More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_5332 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_5332  Resolvase domain protein  100 
 
 
184 aa  361  3e-99  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4459  resolvase  76.8 
 
 
190 aa  281  5.000000000000001e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4290  resolvase  76.8 
 
 
190 aa  281  5.000000000000001e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4190  resolvase  76.8 
 
 
190 aa  281  5.000000000000001e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4137  resolvase domain-containing protein  75.14 
 
 
224 aa  276  2e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.130251  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  45.86 
 
 
188 aa  152  2.9999999999999998e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0235  resolvase domain-containing protein  47.49 
 
 
187 aa  150  7e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  45.3 
 
 
191 aa  150  8e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2944  resolvase domain-containing protein  48.6 
 
 
307 aa  150  1e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.857733  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  53.95 
 
 
184 aa  150  1e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.623719 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2702  resolvase domain-containing protein  48.6 
 
 
307 aa  150  1e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.264305  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0108  hypothetical protein  56.25 
 
 
309 aa  148  4e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  54.05 
 
 
188 aa  148  4e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  52.63 
 
 
184 aa  148  5e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  55.56 
 
 
197 aa  147  9e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4835  Resolvase domain protein  47.25 
 
 
201 aa  144  5e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.291279 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  46.93 
 
 
199 aa  145  5e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0052  hypothetical protein  52.94 
 
 
201 aa  143  1e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  48.09 
 
 
194 aa  142  2e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  49.15 
 
 
219 aa  142  3e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0409  resolvase domain-containing protein  47.49 
 
 
186 aa  141  4e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000318958  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0466  resolvase  45.56 
 
 
193 aa  140  9.999999999999999e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.736746  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  46.37 
 
 
182 aa  139  3e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  46.33 
 
 
190 aa  137  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  46.33 
 
 
187 aa  137  8.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6748  resolvase domain-containing protein  50.32 
 
 
201 aa  137  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.167425 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  46.63 
 
 
188 aa  137  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0014  resolvase domain-containing protein  42.78 
 
 
184 aa  136  1e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.125158  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3045  Resolvase domain protein  49.32 
 
 
189 aa  136  2e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0041  resolvase domain-containing protein  42.78 
 
 
184 aa  136  2e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  decreased coverage  0.0000573211 
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2813  resolvase-like protein  48.6 
 
 
184 aa  135  3.0000000000000003e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.493253  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  46.71 
 
 
201 aa  135  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5431  Resolvase domain protein  52.08 
 
 
185 aa  135  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318584  normal 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4991  resolvase domain-containing protein  44.94 
 
 
189 aa  134  6.0000000000000005e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0068  resolvase  41.34 
 
 
181 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0902003  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5093  resolvase domain-containing protein  45.9 
 
 
201 aa  131  5e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.993134 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4383  resolvase  43.33 
 
 
193 aa  131  6.999999999999999e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6307  resolvase domain-containing protein  53.57 
 
 
209 aa  130  9e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0202  resolvase  43.02 
 
 
183 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0991  resolvase domain-containing protein  47.31 
 
 
205 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0378771  normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0233  resolvase  43.02 
 
 
183 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1490  resolvase domain-containing protein  42.78 
 
 
183 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.832501  hitchhiker  0.00333462 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5037  resolvase domain-containing protein  44.25 
 
 
201 aa  129  3e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.931406  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5436  Resolvase domain  43.33 
 
 
193 aa  129  3e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9833  Resolvase Protein  47.83 
 
 
210 aa  128  4.0000000000000003e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  43.65 
 
 
185 aa  128  5.0000000000000004e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  43.4 
 
 
192 aa  128  5.0000000000000004e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  42.54 
 
 
188 aa  128  6e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0019  ISSod9, DNA-invertase  44.75 
 
 
185 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0170  ISSod9, DNA-invertase  44.75 
 
 
185 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.579928  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0167  resolvase domain-containing protein  44.51 
 
 
196 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  43.65 
 
 
185 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  43.09 
 
 
188 aa  126  2.0000000000000002e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3440  invertase/recombinase protein  46.75 
 
