More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_21550 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_21550  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  100 
 
 		 218 aa  437  9.999999999999999e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.850113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2363  resolvase-like protein  67.19 
 
 		 228 aa  239  2e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.379523  normal  0.343568 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4991  resolvase domain-containing protein  55.62 
 
 		 189 aa  182  4.0000000000000006e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  55.49 
 
 		 219 aa  176  4e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  50 
 
 		 191 aa  172  2.9999999999999996e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  48.04 
 
 		 201 aa  172  3.9999999999999995e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  53.33 
 
 		 194 aa  171  9e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  50.85 
 
 		 185 aa  170  1e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0235  resolvase domain-containing protein  48.04 
 
 		 187 aa  169  3e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  51.14 
 
 		 185 aa  169  4e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  49.16 
 
 		 199 aa  169  4e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  51.43 
 
 		 182 aa  168  7e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5037  resolvase domain-containing protein  46.2 
 
 		 201 aa  164  8e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.931406  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  50 
 
 		 188 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  47.46 
 
 		 188 aa  163  2.0000000000000002e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  49.72 
 
 		 185 aa  162  3e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0466  resolvase  50.28 
 
 		 193 aa  162  5.0000000000000005e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.736746  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0409  resolvase domain-containing protein  50.3 
 
 		 186 aa  162  5.0000000000000005e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000318958  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5431  Resolvase domain protein  51.14 
 
 		 185 aa  160  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6307  resolvase domain-containing protein  50.58 
 
 		 209 aa  160  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3714  resolvase domain-containing protein  47.46 
 
 		 188 aa  159  2e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.566828  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  50 
 
 		 188 aa  159  3e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  47.54 
 
 		 188 aa  158  6e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0348  Resolvase domain protein  57.06 
 
 		 209 aa  157  1e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4383  resolvase  48.63 
 
 		 193 aa  157  1e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4382  resolvase domain-containing protein  45.99 
 
 		 194 aa  156  3e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  51.7 
 
 		 184 aa  156  3e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.623719 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4123  resolvase domain-containing protein  49.72 
 
 		 185 aa  155  4e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0694671 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3562  resolvase domain-containing protein  47.73 
 
 		 208 aa  155  6e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  51.14 
 
 		 184 aa  154  7e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3045  Resolvase domain protein  47.73 
 
 		 189 aa  153  2e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2813  resolvase-like protein  48.26 
 
 		 184 aa  153  2e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.493253  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4685  resolvase domain-containing protein  48.89 
 
 		 193 aa  153  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0536  resolvase domain-containing protein  48.26 
 
 		 203 aa  153  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  46.55 
 
 		 188 aa  152  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0019  ISSod9, DNA-invertase  47.73 
 
 		 185 aa  152  4e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0170  ISSod9, DNA-invertase  47.73 
 
 		 185 aa  152  4e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.579928  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  48.85 
 
 		 197 aa  152  4e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  46.55 
 
 		 187 aa  151  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  46.55 
 
 		 190 aa  151  8e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4249  resolvase domain-containing protein  50.59 
 
 		 191 aa  150  1e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.251845 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2147  Resolvase domain protein  50.59 
 
 		 191 aa  150  1e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3007  resolvase-like protein  50 
 
 		 204 aa  149  4e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0154323 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4042  serine-based site-specific recombinase activity  50 
 
 		 204 aa  149  4e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.890679  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4975  serine-based site-specific recombinase activity  50 
 
 		 204 aa  149  4e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.283487  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6748  resolvase domain-containing protein  52.35 
 
 		 201 aa  148  5e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.167425 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1818  Resolvase domain protein  51.72 
 
 		 184 aa  148  6e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.601257  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0095  resolvase domain-containing protein  45.2 
 
 		 189 aa  146  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3440  invertase/recombinase protein  45.93 
 
 		 188 aa  146  3e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.115695  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0108  hypothetical protein  46.59 
 
 		 309 aa  145  3e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  44.69 
 
 		 188 aa  145  6e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  40.91 
 
 		 199 aa  144  8.000000000000001e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  42.05 
 
