More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene plpp0052 on replicon NC_006365
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006365  plpp0052  hypothetical protein  100 
 
 
201 aa  405  1.0000000000000001e-112  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0108  hypothetical protein  66.49 
 
 
309 aa  251  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2702  resolvase domain-containing protein  64.92 
 
 
307 aa  249  3e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.264305  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2944  resolvase domain-containing protein  64.92 
 
 
307 aa  249  3e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.857733  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0167  resolvase domain-containing protein  60.94 
 
 
196 aa  243  9.999999999999999e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4835  Resolvase domain protein  64.92 
 
 
201 aa  235  3e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.291279 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6634  resolvase domain-containing protein  58.12 
 
 
198 aa  226  3e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000708994  hitchhiker  0.0000367715 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  57.61 
 
 
201 aa  214  8e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  54.3 
 
 
194 aa  192  3e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  50.54 
 
 
219 aa  185  4e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  52.46 
 
 
182 aa  184  9e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2392  Resolvase domain  54.59 
 
 
197 aa  183  2.0000000000000003e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000064315  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  52.46 
 
 
191 aa  182  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0466  resolvase  49.46 
 
 
193 aa  181  7e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.736746  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0235  resolvase domain-containing protein  50.54 
 
 
187 aa  180  2e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  50.27 
 
 
192 aa  178  5.999999999999999e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0409  resolvase domain-containing protein  50.54 
 
 
186 aa  177  7e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000318958  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2668  helix-turn-helix, Fis-type  51.05 
 
 
204 aa  176  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00804941  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4383  resolvase  49.45 
 
 
193 aa  176  2e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1568  helix-turn-helix, Fis-type  51.05 
 
 
204 aa  176  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  49.73 
 
 
199 aa  176  2e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5431  Resolvase domain protein  49.18 
 
 
185 aa  176  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318584  normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4685  resolvase domain-containing protein  50.27 
 
 
193 aa  174  6e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0854  invertase/recombinase like protein  52.97 
 
 
198 aa  174  9e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.160403  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5126  Resolvase domain protein  51.61 
 
 
197 aa  173  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.114051 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0068  resolvase  46.45 
 
 
181 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0902003  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3440  invertase/recombinase protein  48.94 
 
 
188 aa  173  1.9999999999999998e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.115695  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  48.04 
 
 
188 aa  172  1.9999999999999998e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2147  Resolvase domain protein  51.12 
 
 
191 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4249  resolvase domain-containing protein  51.12 
 
 
191 aa  172  2.9999999999999996e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.251845 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  49.21 
 
 
188 aa  172  3.9999999999999995e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2746  resolvase domain-containing protein  50.27 
 
 
197 aa  172  3.9999999999999995e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2823  resolvase domain-containing protein  50.27 
 
 
197 aa  172  3.9999999999999995e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0095  resolvase domain-containing protein  46.32 
 
 
189 aa  172  3.9999999999999995e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6748  resolvase domain-containing protein  51.4 
 
 
201 aa  171  7.999999999999999e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.167425 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6307  resolvase domain-containing protein  50 
 
 
209 aa  169  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5037  resolvase domain-containing protein  44.44 
 
 
201 aa  168  4e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.931406  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0233  resolvase  45.9 
 
 
183 aa  167  1e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0202  resolvase  45.9 
 
 
183 aa  167  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0991  resolvase domain-containing protein  48.42 
 
 
205 aa  166  2e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0378771  normal 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0019  ISSod9, DNA-invertase  49.73 
 
 
185 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0170  ISSod9, DNA-invertase  49.73 
 
 
185 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.579928  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3683  resolvase domain-containing protein  50.53 
 
 
215 aa  164  5.9999999999999996e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  48.63 
 
 
185 aa  164  8e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3714  resolvase domain-containing protein  49.18 
 
 
188 aa  164  8e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.566828  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0021  resolvase-like protein  55.43 
 
 
189 aa  164  9e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  50 
 
 
184 aa  163  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  48.63 
 
 
185 aa  163  1.0000000000000001e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  47.54 
 
 
188 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  50.56 
 
 
184 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.623719 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4123  resolvase domain-containing protein  48.63 
 
