More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3338 on replicon NC_009468
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009468  Acry_3338  resolvase domain-containing protein  100 
 
 		 186 aa  366  1e-101  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1615  resolvase family site-specific recombinase  69.68 
 
 		 197 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3256  Fis family transcriptional regulator  92.78 
 
 		 116 aa  179  2e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0578977  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5399  resolvase domain-containing protein  60 
 
 		 186 aa  174  8e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00909416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2245  resolvase domain-containing protein  48 
 
 		 183 aa  146  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0071186  normal  0.011182 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5396  resolvase domain-containing protein  48.34 
 
 		 180 aa  141  6e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.859533  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1090  resolvase domain-containing protein  52.45 
 
 		 159 aa  140  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0041  resolvase domain-containing protein  40 
 
 		 184 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.0000573211 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0014  resolvase domain-containing protein  40 
 
 		 184 aa  137  7e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.125158  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3847  resolvase-like protein  46.41 
 
 		 191 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.388128  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3553  resolvase domain-containing protein  47.09 
 
 		 181 aa  133  9.999999999999999e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.467372  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1490  resolvase domain-containing protein  40.91 
 
 		 183 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.832501  hitchhiker  0.00333462 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5450  resolvase domain-containing protein  50 
 
 		 184 aa  130  9e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0039  resolvase  45.1 
 
 		 181 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  39.87 
 
 		 199 aa  128  4.0000000000000003e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  46.98 
 
 		 188 aa  127  7.000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  40.52 
 
 		 201 aa  127  9.000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21550  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  47.71 
 
 		 218 aa  125  3e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.850113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008264  CPR_B0006  resolvase  40.26 
 
 		 189 aa  120  9e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00548662  n/a   
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0002  resolvase  39.61 
 
 		 190 aa  120  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141759  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  46.62 
 
 		 219 aa  119  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20410  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  45.33 
 
 		 194 aa  118  6e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0661103 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  44.37 
 
 		 182 aa  117  9e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1052  Resolvase domain  42.14 
 
 		 186 aa  117  9e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2144  Resolvase domain protein  45.1 
 
 		 196 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0618608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  43.84 
 
 		 191 aa  113  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2392  Resolvase domain  40.26 
 
 		 197 aa  111  6e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000064315  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0854  invertase/recombinase like protein  40.52 
 
 		 198 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.160403  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4319  resolvase-like protein  42.21 
 
 		 206 aa  110  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2813  resolvase-like protein  42 
 
 		 184 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.493253  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3124  resolvase domain-containing protein  43.4 
 
 		 194 aa  109  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0904767  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1711  integrative genetic element Gsu5, resolvase  41.94 
 
 		 190 aa  108  5e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  43.23 
 
 		 201 aa  108  5e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0348  Resolvase domain protein  48.25 
 
 		 209 aa  108  5e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2550  Resolvase domain  45.75 
 
 		 196 aa  108  6e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.819685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5459  resolvase domain-containing protein  43.54 
 
 		 190 aa  106  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  40.52 
 
 		 188 aa  106  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0536  resolvase domain-containing protein  46.06 
 
 		 203 aa  105  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4249  resolvase domain-containing protein  45.45 
 
 		 191 aa  105  4e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.251845 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0068  resolvase  35.29 
 
 		 181 aa  105  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0902003  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2147  Resolvase domain protein  45.45 
 
 		 191 aa  105  4e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  41.06 
 
 		 199 aa  105  4e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  38 
 
 		 192 aa  104  6e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0167  resolvase domain-containing protein  44.67 
 
 		 196 aa  104  8e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0409  resolvase domain-containing protein  41.18 
 
 		 186 aa  104  9e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000318958  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5093  resolvase domain-containing protein  44.22 
 
 		 201 aa  103  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.993134 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  42.57 
 
 		 188 aa  103  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3670  resolvase domain-containing protein  38.37 
 
 		 185 aa  102  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4382  resolvase domain-containing protein  39.6 
 
 		 194 aa  102  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0011  RlgA  42.21 
 
 		 186 aa  102  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.928686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2258  resolvase domain-containing protein  40.94 
 
