More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene plpl0043 on replicon NC_006366
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006366  plpl0043  hypothetical protein  100 
 
 
188 aa  379  1e-104  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1206  Resolvase domain protein  70.65 
 
 
186 aa  274  6e-73  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0053  transposon Tn21 resolvase  68.11 
 
 
186 aa  274  7e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.509225 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4319  resolvase domain-containing protein  68.11 
 
 
186 aa  274  7e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4473  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  70.65 
 
 
186 aa  273  1.0000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0992302  decreased coverage  0.00348712 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4599  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  70.65 
 
 
186 aa  273  1.0000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000321893  hitchhiker  0.00456228 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15430  putative resolvase, essential for transposition  70.65 
 
 
186 aa  273  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  7.34084e-16  unclonable  6.55355e-22 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1494  resolvase-like protein  68.85 
 
 
186 aa  269  2e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.493325 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4489  Resolvase domain protein  69.61 
 
 
186 aa  265  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000146883  normal 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4352  Resolvase domain protein  69.61 
 
 
186 aa  265  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00813261  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3464  resolvase domain-containing protein  68.85 
 
 
185 aa  265  2.9999999999999995e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6187  resolvase-like protein  67.93 
 
 
186 aa  265  4e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0984609  hitchhiker  0.0000107923 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2322  resolvase domain-containing protein  69.4 
 
 
186 aa  264  5e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2680  resolvase domain-containing protein  68.85 
 
 
185 aa  263  8.999999999999999e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3829  resolvase domain-containing protein  68.85 
 
 
185 aa  263  8.999999999999999e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3846  resolvase domain-containing protein  68.85 
 
 
185 aa  263  8.999999999999999e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.40246  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1914  resolvase domain-containing protein  68.85 
 
 
185 aa  263  8.999999999999999e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3982  resolvase domain-containing protein  68.31 
 
 
201 aa  262  2e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.364011  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0631  resolvase domain-containing protein  68.31 
 
 
201 aa  262  2e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0037  transposon Tn21 resolvase  67.76 
 
 
205 aa  262  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.335597 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1256  resolvase domain-containing protein  69.44 
 
 
185 aa  261  4e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.249423  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1125  resolvase domain-containing protein  63.39 
 
 
184 aa  245  3e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.577602  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0166  Resolvase domain protein  63.24 
 
 
188 aa  244  4e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2033  resolvase domain-containing protein  61.41 
 
 
192 aa  244  4.9999999999999997e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4764  resolvase domain-containing protein  63.33 
 
 
189 aa  239  1e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4598  Resolvase domain protein  61.75 
 
 
188 aa  238  4e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2351  resolvase-like protein  62.92 
 
 
235 aa  236  2e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.329475 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3928  resolvase domain-containing protein  61.08 
 
 
191 aa  230  7.000000000000001e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.272515  hitchhiker  0.0000753359 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3170  resolvase domain-containing protein  55.79 
 
 
200 aa  218  6e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00430122 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1445  Resolvase domain  58.38 
 
 
188 aa  217  8.999999999999998e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2264  resolvase-like protein  59.64 
 
 
183 aa  212  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0723164  hitchhiker  0.00531394 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3523  resolvase, N-terminal:resolvase helix-turn-helix region  61.33 
 
 
184 aa  207  8e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000257012  decreased coverage  0.00040401 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1325  resolvase domain-containing protein  52.15 
 
 
192 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1312  resolvase, N-terminal:resolvase helix-turn-helix region  56.91 
 
 
187 aa  195  4.0000000000000005e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.183881 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5336  transposon Tn21 resolvase  71.88 
 
 
129 aa  193  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0884  Resolvase domain protein  48.07 
 
 
187 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000364698  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2803  putative resolvase  50.28 
 
 
188 aa  162  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.545302  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1735  putative resolvase  49.72 
 
 
188 aa  161  5.0000000000000005e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1811  Resolvase domain protein  44.07 
 
 
183 aa  149  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0297206  hitchhiker  0.00833685 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16170  resolvase  45.25 
 
 
207 aa  143  1e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.982528  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3678  Resolvase domain  38.59 
 
 
190 aa  129  3e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134045  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  42.08 
 
 
188 aa  127  8.000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  40 
 
 
192 aa  127  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1647  resolvase domain protein  50.43 
 
 
120 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2179  resolvase domain-containing protein  40.22 
 
