More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_2027 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_2027  resolvase domain-containing protein  100 
 
 
185 aa  370  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6388  resolvase domain-containing protein  65.19 
 
 
191 aa  231  3e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4091  Resolvase domain  62.7 
 
 
186 aa  231  5e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010504  Mrad2831_6517  resolvase domain-containing protein  63.19 
 
 
185 aa  228  4e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0260  resolvase family site-specific recombinase  61.88 
 
 
205 aa  221  6e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1082  resolvase family site-specific recombinase  61.88 
 
 
205 aa  221  6e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271311  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2239  resolvase domain-containing protein  60.22 
 
 
187 aa  216  1e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2095  Resolvase domain protein  60.66 
 
 
203 aa  213  9e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0466  Resolvase domain  58.7 
 
 
205 aa  204  6e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.418385  normal  0.0169839 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1711  integrative genetic element Gsu5, resolvase  51.91 
 
 
190 aa  179  2e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3670  resolvase domain-containing protein  49.72 
 
 
185 aa  171  5e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1006  Resolvase domain protein  50.28 
 
 
189 aa  169  2e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2355  Resolvase domain protein  50 
 
 
186 aa  169  2e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.230305  normal  0.6636 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3678  Resolvase domain  48.62 
 
 
190 aa  165  2.9999999999999998e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134045  n/a   
 
 
-
 
NC_010374  M446_7059  hypothetical protein  51.96 
 
 
183 aa  162  3e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2582  resolvase domain-containing protein  46.96 
 
 
185 aa  162  3e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1326  resolvase domain-containing protein  50.82 
 
 
180 aa  160  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3112  Resolvase domain protein  50.54 
 
 
184 aa  158  4e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1132  Resolvase domain  48.09 
 
 
184 aa  157  7e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0938  site-specific recombinase  58.99 
 
 
154 aa  157  1e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7006  hypothetical protein  49.16 
 
 
183 aa  152  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6810  Resolvase domain protein  47.83 
 
 
185 aa  150  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.67902  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6405  resolvase domain-containing protein  47.22 
 
 
185 aa  145  3e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0816  resolvase domain-containing protein  45.95 
 
 
185 aa  144  8.000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5397  Resolvase domain protein  44.02 
 
 
185 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0011  RlgA  45.05 
 
 
186 aa  138  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.928686  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  42.16 
 
 
188 aa  138  3.9999999999999997e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0605  resolvase domain-containing protein  43.78 
 
 
186 aa  138  6e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.177837 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0580  resolvase domain-containing protein  43.78 
 
 
186 aa  138  6e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0611  Resolvase domain protein  43.78 
 
 
186 aa  138  6e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0019  ISSod9, DNA-invertase  42.55 
 
 
185 aa  136  1e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0170  ISSod9, DNA-invertase  42.55 
 
 
185 aa  136  1e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.579928  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6417  resolvase domain-containing protein  44.2 
 
 
196 aa  136  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  42.78 
 
 
185 aa  136  2e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  43.48 
 
 
188 aa  135  3.0000000000000003e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3714  resolvase domain-containing protein  41.94 
 
 
188 aa  134  7.000000000000001e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.566828  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0167  resolvase domain-containing protein  42.25 
 
 
196 aa  134  8e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5628  Resolvase domain  43.65 
 
 
198 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.526216 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  41.49 
 
 
185 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  42.25 
 
 
185 aa  133  9.999999999999999e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5396  resolvase domain-containing protein  42.46 
 
 
180 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.859533  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4885  resolvase domain-containing protein  42.62 
 
 
187 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6748  resolvase domain-containing protein  40.33 
 
 
201 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.167425 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01209  bacteriocin production protein  42.78 
 
 
198 aa  130  9e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000702686  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5519  Resolvase domain  42.7 
 
 
197 aa  130  9e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.176111  normal  0.515657 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  43.68 
 
 
201 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0086  resolvase family site-specific recombinase  42.08 
 
 
196 aa  128  4.0000000000000003e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.464664  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5431  Resolvase domain protein  41.4 
 
