More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_5424 on replicon NC_010727
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010721  Mpop_5457  hypothetical protein  100 
 
 		 194 aa  389  1e-107  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5424  Resolvase domain  100 
 
 		 194 aa  389  1e-107  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4479  Resolvase domain protein  68.78 
 
 		 197 aa  268  5e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000147912 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1852  Resolvase domain  68.78 
 
 		 197 aa  268  5e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.064893  hitchhiker  0.000000000000388244 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1477  Resolvase domain  68.78 
 
 		 197 aa  268  5e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.79192  unclonable  0.0000000000000150315 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5339  DNA-invertase  67.93 
 
 		 192 aa  256  1e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.687343  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2111  Resolvase domain protein  66.67 
 
 		 191 aa  248  3e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.813305  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3606  resolvase domain-containing protein  70.37 
 
 		 219 aa  245  3e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  0.996271 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3497  resolvase domain-containing protein  70.37 
 
 		 219 aa  245  3e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.503079  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1104  resolvase domain-containing protein  70.37 
 
 		 219 aa  245  3e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3570  resolvase domain-containing protein  70.59 
 
 		 197 aa  242  3e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3007  resolvase-like protein  53.01 
 
 		 204 aa  182  3e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0154323 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4042  serine-based site-specific recombinase activity  53.01 
 
 		 204 aa  182  3e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.890679  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4975  serine-based site-specific recombinase activity  53.01 
 
 		 204 aa  182  3e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.283487  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2347  Resolvase domain protein  54.05 
 
 		 204 aa  179  2e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  50.28 
 
 		 188 aa  172  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3694  resolvase domain-containing protein  50.82 
 
 		 206 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0854  invertase/recombinase like protein  47.78 
 
 		 198 aa  171  5e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.160403  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2147  Resolvase domain protein  51.69 
 
 		 191 aa  170  1e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4249  resolvase domain-containing protein  51.69 
 
 		 191 aa  170  1e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.251845 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9833  Resolvase Protein  50 
 
 		 210 aa  169  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6748  resolvase domain-containing protein  51.65 
 
 		 201 aa  169  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.167425 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  49.47 
 
 		 188 aa  169  3e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2668  helix-turn-helix, Fis-type  49.73 
 
 		 204 aa  168  4e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00804941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1568  helix-turn-helix, Fis-type  49.73 
 
 		 204 aa  168  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  49.73 
 
 		 199 aa  168  4e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0409  resolvase domain-containing protein  48.95 
 
 		 186 aa  167  8e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000318958  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  49.72 
 
 		 197 aa  167  1e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3683  resolvase domain-containing protein  49.18 
 
 		 215 aa  165  2.9999999999999998e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1397  invertase/recombinase like protein  53.79 
 
 		 176 aa  164  6.9999999999999995e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2392  Resolvase domain  46.67 
 
 		 197 aa  162  2.0000000000000002e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000064315  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6307  resolvase domain-containing protein  49.16 
 
 		 209 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4685  resolvase domain-containing protein  49.17 
 
 		 193 aa  160  8.000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  48.6 
 
 		 184 aa  160  1e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.623719 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  48.6 
 
 		 184 aa  160  2e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0991  resolvase domain-containing protein  44.26 
 
 		 205 aa  160  2e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0378771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3562  resolvase domain-containing protein  48.33 
 
 		 208 aa  158  4e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  45.76 
 
 		 188 aa  157  9e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  45.76 
 
 		 187 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  45.76 
 
 		 190 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0235  resolvase domain-containing protein  46.6 
 
 		 187 aa  157  1e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5126  Resolvase domain protein  47.03 
 
 		 197 aa  154  5.0000000000000005e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.114051 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  46.93 
 
 		 185 aa  153  1e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  46.93 
 
 		 185 aa  153  1e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4991  resolvase domain-containing protein  45.31 
 
 		 189 aa  152  4e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  46.37 
 
 		 188 aa  151  5e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  45.16 
 
 		 191 aa  148  4e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  45.81 
 
 		 185 aa  148  6e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  53.64 
 
 		 219 aa  147  7e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  47.49 
 
 		 194 aa  147  8e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5431  Resolvase domain protein  45.25 
 
 		 185 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318584  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3045  Resolvase domain protein  45.25 
 