 
188 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0190993  hitchhiker  0.0022624 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2946  resolvase domain-containing protein  40.22 
 
 
188 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0986415  normal  0.227448 
 
 
-
 
NC_004310  BR0260  resolvase family site-specific recombinase  41.06 
 
 
205 aa  122  3e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1082  resolvase family site-specific recombinase  41.06 
 
 
205 aa  122  3e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271311  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2319  resolvase, putative  47.45 
 
 
137 aa  122  4e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000512602  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0466  Resolvase domain  38.46 
 
 
205 aa  121  7e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.418385  normal  0.0169839 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2355  Resolvase domain protein  40.66 
 
 
186 aa  121  7e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.230305  normal  0.6636 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1711  integrative genetic element Gsu5, resolvase  36.41 
 
 
190 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4137  resolvase domain-containing protein  38.22 
 
 
224 aa  120  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.130251  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  38.59 
 
 
188 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1006  Resolvase domain protein  35.29 
 
 
189 aa  118  3.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  36.76 
 
 
190 aa  118  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2823  resolvase domain-containing protein  39.44 
 
 
197 aa  117  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21550  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  37.99 
 
 
218 aa  117  9.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.850113  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1397  Resolvase domain protein  39.36 
 
 
209 aa  117  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.954133  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2746  resolvase domain-containing protein  39.44 
 
 
197 aa  117  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  38.12 
 
 
188 aa  117  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2239  resolvase domain-containing protein  37.77 
 
 
187 aa  116  1.9999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0955  Resolvase domain protein  39.15 
 
 
194 aa  116  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  37.57 
 
 
187 aa  115  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0471  resolvase  38.38 
 
 
197 aa  114  6e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  38.8 
 
 
199 aa  114  6e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0011  RlgA  40 
 
 
186 aa  114  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.928686  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4459  resolvase  36.17 
 
 
190 aa  114  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4290  resolvase  36.17 
 
 
190 aa  114  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4190  resolvase  36.17 
 
 
190 aa  114  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  33.33 
 
 
188 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0611  Resolvase domain protein  39.67 
 
 
186 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0605  resolvase domain-containing protein  39.67 
 
 
186 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.177837 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0580  resolvase domain-containing protein  39.67 
 
 
186 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1132  Resolvase domain  38.12 
 
 
184 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0235  resolvase domain-containing protein  39.46 
 
 
187 aa  112  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3124  resolvase domain-containing protein  35.29 
 
 
194 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0904767  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0991  resolvase domain-containing protein  38.38 
 
 
205 aa  111  6e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0378771  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3670  resolvase domain-containing protein  36.56 
 
 
185 aa  111  6e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2582  resolvase domain-containing protein  37.1 
 
 
185 aa  111  6e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2258  resolvase domain-containing protein  36.36 
 
 
195 aa  111  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.880923  normal 
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0002  resolvase  33.7 
 
 
190 aa  110  8.000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141759  n/a   
 
 
-
 
NC_010504  Mrad2831_6517  resolvase domain-containing protein  34.97 
 
 
185 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25710  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  37.11 
 
 
201 aa  109  2.0000000000000002e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  34.97 
 
 
201 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  34.03 
 
 
199 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0204  transposon resolvase  33.51 
 
 
191 aa  108  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000159954 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2027  resolvase domain-containing protein  36.9 
 
 
185 aa  109  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  38.76 
 
 
197 aa  109  3e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6388  resolvase domain-containing protein  35.87 
 
 
191 aa  109  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0409  resolvase domain-containing protein  37.3 
 
 
186 aa  108  3e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000318958  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1477  Resolvase domain  34.76 
 
 
197 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.79192  unclonable  0.0000000000000150315 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0222  transposon resolvase  34.43 
 
 
199 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000952158 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01209  bacteriocin production protein  36.13 
 
 
198 aa  108  4.0000000000000004e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000702686  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1852  Resolvase domain  34.76 
 
 
197 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.064893  hitchhiker  0.000000000000388244 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4479  Resolvase domain protein  34.76 
 
 
197 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000147912 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3045  Resolvase domain protein  36.52 
 
 
189 aa  108  5e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0039  resolvase  34.81 
 
 
181 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2144  Resolvase domain protein  34.04 
 
 
196 aa  108  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0618608  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  37.08 
 
 
184 aa  107  8.000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>