 
188 aa  126  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.115695  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2363  resolvase-like protein  44.13 
 
 
228 aa  126  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.379523  normal  0.343568 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2392  Resolvase domain  52.45 
 
 
197 aa  125  2.0000000000000002e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000064315  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3694  resolvase domain-containing protein  45.7 
 
 
206 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2172  recombinase  45.25 
 
 
214 aa  125  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0678128  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  46.63 
 
 
188 aa  125  3e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4249  resolvase domain-containing protein  49.67 
 
 
191 aa  125  4.0000000000000003e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.251845 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2147  Resolvase domain protein  49.67 
 
 
191 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6608  resolvase domain-containing protein  46.15 
 
 
189 aa  124  6e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.525053  normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4685  resolvase domain-containing protein  47.02 
 
 
193 aa  124  6e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6403  resolvase domain-containing protein  43.89 
 
 
193 aa  124  7e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6373  resolvase domain-containing protein  43.89 
 
 
193 aa  124  7e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3714  resolvase domain-containing protein  41.99 
 
 
188 aa  124  7e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.566828  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2984  putative site-specific recombinases, DNA invertase Pin  42.55 
 
 
203 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200056  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4123  resolvase domain-containing protein  51.39 
 
 
185 aa  124  8.000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0694671 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01209  bacteriocin production protein  40.68 
 
 
198 aa  124  8.000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000702686  n/a   
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6497  resolvase domain-containing protein  43.33 
 
 
193 aa  123  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0854  invertase/recombinase like protein  47.53 
 
 
198 aa  124  1e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.160403  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  42.54 
 
 
185 aa  123  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4105  resolvase domain-containing protein  45.29 
 
 
293 aa  123  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.571135  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3853  resolvase domain-containing protein  45.29 
 
 
326 aa  123  2e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.363521  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6634  resolvase domain-containing protein  45.6 
 
 
198 aa  122  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000708994  hitchhiker  0.0000367715 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0021  resolvase-like protein  46.41 
 
 
189 aa  122  2e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4775  resolvase domain-containing protein  51.08 
 
 
189 aa  123  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5126  Resolvase domain protein  54.93 
 
 
197 aa  123  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.114051 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4668  resolvase domain-containing protein  51.08 
 
 
189 aa  123  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6450  resolvase domain-containing protein  43.33 
 
 
193 aa  122  3e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3660  resolvase domain-containing protein  44.94 
 
 
202 aa  122  4e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009660  Krad_4707  resolvase domain-containing protein  52.29 
 
 
190 aa  121  6e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3683  resolvase domain-containing protein  48.11 
 
 
215 aa  121  6e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3007  resolvase-like protein  45.16 
 
 
204 aa  120  8e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0154323 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4042  serine-based site-specific recombinase activity  45.16 
 
 
204 aa  120  8e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.890679  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4975  serine-based site-specific recombinase activity  45.16 
 
 
204 aa  120  8e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.283487  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1397  invertase/recombinase like protein  46.34 
 
 
176 aa  120  9.999999999999999e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0536  resolvase domain-containing protein  44.44 
 
 
203 aa  120  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201567  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1052  Resolvase domain  45.33 
 
 
186 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3914  resolvase domain-containing protein  50.71 
 
 
293 aa  119  1.9999999999999998e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.789856  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2823  resolvase domain-containing protein  43.4 
 
 
197 aa  119  3e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2746  resolvase domain-containing protein  43.4 
 
 
197 aa  119  3e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4026  resolvase domain-containing protein  44.12 
 
 
298 aa  119  3e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.884346  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2668  helix-turn-helix, Fis-type  45.95 
 
 
204 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00804941  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1568  helix-turn-helix, Fis-type  45.95 
 
 
204 aa  118  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21550  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  44.19 
 
 
218 aa  118  4.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.850113  normal 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2347  Resolvase domain protein  44.09 
 
 
204 aa  118  6e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  38.89 
 
 
199 aa  118  6e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0086  resolvase family site-specific recombinase  37.29 
 
 
196 aa  117  7.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.464664  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0348  Resolvase domain protein  49.15 
 
 
209 aa  117  9.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>