More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_5436 on replicon NC_010727
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010727  Mpop_5436  Resolvase domain  100 
 
 
193 aa  393  1e-109  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6497  resolvase domain-containing protein  87.77 
 
 
193 aa  342  2e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6403  resolvase domain-containing protein  85.49 
 
 
193 aa  340  5e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6373  resolvase domain-containing protein  85.49 
 
 
193 aa  340  5e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6450  resolvase domain-containing protein  85.71 
 
 
193 aa  336  9.999999999999999e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2890  resolvase domain-containing protein  73.3 
 
 
241 aa  272  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0235  resolvase domain-containing protein  48.63 
 
 
187 aa  173  9.999999999999999e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  48.4 
 
 
199 aa  169  3e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  47.75 
 
 
182 aa  164  8e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0409  resolvase domain-containing protein  48.09 
 
 
186 aa  164  1.0000000000000001e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000318958  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  47.85 
 
 
191 aa  163  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  48.89 
 
 
194 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  46.84 
 
 
188 aa  161  4.0000000000000004e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4991  resolvase domain-containing protein  50 
 
 
189 aa  161  5.0000000000000005e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  47.25 
 
 
188 aa  160  8.000000000000001e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  46.7 
 
 
185 aa  160  1e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  46.7 
 
 
185 aa  160  1e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  46.74 
 
 
201 aa  159  3e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  46.15 
 
 
185 aa  159  3e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3045  Resolvase domain protein  48.65 
 
 
189 aa  158  5e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5431  Resolvase domain protein  46.15 
 
 
185 aa  157  8e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318584  normal 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0052  hypothetical protein  46.2 
 
 
201 aa  156  2e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0019  ISSod9, DNA-invertase  45.6 
 
 
185 aa  154  7e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0170  ISSod9, DNA-invertase  45.6 
 
 
185 aa  154  7e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.579928  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4249  resolvase domain-containing protein  48.02 
 
 
191 aa  153  1e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.251845 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2147  Resolvase domain protein  48.02 
 
 
191 aa  153  1e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009660  Krad_4707  resolvase domain-containing protein  51.41 
 
 
190 aa  153  1e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  46.89 
 
 
219 aa  153  1e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0108  hypothetical protein  45.11 
 
 
309 aa  153  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5037  resolvase domain-containing protein  45.2 
 
 
201 aa  152  2e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.931406  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  45.2 
 
 
188 aa  151  5e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5126  Resolvase domain protein  47.22 
 
 
197 aa  151  5.9999999999999996e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.114051 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6748  resolvase domain-containing protein  45.76 
 
 
201 aa  151  7e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.167425 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0167  resolvase domain-containing protein  44.57 
 
 
196 aa  151  7e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4123  resolvase domain-containing protein  45.05 
 
 
185 aa  150  1e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0694671 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  48.09 
 
 
188 aa  149  2e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  45.79 
 
 
197 aa  149  2e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3683  resolvase domain-containing protein  47.34 
 
 
215 aa  149  3e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6307  resolvase domain-containing protein  48.33 
 
 
209 aa  149  3e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  48.09 
 
 
184 aa  148  4e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4382  resolvase domain-containing protein  44.39 
 
 
194 aa  148  4e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  48.09 
 
 
184 aa  148  6e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.623719 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0536  resolvase domain-containing protein  46.89 
 
 
203 aa  148  6e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201567  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2668  helix-turn-helix, Fis-type  44.9 
 
 
204 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00804941  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2363  resolvase-like protein  44.81 
 
 
228 aa  147  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.379523  normal  0.343568 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1568  helix-turn-helix, Fis-type  44.9 
 
 
204 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3440  invertase/recombinase protein  41.94 
 
 
188 aa  146  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.115695  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3714  resolvase domain-containing protein  43.96 
 
 
188 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.566828  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2702  resolvase domain-containing protein  44.57 
 
 
307 aa  146  2.0000000000000003e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.264305  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2944  resolvase domain-containing protein  44.57 
 
 
307 aa  146  2.0000000000000003e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.857733  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  43.32 
 
