More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0854 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_0854  invertase/recombinase like protein  100 
 
 		 198 aa  401  1e-111  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.160403  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2392  Resolvase domain  85.13 
 
 		 197 aa  342  1e-93  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000064315  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1397  invertase/recombinase like protein  96.02 
 
 		 176 aa  341  5e-93  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1093  Resolvase domain  84.1 
 
 		 196 aa  314  6e-85  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.531001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2668  helix-turn-helix, Fis-type  53.12 
 
 		 204 aa  192  3e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00804941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1568  helix-turn-helix, Fis-type  53.12 
 
 		 204 aa  192  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6307  resolvase domain-containing protein  54.14 
 
 		 209 aa  190  1e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0991  resolvase domain-containing protein  50.79 
 
 		 205 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0378771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3007  resolvase-like protein  50.26 
 
 		 204 aa  182  3e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0154323 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4042  serine-based site-specific recombinase activity  50.26 
 
 		 204 aa  182  3e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.890679  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4975  serine-based site-specific recombinase activity  50.26 
 
 		 204 aa  182  3e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.283487  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9833  Resolvase Protein  49.22 
 
 		 210 aa  181  5.0000000000000004e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4685  resolvase domain-containing protein  51.91 
 
 		 193 aa  180  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2147  Resolvase domain protein  53.33 
 
 		 191 aa  180  1e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4249  resolvase domain-containing protein  53.33 
 
 		 191 aa  180  1e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.251845 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  51.09 
 
 		 219 aa  179  2e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0108  hypothetical protein  52.66 
 
 		 309 aa  179  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2347  Resolvase domain protein  49.22 
 
 		 204 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  50 
 
 		 191 aa  178  4e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2702  resolvase domain-containing protein  52.11 
 
 		 307 aa  177  8e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.264305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2944  resolvase domain-containing protein  52.11 
 
 		 307 aa  177  8e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.857733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3683  resolvase domain-containing protein  50 
 
 		 215 aa  176  2e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  51.61 
 
 		 201 aa  176  3e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0167  resolvase domain-containing protein  47.09 
 
 		 196 aa  175  4e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  51.65 
 
 		 182 aa  175  4e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6634  resolvase domain-containing protein  51.6 
 
 		 198 aa  174  8e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000708994  hitchhiker  0.0000367715 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0052  hypothetical protein  52.97 
 
 		 201 aa  174  9e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0409  resolvase domain-containing protein  50 
 
 		 186 aa  174  9.999999999999999e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000318958  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5431  Resolvase domain protein  49.73 
 
 		 185 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5457  hypothetical protein  47.78 
 
 		 194 aa  171  5e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5424  Resolvase domain  47.78 
 
 		 194 aa  171  5e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  50.84 
 
 		 199 aa  171  5e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3694  resolvase domain-containing protein  49.48 
 
 		 206 aa  171  6.999999999999999e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5126  Resolvase domain protein  51.08 
 
 		 197 aa  170  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.114051 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5037  resolvase domain-containing protein  46.88 
 
 		 201 aa  169  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.931406  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4835  Resolvase domain protein  52.66 
 
 		 201 aa  167  7e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.291279 
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2813  resolvase-like protein  50 
 
 		 184 aa  167  9e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.493253  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4383  resolvase  50.53 
 
 		 193 aa  167  9e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  51.63 
 
 		 188 aa  166  1e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0235  resolvase domain-containing protein  48.91 
 
 		 187 aa  166  1e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3440  invertase/recombinase protein  51.87 
 
 		 188 aa  166  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.115695  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3714  resolvase domain-containing protein  50.82 
 
 		 188 aa  166  2e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.566828  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0466  resolvase  51.1 
 
 		 193 aa  165  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.736746  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  49.73 
 
 		 188 aa  164  5.9999999999999996e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009660  Krad_4707  resolvase domain-containing protein  52.88 
 
 		 190 aa  164  1.0000000000000001e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0202  resolvase  46.45 
 
 		 183 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0233  resolvase  46.45 
 
 		 183 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6748  resolvase domain-containing protein  49.46 
 
 		 201 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.167425 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0068  resolvase  45.36 
 
 		 181 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0902003  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  48.37 
 
