More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_4026 on replicon NC_009957
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009957  Dshi_4026  resolvase domain-containing protein  100 
 
 		 298 aa  593  1e-168  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.884346  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4105  resolvase domain-containing protein  94.54 
 
 		 293 aa  556  1e-157  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.571135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3853  resolvase domain-containing protein  93.86 
 
 		 326 aa  552  1e-156  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.363521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3748  resolvase domain-containing protein  87.71 
 
 		 293 aa  515  1.0000000000000001e-145  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.57685  normal  0.861996 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_2482  TonB-dependent receptor protein  86.69 
 
 		 294 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4189  TonB-dependent receptor protein  85.67 
 
 		 294 aa  510  1e-144  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4320  hypothetical protein  86.01 
 
 		 293 aa  482  1e-135  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.264253 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3501  resolvase domain-containing protein  57.28 
 
 		 324 aa  327  1.0000000000000001e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.654072  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4357  resolvase-like protein  51.2 
 
 		 309 aa  284  1.0000000000000001e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9004  DNA invertase  50.86 
 
 		 313 aa  283  3.0000000000000004e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4796  resolvase domain-containing protein  53.4 
 
 		 310 aa  277  1e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.271999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5280  resolvase domain-containing protein  51.19 
 
 		 305 aa  269  4e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3914  resolvase domain-containing protein  46.58 
 
 		 293 aa  249  5e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.789856  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  49.4 
 
 		 219 aa  154  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  54 
 
 		 188 aa  152  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6748  resolvase domain-containing protein  51.28 
 
 		 201 aa  151  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.167425 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2147  Resolvase domain protein  53.06 
 
 		 191 aa  151  1e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4249  resolvase domain-containing protein  53.06 
 
 		 191 aa  151  1e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.251845 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5459  resolvase domain-containing protein  55.07 
 
 		 190 aa  149  6e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  52.74 
 
 		 197 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3045  Resolvase domain protein  51.82 
 
 		 189 aa  147  3e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  54.01 
 
 		 184 aa  146  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2702  resolvase domain-containing protein  51.45 
 
 		 307 aa  146  4.0000000000000006e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.264305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2944  resolvase domain-containing protein  51.45 
 
 		 307 aa  146  4.0000000000000006e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.857733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  54.01 
 
 		 184 aa  146  5e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.623719 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  50.35 
 
 		 188 aa  145  6e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0052  hypothetical protein  49.35 
 
 		 201 aa  144  1e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  47.02 
 
 		 191 aa  144  3e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1052  Resolvase domain  52.55 
 
 		 186 aa  142  5e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4991  resolvase domain-containing protein  53.16 
 
 		 189 aa  142  6e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5093  resolvase domain-containing protein  52.17 
 
 		 201 aa  141  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.993134 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0235  resolvase domain-containing protein  50 
 
 		 187 aa  142  9.999999999999999e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0108  hypothetical protein  50 
 
 		 309 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2984  putative site-specific recombinases, DNA invertase Pin  51.72 
 
 		 203 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200056  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0167  resolvase domain-containing protein  47.59 
 
 		 196 aa  140  3e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  50 
 
 		 199 aa  140  3e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0409  resolvase domain-containing protein  50 
 
 		 186 aa  139  3.9999999999999997e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000318958  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4685  resolvase domain-containing protein  48.39 
 
 		 193 aa  139  4.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  50 
 
 		 182 aa  139  6e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  50.62 
 
 		 194 aa  139  7e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  52.48 
 
 		 187 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  52.48 
 
 		 190 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  51.82 
 
 		 188 aa  137  2e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  52.48 
 
 		 188 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3714  resolvase domain-containing protein  50.36 
 
 		 188 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.566828  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5037  resolvase domain-containing protein  47.37 
 
 		 201 aa  137  3.0000000000000003e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.931406  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4835  Resolvase domain protein  50.78 
 
 		 201 aa  136  4e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.291279 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1711  integrative genetic element Gsu5, resolvase  48.92 
 
 		 190 aa  136  5e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2096  resolvase domain-containing protein  53.38 
 
 		 190 aa  136  5e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0211835 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2392  Resolvase domain  46.88 
 
