More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_A0002 on replicon NC_008263
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008263  CPR_A0002  resolvase  100 
 
 		 190 aa  374  1e-103  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141759  n/a   
 
 
-
 
NC_008264  CPR_B0006  resolvase  91.01 
 
 		 189 aa  340  7e-93  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00548662  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20410  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  57.84 
 
 		 194 aa  221  4.9999999999999996e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0661103 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3124  resolvase domain-containing protein  48.72 
 
 		 194 aa  188  5e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0904767  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  50.27 
 
 		 199 aa  181  4.0000000000000006e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1490  resolvase domain-containing protein  48.65 
 
 		 183 aa  180  1e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.832501  hitchhiker  0.00333462 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  49.73 
 
 		 201 aa  179  2e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0216  transposon resolvase  50.8 
 
 		 199 aa  176  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.159168 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0041  resolvase domain-containing protein  48.11 
 
 		 184 aa  174  6e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.0000573211 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0222  transposon resolvase  50.27 
 
 		 199 aa  174  9e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000952158 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0204  transposon resolvase  49.2 
 
 		 191 aa  174  9e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000159954 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0014  resolvase domain-containing protein  48.11 
 
 		 184 aa  173  9.999999999999999e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.125158  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0039  resolvase  46.2 
 
 		 181 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5396  resolvase domain-containing protein  46.41 
 
 		 180 aa  169  3e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.859533  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0068  resolvase  46.2 
 
 		 181 aa  162  3e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0902003  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0206  transposon resolvase  51.27 
 
 		 169 aa  155  4e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000314886 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0233  resolvase  44.57 
 
 		 183 aa  154  6e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0202  resolvase  44.57 
 
 		 183 aa  154  6e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5399  resolvase domain-containing protein  41.4 
 
 		 186 aa  142  4e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00909416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0149  resolvase  39.79 
 
 		 189 aa  137  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  40.76 
 
 		 188 aa  137  1e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2245  resolvase domain-containing protein  39.89 
 
 		 183 aa  136  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0071186  normal  0.011182 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2392  Resolvase domain  40.86 
 
 		 197 aa  133  9.999999999999999e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000064315  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  40.1 
 
 		 188 aa  131  6e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0854  invertase/recombinase like protein  39.25 
 
 		 198 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.160403  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3714  resolvase domain-containing protein  41.21 
 
 		 188 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.566828  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4123  resolvase domain-containing protein  39.56 
 
 		 185 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0694671 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  39.56 
 
 		 185 aa  129  3e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  39.56 
 
 		 185 aa  129  3e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3553  resolvase domain-containing protein  39.89 
 
 		 181 aa  128  4.0000000000000003e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.467372  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  40.21 
 
 		 201 aa  128  4.0000000000000003e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4319  resolvase-like protein  36.61 
 
 		 206 aa  128  5.0000000000000004e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1132  Resolvase domain  40.44 
 
 		 184 aa  128  6e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0019  ISSod9, DNA-invertase  39.13 
 
 		 185 aa  127  8.000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0170  ISSod9, DNA-invertase  39.13 
 
 		 185 aa  127  8.000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.579928  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  37.7 
 
 		 188 aa  127  8.000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1711  integrative genetic element Gsu5, resolvase  36.41 
 
 		 190 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5450  resolvase domain-containing protein  37.7 
 
 		 184 aa  127  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  38.02 
 
 		 192 aa  125  3e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1615  resolvase family site-specific recombinase  40 
 
 		 197 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4383  resolvase  39.25 
 
 		 193 aa  124  6e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  39.01 
 
 		 185 aa  124  9e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3670  resolvase domain-containing protein  37.3 
 
 		 185 aa  124  9e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5431  Resolvase domain protein  37.36 
 
 		 185 aa  123  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318584  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1006  Resolvase domain protein  38.59 
 
 		 189 aa  123  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0466  Resolvase domain  37.97 
 
 		 205 aa  122  3e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.418385  normal  0.0169839 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  38.04 
 
 		 188 aa  122  3e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0466  resolvase  38.89 
 
 		 193 aa  121  7e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.736746  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  36.7 
 
 		 199 aa  121  7e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2027  resolvase domain-containing protein  39.04 
 