 		 195 aa  101  5e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.880923  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1006  Resolvase domain protein  39.6 
 
 		 189 aa  101  6e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0466  Resolvase domain  40.91 
 
 		 205 aa  101  7e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.418385  normal  0.0169839 
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2823  resolvase domain-containing protein  37.33 
 
 		 197 aa  101  7e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2746  resolvase domain-containing protein  37.33 
 
 		 197 aa  101  7e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6748  resolvase domain-containing protein  43.54 
 
 		 201 aa  100  9e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.167425 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  41.61 
 
 		 188 aa  100  1e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5126  Resolvase domain protein  42.67 
 
 		 197 aa  100  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.114051 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0611  Resolvase domain protein  40.65 
 
 		 186 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5066  resolvase domain-containing protein  45.95 
 
 		 313 aa  100  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.436238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2355  Resolvase domain protein  38.51 
 
 		 186 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.230305  normal  0.6636 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0605  resolvase domain-containing protein  40.65 
 
 		 186 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.177837 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0149  resolvase  36.6 
 
 		 189 aa  100  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0580  resolvase domain-containing protein  40.65 
 
 		 186 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  41.78 
 
 		 185 aa  99.8  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0235  resolvase domain-containing protein  37.91 
 
 		 187 aa  100  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3678  Resolvase domain  40.94 
 
 		 190 aa  99  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134045  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3112  Resolvase domain protein  42 
 
 		 184 aa  99.4  3e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  43.24 
 
 		 184 aa  99  3e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.623719 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1093  Resolvase domain  36.6 
 
 		 196 aa  98.6  4e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.531001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4991  resolvase domain-containing protein  39.74 
 
 		 189 aa  98.6  4e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5122  resolvase domain-containing protein  45.95 
 
 		 290 aa  98.6  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0233  resolvase  32.68 
 
 		 183 aa  98.2  6e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  41.78 
 
 		 185 aa  98.2  6e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  41.1 
 
 		 185 aa  98.2  6e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  41.22 
 
 		 197 aa  98.2  6e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0202  resolvase  32.68 
 
 		 183 aa  98.2  6e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2132  resolvase domain-containing protein  41.18 
 
 		 198 aa  98.2  6e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0356691 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  43.15 
 
 		 184 aa  97.8  8e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0466  resolvase  44.14 
 
 		 193 aa  97.8  8e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.736746  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4731  Resolvase domain protein  43.42 
 
 		 187 aa  97.8  9e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010374  M446_7059  hypothetical protein  40 
 
 		 183 aa  97.1  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7006  hypothetical protein  45.33 
 
 		 183 aa  97.4  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4128  Resolvase domain protein  40.51 
 
 		 231 aa  97.4  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2984  putative site-specific recombinases, DNA invertase Pin  40.67 
 
 		 203 aa  96.3  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200056  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4885  resolvase domain-containing protein  41.33 
 
 		 187 aa  96.3  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0991  resolvase domain-containing protein  38.41 
 
 		 205 aa  96.7  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0378771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6307  resolvase domain-containing protein  39.6 
 
 		 209 aa  95.9  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0260  resolvase family site-specific recombinase  38.71 
 
 		 205 aa  95.9  3e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1082  resolvase family site-specific recombinase  38.71 
 
 		 205 aa  95.9  3e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271311  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0204  transposon resolvase  34.39 
 
 		 191 aa  95.9  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000159954 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3992  resolvase domain-containing protein  37.2 
 
 		 195 aa  95.9  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.378658  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4775  resolvase domain-containing protein  43.24 
 
 		 189 aa  95.9  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4685  resolvase domain-containing protein  41.61 
 
 		 193 aa  95.9  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4668  resolvase domain-containing protein  43.24 
 
 		 189 aa  95.9  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0222  transposon resolvase  33.33 
 
 		 199 aa  95.9  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000952158 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  40.94 
 
 		 194 aa  95.5  4e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  39.04 
 
 		 188 aa  95.5  4e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4459  resolvase  40 
 
 		 190 aa  95.5  4e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4290  resolvase  40 
 
 		 190 aa  95.5  4e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>