 
188 aa  145  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6634  resolvase domain-containing protein  44.57 
 
 
198 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000708994  hitchhiker  0.0000367715 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2144  Resolvase domain protein  47.09 
 
 
196 aa  144  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0618608  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  43.78 
 
 
187 aa  144  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  43.78 
 
 
190 aa  142  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21550  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  45.71 
 
 
218 aa  143  2e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.850113  normal 
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2813  resolvase-like protein  42.62 
 
 
184 aa  142  3e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.493253  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0466  resolvase  46.41 
 
 
193 aa  142  3e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.736746  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5424  Resolvase domain  45.99 
 
 
194 aa  140  9e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5457  hypothetical protein  45.99 
 
 
194 aa  140  9e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0041  resolvase domain-containing protein  40.22 
 
 
184 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  decreased coverage  0.0000573211 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4835  Resolvase domain protein  44.02 
 
 
201 aa  140  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.291279 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0014  resolvase domain-containing protein  40.22 
 
 
184 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.125158  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4685  resolvase domain-containing protein  43.18 
 
 
193 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  40.21 
 
 
192 aa  138  4.999999999999999e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  41.21 
 
 
199 aa  138  4.999999999999999e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4479  Resolvase domain protein  44.44 
 
 
197 aa  137  8.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000147912 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1477  Resolvase domain  44.44 
 
 
197 aa  137  8.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.79192  unclonable  0.0000000000000150315 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1852  Resolvase domain  44.44 
 
 
197 aa  137  8.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.064893  hitchhiker  0.000000000000388244 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4383  resolvase  42.93 
 
 
193 aa  137  1e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1490  resolvase domain-containing protein  40.11 
 
 
183 aa  137  1e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.832501  hitchhiker  0.00333462 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0233  resolvase  40.22 
 
 
183 aa  136  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0202  resolvase  40.22 
 
 
183 aa  136  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3562  resolvase domain-containing protein  45.36 
 
 
208 aa  135  3.0000000000000003e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0095  resolvase domain-containing protein  41.44 
 
 
189 aa  135  3.0000000000000003e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1202  resolvase domain-containing protein  43.41 
 
 
194 aa  134  5e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0068  resolvase  39.34 
 
 
181 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0902003  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2392  Resolvase domain  41.85 
 
 
197 aa  133  9.999999999999999e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000064315  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1326  resolvase domain-containing protein  42.46 
 
 
180 aa  133  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0854  invertase/recombinase like protein  42.7 
 
 
198 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.160403  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  40.11 
 
 
201 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4137  resolvase domain-containing protein  41.49 
 
 
224 aa  132  3e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.130251  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0991  resolvase domain-containing protein  39.49 
 
 
205 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0378771  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5399  resolvase domain-containing protein  43.02 
 
 
186 aa  131  6e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00909416  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4488  DNA-invertase  40.66 
 
 
187 aa  131  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.258493  normal  0.0155508 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2172  recombinase  44.83 
 
 
214 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0678128  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  43.5 
 
 
188 aa  130  9e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0039  resolvase  40.78 
 
 
181 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2550  Resolvase domain  47.67 
 
 
196 aa  129  3e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.819685  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0348  Resolvase domain protein  46.33 
 
 
209 aa  128  4.0000000000000003e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5332  Resolvase domain protein  43.33 
 
 
184 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2111  Resolvase domain protein  44.02 
 
 
191 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.813305  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29040  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  41.36 
 
 
197 aa  128  6e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.436309  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4931  resolvase domain-containing protein  45.03 
 
 
208 aa  127  7.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.107506  normal  0.566204 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5339  DNA-invertase  43.17 
 
 
192 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.687343  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3007  resolvase-like protein  39.69 
 
 
204 aa  126  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0154323 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4042  serine-based site-specific recombinase activity  39.69 
 
 
204 aa  126  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.890679  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4975  serine-based site-specific recombinase activity  39.69 
 
 
204 aa  126  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.283487  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0073  resolvase  43.78 
 
 
184 aa  125  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6608  resolvase domain-containing protein  45.57 
 
 
189 aa  125  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.525053  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>