 		 185 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3338  resolvase domain-containing protein  39.61 
 
 		 186 aa  120  9.999999999999999e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3678  Resolvase domain  37.5 
 
 		 190 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134045  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  38.59 
 
 		 184 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.623719 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0167  resolvase domain-containing protein  34.2 
 
 		 196 aa  119  3e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0155  resolvase x  36.84 
 
 		 193 aa  119  3e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  38.59 
 
 		 184 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  34.22 
 
 		 188 aa  118  3.9999999999999996e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3847  resolvase-like protein  38.38 
 
 		 191 aa  118  3.9999999999999996e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.388128  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  38.04 
 
 		 197 aa  118  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2582  resolvase domain-containing protein  35.68 
 
 		 185 aa  118  6e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1397  invertase/recombinase like protein  40.56 
 
 		 176 aa  118  7e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3853  resolvase domain-containing protein  40 
 
 		 326 aa  117  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.363521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4764  resolvase domain-containing protein  34.59 
 
 		 189 aa  116  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2984  putative site-specific recombinases, DNA invertase Pin  37.3 
 
 		 203 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200056  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5037  resolvase domain-containing protein  34.97 
 
 		 201 aa  115  3e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.931406  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1579  transposon Tn3 resolvase  36.41 
 
 		 185 aa  115  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.159821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0235  resolvase domain-containing protein  35.26 
 
 		 187 aa  115  3e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08245  resolvase  40.76 
 
 		 179 aa  115  3.9999999999999997e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2702  resolvase domain-containing protein  34.54 
 
 		 307 aa  115  3.9999999999999997e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.264305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2944  resolvase domain-containing protein  34.54 
 
 		 307 aa  115  3.9999999999999997e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.857733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4026  resolvase domain-containing protein  40 
 
 		 298 aa  115  5e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.884346  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4105  resolvase domain-containing protein  39.39 
 
 		 293 aa  115  5e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.571135  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3045  Resolvase domain protein  37.42 
 
 		 189 aa  115  5e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6307  resolvase domain-containing protein  37.02 
 
 		 209 aa  115  5e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5457  hypothetical protein  37.1 
 
 		 194 aa  114  6e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5424  Resolvase domain  37.1 
 
 		 194 aa  114  6e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0108  hypothetical protein  35.05 
 
 		 309 aa  114  6e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0409  resolvase domain-containing protein  34.92 
 
 		 186 aa  114  6.9999999999999995e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000318958  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2746  resolvase domain-containing protein  36.46 
 
 		 197 aa  114  8.999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2823  resolvase domain-containing protein  36.46 
 
 		 197 aa  114  8.999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  35.71 
 
 		 188 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2351  resolvase-like protein  35.68 
 
 		 235 aa  113  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.329475 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0090  resolvase TnpR  36.41 
 
 		 183 aa  114  1.0000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.707126  normal  0.345515 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  35.83 
 
 		 191 aa  114  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  35.71 
 
 		 187 aa  113  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  35.71 
 
 		 190 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0052  hypothetical protein  37.04 
 
 		 201 aa  113  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  36.76 
 
 		 219 aa  113  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2363  resolvase-like protein  36.56 
 
 		 228 aa  112  3e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.379523  normal  0.343568 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3694  resolvase domain-containing protein  33.51 
 
 		 206 aa  112  3e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1326  resolvase domain-containing protein  35.68 
 
 		 180 aa  112  4.0000000000000004e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4991  resolvase domain-containing protein  39.23 
 
 		 189 aa  112  4.0000000000000004e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0260  resolvase family site-specific recombinase  35.08 
 
 		 205 aa  112  5e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1082  resolvase family site-specific recombinase  35.08 
 
 		 205 aa  112  5e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271311  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4091  Resolvase domain  33.51 
 
 		 186 aa  111  5e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6634  resolvase domain-containing protein  33.51 
 
 		 198 aa  111  5e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000708994  hitchhiker  0.0000367715 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4537  Resolvase domain protein  33.33 
 
 		 198 aa  111  7.000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.41321 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0043  hypothetical protein  33.7 
 
 		 188 aa  110  8.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2144  Resolvase domain protein  37.43 
 
 		 196 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0618608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9833  Resolvase Protein  34.9 
 
 		 210 aa  110  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>