 		 185 aa  161  5.0000000000000005e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  48.92 
 
 		 194 aa  161  5.0000000000000005e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4123  resolvase domain-containing protein  48.09 
 
 		 185 aa  161  5.0000000000000005e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0694671 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  47.09 
 
 		 188 aa  160  1e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  45.26 
 
 		 199 aa  159  3e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  56.85 
 
 		 184 aa  159  3e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.623719 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  55.03 
 
 		 197 aa  159  3e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  47.28 
 
 		 185 aa  157  7e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0014  resolvase domain-containing protein  47.57 
 
 		 184 aa  157  9e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.125158  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  55.48 
 
 		 184 aa  157  1e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0041  resolvase domain-containing protein  46.74 
 
 		 184 aa  157  1e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.0000573211 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4991  resolvase domain-containing protein  48.07 
 
 		 189 aa  156  2e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  54.79 
 
 		 188 aa  155  3e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2363  resolvase-like protein  48.09 
 
 		 228 aa  155  4e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.379523  normal  0.343568 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  46.2 
 
 		 185 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4382  resolvase domain-containing protein  44.81 
 
 		 194 aa  154  6e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  44.57 
 
 		 192 aa  154  8e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4479  Resolvase domain protein  46.11 
 
 		 197 aa  154  8e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000147912 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1477  Resolvase domain  46.11 
 
 		 197 aa  154  8e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.79192  unclonable  0.0000000000000150315 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1852  Resolvase domain  46.11 
 
 		 197 aa  154  8e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.064893  hitchhiker  0.000000000000388244 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  43.68 
 
 		 201 aa  154  1e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1490  resolvase domain-containing protein  45.65 
 
 		 183 aa  153  2e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.832501  hitchhiker  0.00333462 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0019  ISSod9, DNA-invertase  47.28 
 
 		 185 aa  153  2e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0170  ISSod9, DNA-invertase  47.28 
 
 		 185 aa  153  2e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.579928  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3570  resolvase domain-containing protein  52.22 
 
 		 197 aa  151  5e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3497  resolvase domain-containing protein  52.22 
 
 		 219 aa  150  1e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.503079  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1104  resolvase domain-containing protein  52.22 
 
 		 219 aa  150  1e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3606  resolvase domain-containing protein  52.22 
 
 		 219 aa  150  1e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  0.996271 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0348  Resolvase domain protein  50.56 
 
 		 209 aa  150  1e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0095  resolvase domain-containing protein  45.11 
 
 		 189 aa  150  1e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2823  resolvase domain-containing protein  43.48 
 
 		 197 aa  150  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2746  resolvase domain-containing protein  43.48 
 
 		 197 aa  150  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2258  resolvase domain-containing protein  43.41 
 
 		 195 aa  148  6e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.880923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4319  resolvase-like protein  45.65 
 
 		 206 aa  147  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5339  DNA-invertase  46.11 
 
 		 192 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.687343  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1209  putative resolvase  53.9 
 
 		 176 aa  145  5e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3914  resolvase domain-containing protein  50 
 
 		 293 aa  144  6e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.789856  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0021  resolvase-like protein  49.18 
 
 		 189 aa  144  6e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5280  resolvase domain-containing protein  51.68 
 
 		 305 aa  144  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2111  Resolvase domain protein  44.02 
 
 		 191 aa  143  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.813305  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3501  resolvase domain-containing protein  48.48 
 
 		 324 aa  141  7e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.654072  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  43.08 
 
 		 188 aa  140  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1202  resolvase domain-containing protein  44.57 
 
 		 194 aa  140  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0536  resolvase domain-containing protein  47.31 
 
 		 203 aa  140  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4931  resolvase domain-containing protein  47.34 
 
 		 208 aa  139  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.107506  normal  0.566204 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3045  Resolvase domain protein  49.32 
 
 		 189 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  44.89 
 
 		 187 aa  139  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  44.89 
 
 		 190 aa  139  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3562  resolvase domain-containing protein  41.05 
 
 		 208 aa  139  3e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29040  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  43.09 
 
 		 197 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.436309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4668  resolvase domain-containing protein  44.57 
 
 		 189 aa  138  3.9999999999999997e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>