 		 197 aa  135  8e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000064315  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6307  resolvase domain-containing protein  50.72 
 
 		 209 aa  135  9e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  46.15 
 
 		 201 aa  135  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0854  invertase/recombinase like protein  45.62 
 
 		 198 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.160403  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  50.36 
 
 		 185 aa  133  3e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_009660  Krad_4707  resolvase domain-containing protein  49.7 
 
 		 190 aa  132  5e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2396  resolvase domain-containing protein  50.35 
 
 		 163 aa  132  5e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.718289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5431  Resolvase domain protein  49.64 
 
 		 185 aa  132  6e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  49.64 
 
 		 185 aa  132  6.999999999999999e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4479  Resolvase domain protein  49.65 
 
 		 197 aa  132  7.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000147912 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1477  Resolvase domain  49.65 
 
 		 197 aa  132  7.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.79192  unclonable  0.0000000000000150315 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1852  Resolvase domain  49.65 
 
 		 197 aa  132  7.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.064893  hitchhiker  0.000000000000388244 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  48.91 
 
 		 188 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2813  resolvase-like protein  49.64 
 
 		 184 aa  132  9e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.493253  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  46.9 
 
 		 188 aa  131  1.0000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1397  invertase/recombinase like protein  45.28 
 
 		 176 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  46.41 
 
 		 185 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6634  resolvase domain-containing protein  47.1 
 
 		 198 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000708994  hitchhiker  0.0000367715 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2550  Resolvase domain  49.02 
 
 		 196 aa  129  8.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.819685  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2144  Resolvase domain protein  47.06 
 
 		 196 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0618608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3670  resolvase domain-containing protein  45.32 
 
 		 185 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0019  ISSod9, DNA-invertase  49.64 
 
 		 185 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0170  ISSod9, DNA-invertase  49.64 
 
 		 185 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.579928  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1132  Resolvase domain  46.04 
 
 		 184 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0536  resolvase domain-containing protein  48.05 
 
 		 203 aa  126  4.0000000000000003e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1202  resolvase domain-containing protein  49.64 
 
 		 194 aa  126  4.0000000000000003e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0466  resolvase  46.15 
 
 		 193 aa  125  7e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.736746  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1818  Resolvase domain protein  51.64 
 
 		 184 aa  124  1e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.601257  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0068  resolvase  41.96 
 
 		 181 aa  125  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0902003  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  44.93 
 
 		 201 aa  124  1e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4123  resolvase domain-containing protein  47.45 
 
 		 185 aa  124  1e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0694671 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  45 
 
 		 192 aa  124  2e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2172  recombinase  49.64 
 
 		 214 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0678128  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5339  DNA-invertase  49.28 
 
 		 192 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.687343  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0202  resolvase  43.17 
 
 		 183 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0233  resolvase  43.17 
 
 		 183 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3440  invertase/recombinase protein  47.26 
 
 		 188 aa  123  3e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.115695  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4668  resolvase domain-containing protein  45.75 
 
 		 189 aa  124  3e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4775  resolvase domain-containing protein  45.75 
 
 		 189 aa  124  3e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2746  resolvase domain-containing protein  45 
 
 		 197 aa  123  3e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2823  resolvase domain-containing protein  45 
 
 		 197 aa  123  3e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  44.93 
 
 		 199 aa  123  4e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6608  resolvase domain-containing protein  40.53 
 
 		 189 aa  122  5e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.525053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4459  resolvase  44.59 
 
 		 190 aa  122  5e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4290  resolvase  44.59 
 
 		 190 aa  122  5e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4190  resolvase  44.59 
 
 		 190 aa  122  5e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5126  Resolvase domain protein  45.7 
 
 		 197 aa  122  7e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.114051 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3553  resolvase domain-containing protein  47.55 
 
 		 181 aa  122  7e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.467372  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4382  resolvase domain-containing protein  48.57 
 
 		 194 aa  122  9e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0348  Resolvase domain protein  50.41 
 
 		 209 aa  122  9e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0041  resolvase domain-containing protein  37.87 
 
 		 184 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.0000573211 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>