 		 189 aa  146  2.0000000000000003e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  39.36 
 
 		 192 aa  145  4.0000000000000006e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3714  resolvase domain-containing protein  44.69 
 
 		 188 aa  144  6e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.566828  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0022  resolvase-like protein  56.06 
 
 		 133 aa  144  8.000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.119432  n/a   
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6497  resolvase domain-containing protein  45.16 
 
 		 193 aa  144  8.000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  50 
 
 		 182 aa  144  1e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2332  resolvase domain-containing protein  44.04 
 
 		 227 aa  143  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6373  resolvase domain-containing protein  45.16 
 
 		 193 aa  142  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6403  resolvase domain-containing protein  45.16 
 
 		 193 aa  142  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5037  resolvase domain-containing protein  43.82 
 
 		 201 aa  142  3e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.931406  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  46.84 
 
 		 201 aa  142  4e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0019  ISSod9, DNA-invertase  43.58 
 
 		 185 aa  141  5e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0170  ISSod9, DNA-invertase  43.58 
 
 		 185 aa  141  5e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.579928  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1093  Resolvase domain  46.67 
 
 		 196 aa  141  5e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.531001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0167  resolvase domain-containing protein  43.32 
 
 		 196 aa  140  8e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3440  invertase/recombinase protein  43.32 
 
 		 188 aa  140  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.115695  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5436  Resolvase domain  45.99 
 
 		 193 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  43.58 
 
 		 188 aa  140  9.999999999999999e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  45 
 
 		 188 aa  140  9.999999999999999e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2746  resolvase domain-containing protein  39.36 
 
 		 197 aa  139  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2823  resolvase domain-containing protein  39.36 
 
 		 197 aa  139  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6450  resolvase domain-containing protein  44.09 
 
 		 193 aa  139  3e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29040  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  42.11 
 
 		 197 aa  139  3e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.436309  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0052  hypothetical protein  41.53 
 
 		 201 aa  138  4.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5459  resolvase domain-containing protein  44.81 
 
 		 190 aa  138  4.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4123  resolvase domain-containing protein  45.81 
 
 		 185 aa  137  7.999999999999999e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0694671 
 
 
-
 
NC_009660  Krad_4707  resolvase domain-containing protein  52.46 
 
 		 190 aa  137  7.999999999999999e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2984  putative site-specific recombinases, DNA invertase Pin  47.44 
 
 		 203 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200056  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0108  hypothetical protein  50 
 
 		 309 aa  137  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0536  resolvase domain-containing protein  46.11 
 
 		 203 aa  136  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2702  resolvase domain-containing protein  43.85 
 
 		 307 aa  135  4e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.264305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2944  resolvase domain-containing protein  43.85 
 
 		 307 aa  135  4e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.857733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2813  resolvase-like protein  42.25 
 
 		 184 aa  134  9e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.493253  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1202  resolvase domain-containing protein  43.26 
 
 		 194 aa  134  9.999999999999999e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3678  Resolvase domain  44.05 
 
 		 190 aa  132  3e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134045  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6634  resolvase domain-containing protein  43.85 
 
 		 198 aa  132  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000708994  hitchhiker  0.0000367715 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4835  Resolvase domain protein  50.75 
 
 		 201 aa  131  5e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.291279 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2582  resolvase domain-containing protein  41.62 
 
 		 185 aa  131  5e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0466  resolvase  44.63 
 
 		 193 aa  131  6e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.736746  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4488  DNA-invertase  40.78 
 
 		 187 aa  131  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.258493  normal  0.0155508 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4319  resolvase-like protein  46.37 
 
 		 206 aa  130  7.999999999999999e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1818  Resolvase domain protein  46.45 
 
 		 184 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.601257  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1052  Resolvase domain  42.22 
 
 		 186 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2258  resolvase domain-containing protein  42.54 
 
 		 195 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.880923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4382  resolvase domain-containing protein  46.41 
 
 		 194 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2172  recombinase  51.03 
 
 		 214 aa  128  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0678128  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D15  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  40.88 
 
 		 184 aa  128  5.0000000000000004e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2363  resolvase-like protein  46.96 
 
 		 228 aa  127  7.000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.379523  normal  0.343568 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4383  resolvase  42.94 
 
 		 193 aa  127  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>