 
185 aa  128  6e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318584  normal 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4560  resolvase domain-containing protein  41.53 
 
 
192 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3992  resolvase domain-containing protein  42.19 
 
 
195 aa  127  7.000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.378658  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3477  resolvase domain-containing protein  42.08 
 
 
196 aa  127  8.000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4123  resolvase domain-containing protein  41.4 
 
 
185 aa  127  1.0000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0694671 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0189  resolvase domain-containing protein  41.53 
 
 
206 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1992  resolvase domain-containing protein  41.53 
 
 
206 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0039  resolvase  37.16 
 
 
181 aa  123  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6307  resolvase domain-containing protein  40 
 
 
209 aa  124  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  41.3 
 
 
182 aa  122  3e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_2482  TonB-dependent receptor protein  45.81 
 
 
294 aa  120  8e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2147  Resolvase domain protein  38.33 
 
 
191 aa  120  8e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4249  resolvase domain-containing protein  38.33 
 
 
191 aa  120  8e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.251845 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3553  resolvase domain-containing protein  44.13 
 
 
181 aa  120  9.999999999999999e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.467372  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  37.97 
 
 
188 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0002  resolvase  39.04 
 
 
190 aa  120  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141759  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4459  resolvase  39.47 
 
 
190 aa  120  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4290  resolvase  39.47 
 
 
190 aa  120  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4190  resolvase  39.47 
 
 
190 aa  120  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5126  Resolvase domain protein  38.42 
 
 
197 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.114051 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0268  resolvase domain-containing protein  41.21 
 
 
181 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.268273  normal 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  44.44 
 
 
188 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  40 
 
 
194 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4189  TonB-dependent receptor protein  45.16 
 
 
294 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  37.5 
 
 
201 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0052  hypothetical protein  39.89 
 
 
201 aa  119  3e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  39.36 
 
 
197 aa  119  3e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4105  resolvase domain-containing protein  43.87 
 
 
293 aa  119  3e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.571135  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0747  resolvase domain-containing protein  42.22 
 
 
181 aa  119  3e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3853  resolvase domain-containing protein  43.87 
 
 
326 aa  118  3.9999999999999996e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.363521  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4383  resolvase  39.13 
 
 
193 aa  118  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  36.96 
 
 
199 aa  118  4.9999999999999996e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3748  resolvase domain-containing protein  43.87 
 
 
293 aa  118  4.9999999999999996e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.57685  normal  0.861996 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4320  hypothetical protein  45.16 
 
 
293 aa  118  6e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.264253 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4026  resolvase domain-containing protein  43.23 
 
 
298 aa  117  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.884346  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  37.5 
 
 
188 aa  116  1.9999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2322  resolvase domain-containing protein  37.84 
 
 
186 aa  115  3e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  37.7 
 
 
219 aa  115  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0466  resolvase  37.7 
 
 
193 aa  115  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.736746  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4685  resolvase domain-containing protein  38.5 
 
 
193 aa  115  5e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3982  resolvase domain-containing protein  38.38 
 
 
201 aa  115  5e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.364011  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0631  resolvase domain-containing protein  38.38 
 
 
201 aa  115  5e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  36.96 
 
 
188 aa  113  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5093  resolvase domain-containing protein  39.57 
 
 
201 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.993134 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5459  resolvase domain-containing protein  38.3 
 
 
190 aa  114  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358499  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5450  resolvase domain-containing protein  41.62 
 
 
184 aa  112  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  36.76 
 
 
192 aa  113  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1490  resolvase domain-containing protein  35.33 
 
 
183 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.832501  hitchhiker  0.00333462 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  36.41 
 
 
187 aa  112  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  38.74 
 
 
199 aa  112  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3045  Resolvase domain protein  41.67 
 
 
189 aa  112  4.0000000000000004e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0235  resolvase domain-containing protein  37.1 
 
 
187 aa  111  5e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0409  resolvase domain-containing protein  38.04 
 
 
186 aa  111  5e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000318958  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>