 		 201 aa  144  1e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4835  Resolvase domain protein  50 
 
 		 201 aa  143  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.291279 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5436  Resolvase domain  45.71 
 
 		 193 aa  143  2e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009660  Krad_4707  resolvase domain-containing protein  52.02 
 
 		 190 aa  143  2e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0039  resolvase  43.18 
 
 		 181 aa  142  3e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1490  resolvase domain-containing protein  41.48 
 
 		 183 aa  142  3e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.832501  hitchhiker  0.00333462 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0167  resolvase domain-containing protein  45.45 
 
 		 196 aa  142  3e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6497  resolvase domain-containing protein  45.71 
 
 		 193 aa  142  4e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6608  resolvase domain-containing protein  49.12 
 
 		 189 aa  141  6e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.525053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1202  resolvase domain-containing protein  44.32 
 
 		 194 aa  141  6e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5396  resolvase domain-containing protein  44.25 
 
 		 180 aa  141  9e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.859533  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0041  resolvase domain-containing protein  39.77 
 
 		 184 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.0000573211 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0014  resolvase domain-containing protein  39.77 
 
 		 184 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.125158  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3694  resolvase domain-containing protein  47.34 
 
 		 206 aa  140  9.999999999999999e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3683  resolvase domain-containing protein  47.62 
 
 		 215 aa  141  9.999999999999999e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0021  resolvase-like protein  49.44 
 
 		 189 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6403  resolvase domain-containing protein  45.14 
 
 		 193 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6373  resolvase domain-containing protein  45.14 
 
 		 193 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4137  resolvase domain-containing protein  45.36 
 
 		 224 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.130251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2347  Resolvase domain protein  46.45 
 
 		 204 aa  139  3e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6450  resolvase domain-containing protein  45.14 
 
 		 193 aa  139  3e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2702  resolvase domain-containing protein  45.45 
 
 		 307 aa  139  3e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.264305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2944  resolvase domain-containing protein  45.45 
 
 		 307 aa  139  3e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.857733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0991  resolvase domain-containing protein  45 
 
 		 205 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0378771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4319  resolvase-like protein  44.62 
 
 		 206 aa  139  3.9999999999999997e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  40.45 
 
 		 192 aa  138  4.999999999999999e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2668  helix-turn-helix, Fis-type  47.98 
 
 		 204 aa  138  4.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00804941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1568  helix-turn-helix, Fis-type  47.98 
 
 		 204 aa  138  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01209  bacteriocin production protein  42.61 
 
 		 198 aa  137  1e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000702686  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3662  Resolvase domain protein  41.86 
 
 		 188 aa  137  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4668  resolvase domain-containing protein  46.02 
 
 		 189 aa  136  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9833  Resolvase Protein  46.82 
 
 		 210 aa  136  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4775  resolvase domain-containing protein  46.02 
 
 		 189 aa  136  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0149  resolvase  40.57 
 
 		 189 aa  137  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1615  resolvase family site-specific recombinase  50 
 
 		 197 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0068  resolvase  37.14 
 
 		 181 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0902003  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0854  invertase/recombinase like protein  42.94 
 
 		 198 aa  134  9.999999999999999e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.160403  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2392  Resolvase domain  42.7 
 
 		 197 aa  134  9.999999999999999e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000064315  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D15  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  42.7 
 
 		 184 aa  134  1.9999999999999998e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4459  resolvase  43.33 
 
 		 190 aa  133  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4290  resolvase  43.33 
 
 		 190 aa  133  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4190  resolvase  43.33 
 
 		 190 aa  133  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6634  resolvase domain-containing protein  43.01 
 
 		 198 aa  133  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000708994  hitchhiker  0.0000367715 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0073  resolvase  45.71 
 
 		 184 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2144  Resolvase domain protein  43.1 
 
 		 196 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0618608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0233  resolvase  36 
 
 		 183 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0219  DNA-invertase hin  45.14 
 
 		 184 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0242276 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0202  resolvase  36 
 
 		 183 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>