 
185 aa  163  2.0000000000000002e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0694671 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1490  resolvase domain-containing protein  47.59 
 
 
183 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.832501  hitchhiker  0.00333462 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9833  Resolvase Protein  47.87 
 
 
210 aa  161  6e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2347  Resolvase domain protein  48.45 
 
 
204 aa  160  9e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  47.54 
 
 
185 aa  160  1e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_009660  Krad_4707  resolvase domain-containing protein  52.25 
 
 
190 aa  160  1e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4991  resolvase domain-containing protein  48.04 
 
 
189 aa  160  1e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2813  resolvase-like protein  48.62 
 
 
184 aa  160  2e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.493253  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4382  resolvase domain-containing protein  45.95 
 
 
194 aa  159  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1397  invertase/recombinase like protein  53.29 
 
 
176 aa  157  8e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3694  resolvase domain-containing protein  48.95 
 
 
206 aa  157  8e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  47.51 
 
 
188 aa  157  9e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3007  resolvase-like protein  48.97 
 
 
204 aa  157  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0154323 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4042  serine-based site-specific recombinase activity  48.97 
 
 
204 aa  157  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.890679  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4975  serine-based site-specific recombinase activity  48.97 
 
 
204 aa  157  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.283487  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1093  Resolvase domain  54.05 
 
 
196 aa  157  1e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.531001  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2258  resolvase domain-containing protein  44.51 
 
 
195 aa  157  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.880923  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0696  resolvase-like protein  54.35 
 
 
190 aa  156  2e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6403  resolvase domain-containing protein  44.62 
 
 
193 aa  156  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5436  Resolvase domain  46.2 
 
 
193 aa  156  2e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6373  resolvase domain-containing protein  44.62 
 
 
193 aa  156  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6497  resolvase domain-containing protein  45.31 
 
 
193 aa  155  4e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6450  resolvase domain-containing protein  45.65 
 
 
193 aa  155  4e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  47.22 
 
 
197 aa  155  4e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6608  resolvase domain-containing protein  44.74 
 
 
189 aa  155  6e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.525053  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0536  resolvase domain-containing protein  47.22 
 
 
203 aa  154  8e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201567  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3045  Resolvase domain protein  44.39 
 
 
189 aa  153  2e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4459  resolvase  47.37 
 
 
190 aa  153  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4290  resolvase  47.37 
 
 
190 aa  153  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4190  resolvase  47.37 
 
 
190 aa  153  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2984  putative site-specific recombinases, DNA invertase Pin  49.65 
 
 
203 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200056  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0348  Resolvase domain protein  50.56 
 
 
209 aa  152  4e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4137  resolvase domain-containing protein  45.55 
 
 
224 aa  151  5.9999999999999996e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.130251  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0041  resolvase domain-containing protein  45.99 
 
 
184 aa  148  5e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  decreased coverage  0.0000573211 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  44.75 
 
 
190 aa  147  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  44.75 
 
 
188 aa  147  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  44.75 
 
 
187 aa  147  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0014  resolvase domain-containing protein  45.45 
 
 
184 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.125158  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_2482  TonB-dependent receptor protein  50 
 
 
294 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3853  resolvase domain-containing protein  50 
 
 
326 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.363521  normal 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4189  TonB-dependent receptor protein  49.35 
 
 
294 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4105  resolvase domain-containing protein  50 
 
 
293 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.571135  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4931  resolvase domain-containing protein  49.2 
 
 
208 aa  145  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.107506  normal  0.566204 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4319  resolvase-like protein  46.77 
 
 
206 aa  145  3e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4026  resolvase domain-containing protein  49.35 
 
 
298 aa  144  6e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.884346  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3748  resolvase domain-containing protein  48.7 
 
 
293 aa  144  6e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.57685  normal  0.861996 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4320  hypothetical protein  48.7 
 
 
293 aa  144  9e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.264253 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5332  Resolvase domain protein  52.94 
 
 
184 aa  143  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1202  resolvase domain-containing protein  43.78 
 
 
194 aa  143  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  41.62 
 
 
199 aa  142  3e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>