More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1711 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1711  integrative genetic element Gsu5, resolvase  100 
 
 		 190 aa  382  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1132  Resolvase domain  69.57 
 
 		 184 aa  265  2e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2582  resolvase domain-containing protein  72.13 
 
 		 185 aa  264  5e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3670  resolvase domain-containing protein  68.65 
 
 		 185 aa  261  6e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3678  Resolvase domain  69.4 
 
 		 190 aa  257  6e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134045  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1006  Resolvase domain protein  65.03 
 
 		 189 aa  239  2e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2355  Resolvase domain protein  61.8 
 
 		 186 aa  216  1e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.230305  normal  0.6636 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2095  Resolvase domain protein  58.89 
 
 		 203 aa  202  2e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4091  Resolvase domain  55.91 
 
 		 186 aa  200  9e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2239  resolvase domain-containing protein  56.28 
 
 		 187 aa  200  9.999999999999999e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010504  Mrad2831_6517  resolvase domain-containing protein  56.67 
 
 		 185 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6388  resolvase domain-containing protein  56.42 
 
 		 191 aa  192  3e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0260  resolvase family site-specific recombinase  52.49 
 
 		 205 aa  187  1e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1082  resolvase family site-specific recombinase  52.49 
 
 		 205 aa  187  1e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271311  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2027  resolvase domain-containing protein  51.91 
 
 		 185 aa  179  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0466  Resolvase domain  50 
 
 		 205 aa  175  5e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.418385  normal  0.0169839 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0938  site-specific recombinase  59.72 
 
 		 154 aa  164  5e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0039  resolvase  45.81 
 
 		 181 aa  161  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  43.89 
 
 		 188 aa  155  4e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2147  Resolvase domain protein  45.2 
 
 		 191 aa  154  9e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4249  resolvase domain-containing protein  45.2 
 
 		 191 aa  154  9e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.251845 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7006  hypothetical protein  48.9 
 
 		 183 aa  153  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5396  resolvase domain-containing protein  45.71 
 
 		 180 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.859533  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  40.11 
 
 		 188 aa  151  4e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01209  bacteriocin production protein  46.93 
 
 		 198 aa  152  4e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000702686  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  42.05 
 
 		 188 aa  150  8.999999999999999e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_010374  M446_7059  hypothetical protein  47.22 
 
 		 183 aa  150  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  42.7 
 
 		 201 aa  150  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3714  resolvase domain-containing protein  40.45 
 
 		 188 aa  150  1e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.566828  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1326  resolvase domain-containing protein  48.89 
 
 		 180 aa  150  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  41.57 
 
 		 185 aa  149  2e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  42.13 
 
 		 185 aa  149  3e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  40.45 
 
 		 185 aa  148  4e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  39.33 
 
 		 188 aa  147  6e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5459  resolvase domain-containing protein  44.09 
 
 		 190 aa  147  6e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3112  Resolvase domain protein  48.11 
 
 		 184 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6405  resolvase domain-containing protein  46.41 
 
 		 185 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6748  resolvase domain-containing protein  43.65 
 
 		 201 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.167425 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4383  resolvase  42.94 
 
 		 193 aa  145  3e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6810  Resolvase domain protein  45.86 
 
 		 185 aa  144  5e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.67902  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0816  resolvase domain-containing protein  45.86 
 
 		 185 aa  145  5e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4685  resolvase domain-containing protein  41.85 
 
 		 193 aa  145  5e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4123  resolvase domain-containing protein  42.7 
 
 		 185 aa  144  8.000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0694671 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0466  resolvase  41.24 
 
 		 193 aa  143  1e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.736746  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  46.45 
 
 		 188 aa  142  3e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5397  Resolvase domain protein  44.75 
 
 		 185 aa  141  5e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4560  resolvase domain-containing protein  41.36 
 
 		 192 aa  141  5e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  42.05 
 
 		 197 aa  141  6e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5431  Resolvase domain protein  39.89 
 
 		 185 aa  141  7e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6307  resolvase domain-containing protein  41.95 
 
 		 209 aa  141  7e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  41.34 
 
 		 184 aa  140  8e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5519  Resolvase domain  42.22 
 
