More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_p840_42 on replicon NC_011311
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011311  VSAL_p840_42  putative resolvase  100 
 
 		 181 aa  369  1e-101  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0684051  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08245  resolvase  76.4 
 
 		 179 aa  295  2e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0246  resolvase domain-containing protein  69.1 
 
 		 179 aa  268  2e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.315323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3678  Resolvase domain  39.55 
 
 		 190 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134045  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1711  integrative genetic element Gsu5, resolvase  38.67 
 
 		 190 aa  134  7.000000000000001e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3670  resolvase domain-containing protein  40.11 
 
 		 185 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0090  resolvase TnpR  38.46 
 
 		 183 aa  132  3e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.707126  normal  0.345515 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2582  resolvase domain-containing protein  37.78 
 
 		 185 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4091  Resolvase domain  38.25 
 
 		 186 aa  128  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0466  Resolvase domain  38.38 
 
 		 205 aa  127  1.0000000000000001e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.418385  normal  0.0169839 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  39.25 
 
 		 192 aa  124  7e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1006  Resolvase domain protein  37.85 
 
 		 189 aa  123  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01209  bacteriocin production protein  37.99 
 
 		 198 aa  123  1e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000702686  n/a   
 
 
-
 
NC_010504  Mrad2831_6517  resolvase domain-containing protein  37.63 
 
 		 185 aa  123  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3553  resolvase domain-containing protein  43.87 
 
 		 181 aa  122  3e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.467372  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1579  transposon Tn3 resolvase  38.33 
 
 		 185 aa  121  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.159821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2355  Resolvase domain protein  40.33 
 
 		 186 aa  121  6e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.230305  normal  0.6636 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4885  resolvase domain-containing protein  39.33 
 
 		 187 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  36.41 
 
 		 188 aa  120  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6388  resolvase domain-containing protein  39.13 
 
 		 191 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1132  Resolvase domain  37.29 
 
 		 184 aa  119  3e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0039  resolvase  36.52 
 
 		 181 aa  118  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1445  Resolvase domain  38.25 
 
 		 188 aa  118  4.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2239  resolvase domain-containing protein  35.91 
 
 		 187 aa  118  4.9999999999999996e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D08  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  38.46 
 
 		 193 aa  117  9.999999999999999e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.942713  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1326  resolvase domain-containing protein  36.81 
 
 		 180 aa  115  5e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5519  Resolvase domain  38.55 
 
 		 197 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.176111  normal  0.515657 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5399  resolvase domain-containing protein  36.41 
 
 		 186 aa  114  6.9999999999999995e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00909416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2746  resolvase domain-containing protein  37.63 
 
 		 197 aa  113  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2823  resolvase domain-containing protein  37.63 
 
 		 197 aa  113  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6417  resolvase domain-containing protein  39.11 
 
 		 196 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0816  resolvase domain-containing protein  36.81 
 
 		 185 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5450  resolvase domain-containing protein  36.46 
 
 		 184 aa  112  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0096  resolvase domain-containing protein  36.67 
 
 		 185 aa  113  2.0000000000000002e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6810  Resolvase domain protein  36.81 
 
 		 185 aa  112  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.67902  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5628  Resolvase domain  37.99 
 
 		 198 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.526216 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2027  resolvase domain-containing protein  35.83 
 
 		 185 aa  111  6e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6405  resolvase domain-containing protein  36.81 
 
 		 185 aa  111  7.000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1104  Resolvase domain  36.11 
 
 		 196 aa  110  1.0000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2381  Resolvase domain  36.67 
 
 		 196 aa  110  1.0000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2245  resolvase domain-containing protein  36.46 
 
 		 183 aa  110  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0071186  normal  0.011182 
 
 
-
 
NC_004310  BR0260  resolvase family site-specific recombinase  36.26 
 
 		 205 aa  109  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1082  resolvase family site-specific recombinase  36.26 
 
 		 205 aa  109  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271311  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0884  Resolvase domain protein  35.14 
 
 		 187 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000364698  n/a   
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0002  resolvase  40.22 
 
 		 190 aa  109  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141759  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  34.97 
 
 		 199 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  34.97 
 
 		 201 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  35.33 
 
 		 182 aa  108  3e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4764  resolvase domain-containing protein  35.16 
 
