More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0235 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_0235  resolvase domain-containing protein  100 
 
 
187 aa  379  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  85.03 
 
 
199 aa  328  3e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0409  resolvase domain-containing protein  84.24 
 
 
186 aa  322  3e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000318958  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  59.46 
 
 
188 aa  224  7e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  60.57 
 
 
194 aa  210  1e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4991  resolvase domain-containing protein  55.19 
 
 
189 aa  205  4e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  54.44 
 
 
182 aa  203  9e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  54.7 
 
 
219 aa  201  4e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  52.15 
 
 
201 aa  198  5e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6748  resolvase domain-containing protein  55 
 
 
201 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.167425 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4249  resolvase domain-containing protein  54.86 
 
 
191 aa  192  3e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.251845 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  53.89 
 
 
191 aa  192  3e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2147  Resolvase domain protein  54.86 
 
 
191 aa  192  3e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4685  resolvase domain-containing protein  53.63 
 
 
193 aa  191  5e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0019  ISSod9, DNA-invertase  54.55 
 
 
185 aa  190  1e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0170  ISSod9, DNA-invertase  54.55 
 
 
185 aa  190  1e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.579928  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  53.98 
 
 
185 aa  189  2e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  52.84 
 
 
188 aa  189  2e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5037  resolvase domain-containing protein  51.15 
 
 
201 aa  189  2e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.931406  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  53.41 
 
 
188 aa  188  2.9999999999999997e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  52.84 
 
 
185 aa  188  5e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4382  resolvase domain-containing protein  50.83 
 
 
194 aa  186  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  53.41 
 
 
197 aa  186  2e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2813  resolvase-like protein  51.91 
 
 
184 aa  184  6e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.493253  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  51.14 
 
 
185 aa  184  6e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  53.41 
 
 
184 aa  183  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.623719 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  48.13 
 
 
188 aa  182  3e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5431  Resolvase domain protein  51.14 
 
 
185 aa  182  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318584  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2702  resolvase domain-containing protein  52.13 
 
 
307 aa  181  7e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.264305  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2944  resolvase domain-containing protein  52.13 
 
 
307 aa  181  7e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.857733  normal 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0052  hypothetical protein  50.54 
 
 
201 aa  180  1e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1052  Resolvase domain  49.17 
 
 
186 aa  180  1e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0108  hypothetical protein  48.94 
 
 
309 aa  180  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5126  Resolvase domain protein  53.55 
 
 
197 aa  179  2e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.114051 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3714  resolvase domain-containing protein  50.57 
 
 
188 aa  179  2e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.566828  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0466  resolvase  51.15 
 
 
193 aa  178  2.9999999999999997e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.736746  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3045  Resolvase domain protein  48.86 
 
 
189 aa  178  2.9999999999999997e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0095  resolvase domain-containing protein  50.54 
 
 
189 aa  178  2.9999999999999997e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.386301 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  51.14 
 
 
184 aa  178  4e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3440  invertase/recombinase protein  48.09 
 
 
188 aa  177  4.999999999999999e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.115695  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4383  resolvase  51.72 
 
 
193 aa  178  4.999999999999999e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4123  resolvase domain-containing protein  51.7 
 
 
185 aa  176  2e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0694671 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  56.94 
 
 
188 aa  175  3e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5436  Resolvase domain  48.63 
 
 
193 aa  173  9.999999999999999e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0536  resolvase domain-containing protein  51.98 
 
 
203 aa  174  9.999999999999999e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201567  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2668  helix-turn-helix, Fis-type  50.82 
 
 
204 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00804941  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0202  resolvase  46.15 
 
 
183 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0233  resolvase  46.15 
 
 
183 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1568  helix-turn-helix, Fis-type  50.82 
 
 
204 aa  173  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1202  resolvase domain-containing protein  49.73 
 
 
194 aa  172  2.9999999999999996e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6497  resolvase domain-containing protein  48.63 
 
 
193 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6307  resolvase domain-containing protein  52.84 
 
 
209 aa  171  5e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2363  resolvase-like protein  52.87 
 
 
228 aa  171  5e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.379523  normal  0.343568 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0041  resolvase domain-containing protein  50.82 
 
