  162  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3683  resolvase domain-containing protein  53.61 
 
 		 215 aa  162  9e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0696  resolvase-like protein  55.14 
 
 		 190 aa  162  9e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  56.74 
 
 		 188 aa  162  9e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  46.6 
 
 		 188 aa  161  1e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  56.74 
 
 		 187 aa  161  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  48.91 
 
 		 185 aa  161  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1093  Resolvase domain  55.14 
 
 		 196 aa  160  3e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.531001  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0019  ISSod9, DNA-invertase  49.46 
 
 		 185 aa  159  4e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0170  ISSod9, DNA-invertase  49.46 
 
 		 185 aa  159  4e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.579928  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2347  Resolvase domain protein  48.45 
 
 		 204 aa  160  4e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9833  Resolvase Protein  51.06 
 
 		 210 aa  159  4e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1202  resolvase domain-containing protein  47.57 
 
 		 194 aa  159  4e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  48.37 
 
 		 185 aa  159  5e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2363  resolvase-like protein  47.54 
 
 		 228 aa  159  5e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.379523  normal  0.343568 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4459  resolvase  48.66 
 
 		 190 aa  159  5e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4290  resolvase  48.66 
 
 		 190 aa  159  5e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4190  resolvase  48.66 
 
 		 190 aa  159  5e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3007  resolvase-like protein  48.97 
 
 		 204 aa  159  6e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0154323 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4042  serine-based site-specific recombinase activity  48.97 
 
 		 204 aa  159  6e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.890679  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4975  serine-based site-specific recombinase activity  48.97 
 
 		 204 aa  159  6e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.283487  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5436  Resolvase domain  45.11 
 
 		 193 aa  159  7e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0991  resolvase domain-containing protein  48.97 
 
 		 205 aa  158  1e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0378771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  44.09 
 
 		 201 aa  158  1e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3694  resolvase domain-containing protein  50.53 
 
 		 206 aa  158  1e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6373  resolvase domain-containing protein  45.11 
 
 		 193 aa  157  3e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6403  resolvase domain-containing protein  45.11 
 
 		 193 aa  157  3e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2984  putative site-specific recombinases, DNA invertase Pin  44.13 
 
 		 203 aa  156  4e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200056  n/a   
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6497  resolvase domain-containing protein  45.11 
 
 		 193 aa  156  4e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6450  resolvase domain-containing protein  45.11 
 
 		 193 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  45.36 
 
 		 185 aa  155  7e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4382  resolvase domain-containing protein  43.65 
 
 		 194 aa  155  7e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3045  Resolvase domain protein  48.77 
 
 		 189 aa  154  1e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  44.09 
 
 		 199 aa  155  1e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4319  resolvase-like protein  48.92 
 
 		 206 aa  154  1e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4931  resolvase domain-containing protein  54.01 
 
 		 208 aa  155  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.107506  normal  0.566204 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5122  resolvase domain-containing protein  34.08 
 
 		 290 aa  152  8e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2258  resolvase domain-containing protein  45.05 
 
 		 195 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.880923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21550  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  46.59 
 
 		 218 aa  149  5e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.850113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5332  Resolvase domain protein  56.25 
 
 		 184 aa  149  6e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  41.3 
 
 		 188 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6608  resolvase domain-containing protein  51.32 
 
 		 189 aa  147  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.525053  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4479  Resolvase domain protein  43.75 
 
 		 197 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000147912 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1477  Resolvase domain  43.75 
 
 		 197 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.79192  unclonable  0.0000000000000150315 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>