 		 189 aa  109  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  35.33 
 
 		 191 aa  108  6e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0068  resolvase  33.7 
 
 		 181 aa  108  6e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0902003  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0086  resolvase family site-specific recombinase  34.44 
 
 		 196 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.464664  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2351  resolvase-like protein  37.36 
 
 		 235 aa  107  8.000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.329475 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0545  hypothetical protein  34.81 
 
 		 186 aa  107  9.000000000000001e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0606652 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0011  resolvase, putative  36.76 
 
 		 181 aa  106  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  34.62 
 
 		 188 aa  107  1e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3477  resolvase domain-containing protein  34.44 
 
 		 196 aa  107  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1992  resolvase domain-containing protein  33.89 
 
 		 206 aa  106  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0189  resolvase domain-containing protein  33.89 
 
 		 206 aa  106  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0268  resolvase domain-containing protein  34.44 
 
 		 181 aa  106  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.268273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D15  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  36.56 
 
 		 184 aa  106  2e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4383  resolvase  34.09 
 
 		 193 aa  106  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5396  resolvase domain-containing protein  34.81 
 
 		 180 aa  105  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.859533  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2095  Resolvase domain protein  35.16 
 
 		 203 aa  105  3e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  34.08 
 
 		 185 aa  105  5e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008264  CPR_B0006  resolvase  40.86 
 
 		 189 aa  104  5e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00548662  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5792  resolvase TnpR  33.69 
 
 		 212 aa  104  5e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.923438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4560  resolvase domain-containing protein  33.33 
 
 		 192 aa  104  6e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010374  M446_7059  hypothetical protein  35.39 
 
 		 183 aa  104  6e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  34.78 
 
 		 199 aa  104  6e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5126  Resolvase domain protein  33.52 
 
 		 197 aa  104  7e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.114051 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3135  resolvase TnpR  34.04 
 
 		 217 aa  104  7e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6307  resolvase domain-containing protein  35.39 
 
 		 209 aa  103  9e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  34.46 
 
 		 188 aa  103  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5397  Resolvase domain protein  34.62 
 
 		 185 aa  103  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3124  resolvase domain-containing protein  37.1 
 
 		 194 aa  103  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0904767  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1490  resolvase domain-containing protein  33.88 
 
 		 183 aa  103  1e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.832501  hitchhiker  0.00333462 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0747  resolvase domain-containing protein  35 
 
 		 181 aa  103  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0466  resolvase  32.39 
 
 		 193 aa  103  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.736746  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  33.52 
 
 		 185 aa  103  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4228  resolvase family site-specific recombinase  39.69 
 
 		 187 aa  102  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.623835  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0233  resolvase  31.41 
 
 		 183 aa  102  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0202  resolvase  31.41 
 
 		 183 aa  102  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5122  resolvase domain-containing protein  36.52 
 
 		 290 aa  102  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2084  resolvase domain-containing protein  33.87 
 
 		 196 aa  102  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2363  resolvase-like protein  35.39 
 
 		 228 aa  102  3e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.379523  normal  0.343568 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4419  resolvase domain-containing protein  33.87 
 
 		 196 aa  102  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00736052  normal  0.464308 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4249  resolvase domain-containing protein  33.33 
 
 		 191 aa  102  3e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.251845 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2173  resolvase domain-containing protein  33.87 
 
 		 196 aa  102  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3714  resolvase domain-containing protein  33.52 
 
 		 188 aa  102  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.566828  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5459  resolvase domain-containing protein  40.85 
 
 		 190 aa  102  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2147  Resolvase domain protein  33.33 
 
 		 191 aa  102  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1615  resolvase family site-specific recombinase  37.16 
 
 		 197 aa  102  4e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0019  ISSod9, DNA-invertase  31.89 
 
 		 185 aa  102  4e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0170  ISSod9, DNA-invertase  31.89 
 
 		 185 aa  102  4e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.579928  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  32.96 
 
 		 185 aa  102  4e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0235  resolvase domain-containing protein  32.61 
 
 		 187 aa  102  4e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0409  resolvase domain-containing protein  34.05 
 
 		 186 aa  101  7e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000318958  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3928  resolvase domain-containing protein  36.81 
 
 		 191 aa  100  8e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.272515  hitchhiker  0.0000753359 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4123  resolvase domain-containing protein  34.08 
 
 		 185 aa  100  8e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0694671 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>