 		 197 aa  140  8e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.176111  normal  0.515657 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1052  Resolvase domain  40.11 
 
 		 186 aa  140  9.999999999999999e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  39.89 
 
 		 188 aa  140  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0189  resolvase domain-containing protein  42.02 
 
 		 206 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  42.78 
 
 		 182 aa  140  9.999999999999999e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4885  resolvase domain-containing protein  43.33 
 
 		 187 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1992  resolvase domain-containing protein  42.02 
 
 		 206 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6417  resolvase domain-containing protein  42.78 
 
 		 196 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0011  RlgA  45.41 
 
 		 186 aa  139  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.928686  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0086  resolvase family site-specific recombinase  41.18 
 
 		 196 aa  139  3e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.464664  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  39.33 
 
 		 187 aa  139  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5399  resolvase domain-containing protein  40.88 
 
 		 186 aa  139  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00909416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  38.04 
 
 		 190 aa  139  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4105  resolvase domain-containing protein  48.92 
 
 		 293 aa  138  3.9999999999999997e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.571135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3124  resolvase domain-containing protein  49.65 
 
 		 194 aa  138  4.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0904767  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1615  resolvase family site-specific recombinase  45.81 
 
 		 197 aa  138  6e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5093  resolvase domain-containing protein  43.48 
 
 		 201 aa  138  6e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.993134 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3477  resolvase domain-containing protein  41.18 
 
 		 196 aa  138  6e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5628  Resolvase domain  41.11 
 
 		 198 aa  138  6e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.526216 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3853  resolvase domain-containing protein  48.92 
 
 		 326 aa  138  6e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.363521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0068  resolvase  37.78 
 
 		 181 aa  137  7e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0902003  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  39.13 
 
 		 199 aa  137  7e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0155  resolvase x  41.08 
 
 		 193 aa  137  7.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  41.34 
 
 		 184 aa  137  7.999999999999999e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.623719 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0019  ISSod9, DNA-invertase  38.76 
 
 		 185 aa  137  8.999999999999999e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0170  ISSod9, DNA-invertase  38.76 
 
 		 185 aa  137  8.999999999999999e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.579928  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_2482  TonB-dependent receptor protein  48.92 
 
 		 294 aa  137  1e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  45.39 
 
 		 201 aa  137  1e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0611  Resolvase domain protein  44.32 
 
 		 186 aa  137  1e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5280  resolvase domain-containing protein  51.09 
 
 		 305 aa  137  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2144  Resolvase domain protein  43.55 
 
 		 196 aa  137  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0618608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0580  resolvase domain-containing protein  44.32 
 
 		 186 aa  137  1e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2033  resolvase domain-containing protein  42.62 
 
 		 192 aa  137  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0605  resolvase domain-containing protein  44.32 
 
 		 186 aa  137  1e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.177837 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2984  putative site-specific recombinases, DNA invertase Pin  43.33 
 
 		 203 aa  136  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200056  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4320  hypothetical protein  48.92 
 
 		 293 aa  136  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.264253 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4026  resolvase domain-containing protein  48.92 
 
 		 298 aa  136  2e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.884346  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4189  TonB-dependent receptor protein  48.2 
 
 		 294 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3992  resolvase domain-containing protein  45.21 
 
 		 195 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.378658  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_42  putative resolvase  38.67 
 
 		 181 aa  134  8e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0684051  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0409  resolvase domain-containing protein  46.1 
 
 		 186 aa  134  8e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000318958  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  45.39 
 
 		 199 aa  134  9e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4775  resolvase domain-containing protein  39.77 
 
 		 189 aa  133  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4668  resolvase domain-containing protein  39.77 
 
 		 189 aa  133  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3045  Resolvase domain protein  38.55 
 
 		 189 aa  134  9.999999999999999e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3662  Resolvase domain protein  39.2 
 
 		 188 aa  133  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0149  resolvase  39.56 
 
 		 189 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4382  resolvase domain-containing protein  40.11 
 
 		 194 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08245  resolvase  39.33 
 
 		 179 aa  133  1.9999999999999998e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>