 
184 aa  171  5e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  decreased coverage  0.0000573211 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2144  Resolvase domain protein  48.09 
 
 
196 aa  171  6.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0618608  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0348  Resolvase domain protein  57.14 
 
 
209 aa  171  6.999999999999999e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009660  Krad_4707  resolvase domain-containing protein  54.44 
 
 
190 aa  171  6.999999999999999e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6373  resolvase domain-containing protein  48.09 
 
 
193 aa  171  7.999999999999999e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6403  resolvase domain-containing protein  48.09 
 
 
193 aa  171  7.999999999999999e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6450  resolvase domain-containing protein  48.09 
 
 
193 aa  170  1e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0014  resolvase domain-containing protein  50.27 
 
 
184 aa  170  1e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.125158  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0167  resolvase domain-containing protein  45.5 
 
 
196 aa  169  2e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4137  resolvase domain-containing protein  48.95 
 
 
224 aa  169  2e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.130251  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3683  resolvase domain-containing protein  52.46 
 
 
215 aa  169  2e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21550  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  48.04 
 
 
218 aa  169  3e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.850113  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2984  putative site-specific recombinases, DNA invertase Pin  47.8 
 
 
203 aa  167  8e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200056  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2392  Resolvase domain  49.46 
 
 
197 aa  167  9e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000064315  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0854  invertase/recombinase like protein  48.91 
 
 
198 aa  166  1e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.160403  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9833  Resolvase Protein  51.1 
 
 
210 aa  166  1e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4835  Resolvase domain protein  48.91 
 
 
201 aa  166  1e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.291279 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0068  resolvase  45.45 
 
 
181 aa  166  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0902003  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2347  Resolvase domain protein  49.18 
 
 
204 aa  166  2e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  46.99 
 
 
199 aa  166  2e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1490  resolvase domain-containing protein  48.09 
 
 
183 aa  165  2.9999999999999998e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.832501  hitchhiker  0.00333462 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6634  resolvase domain-containing protein  44.68 
 
 
198 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000708994  hitchhiker  0.0000367715 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3007  resolvase-like protein  49.18 
 
 
204 aa  165  2.9999999999999998e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0154323 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4042  serine-based site-specific recombinase activity  49.18 
 
 
204 aa  165  2.9999999999999998e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.890679  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4975  serine-based site-specific recombinase activity  49.18 
 
 
204 aa  165  2.9999999999999998e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.283487  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4459  resolvase  47.62 
 
 
190 aa  164  5.9999999999999996e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4290  resolvase  47.62 
 
 
190 aa  164  5.9999999999999996e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4190  resolvase  47.62 
 
 
190 aa  164  5.9999999999999996e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  46.45 
 
 
201 aa  164  5.9999999999999996e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  47.13 
 
 
188 aa  163  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  47.13 
 
 
190 aa  162  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  47.13 
 
 
187 aa  162  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0991  resolvase domain-containing protein  48.63 
 
 
205 aa  160  1e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0378771  normal 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  45.41 
 
 
192 aa  159  2e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3694  resolvase domain-containing protein  49.18 
 
 
206 aa  159  2e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5093  resolvase domain-containing protein  45.76 
 
 
201 aa  159  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.993134 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2550  Resolvase domain  49.18 
 
 
196 aa  159  3e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.819685  normal 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5424  Resolvase domain  46.6 
 
 
194 aa  157  1e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5457  hypothetical protein  46.6 
 
 
194 aa  157  1e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2396  resolvase domain-containing protein  55.86 
 
 
163 aa  154  5.0000000000000005e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.718289  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1397  invertase/recombinase like protein  50.31 
 
 
176 aa  154  7e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2172  recombinase  49.15 
 
 
214 aa  154  8e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0678128  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4775  resolvase domain-containing protein  45.45 
 
 
189 aa  154  8e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4668  resolvase domain-containing protein  45.45 
 
 
189 aa  154  8e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5459  resolvase domain-containing protein  53.1 
 
 
190 aa  154  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358499  normal 
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2746  resolvase domain-containing protein  45.41 
 
 
197 aa  153  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2823  resolvase domain-containing protein  45.41 
 
 
197 aa  153  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>