More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_B0090 on replicon NC_010157
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010157  YpAngola_B0090  resolvase TnpR  100 
 
 		 183 aa  361  4e-99  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.707126  normal  0.345515 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1579  transposon Tn3 resolvase  80.66 
 
 		 185 aa  304  4.0000000000000004e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.159821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1104  Resolvase domain  72.38 
 
 		 196 aa  268  2.9999999999999997e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0011  resolvase, putative  73.74 
 
 		 181 aa  268  5e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2381  Resolvase domain  72.13 
 
 		 196 aa  267  5e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0545  hypothetical protein  68.13 
 
 		 186 aa  266  1e-70  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0606652 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0096  resolvase domain-containing protein  67.21 
 
 		 185 aa  255  2e-67  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0273  resolvase/recombinase  52.25 
 
 		 213 aa  164  8e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08245  resolvase  41.57 
 
 		 179 aa  139  1.9999999999999998e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01209  bacteriocin production protein  41.11 
 
 		 198 aa  136  2e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000702686  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_42  putative resolvase  38.46 
 
 		 181 aa  132  3e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0684051  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0268  resolvase domain-containing protein  42.16 
 
 		 181 aa  130  9e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.268273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4885  resolvase domain-containing protein  41.44 
 
 		 187 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5519  Resolvase domain  40.44 
 
 		 197 aa  129  3e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.176111  normal  0.515657 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6417  resolvase domain-containing protein  40.44 
 
 		 196 aa  129  3e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5628  Resolvase domain  39.46 
 
 		 198 aa  124  5e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.526216 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0246  resolvase domain-containing protein  39.89 
 
 		 179 aa  124  8.000000000000001e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.315323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0747  resolvase domain-containing protein  40.86 
 
 		 181 aa  123  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5431  Resolvase domain protein  37.16 
 
 		 185 aa  120  8e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2355  Resolvase domain protein  38.42 
 
 		 186 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.230305  normal  0.6636 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  36.81 
 
 		 192 aa  120  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2258  resolvase domain-containing protein  34.78 
 
 		 195 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.880923  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4228  resolvase family site-specific recombinase  36.7 
 
 		 187 aa  118  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.623835  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4123  resolvase domain-containing protein  37.43 
 
 		 185 aa  117  7.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0694671 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0854  invertase/recombinase like protein  35.87 
 
 		 198 aa  117  9.999999999999999e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.160403  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5122  resolvase domain-containing protein  37.22 
 
 		 290 aa  116  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0167  resolvase domain-containing protein  34.24 
 
 		 196 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008264  CPR_B0006  resolvase  36.41 
 
 		 189 aa  116  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00548662  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1711  integrative genetic element Gsu5, resolvase  36.22 
 
 		 190 aa  115  3e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D08  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  35.43 
 
 		 193 aa  114  7.999999999999999e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.942713  n/a   
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0002  resolvase  36.41 
 
 		 190 aa  114  8.999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141759  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  38.2 
 
 		 188 aa  114  8.999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  37.1 
 
 		 187 aa  113  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3714  resolvase domain-containing protein  36.41 
 
 		 188 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.566828  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2392  Resolvase domain  36.96 
 
 		 197 aa  114  1.0000000000000001e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000064315  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3553  resolvase domain-containing protein  36.26 
 
 		 181 aa  112  3e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.467372  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  35.52 
 
 		 185 aa  112  3e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  36.56 
 
 		 188 aa  112  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  35.36 
 
 		 188 aa  112  3e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  37.36 
 
 		 190 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1326  resolvase domain-containing protein  39.34 
 
 		 180 aa  111  5e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  34.97 
 
 		 185 aa  111  5e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1594  resolvase domain-containing protein  34.92 
 
 		 189 aa  111  6e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.94865  normal  0.455677 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4091  Resolvase domain  36.41 
 
 		 186 aa  111  7.000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2582  resolvase domain-containing protein  34.59 
 
 		 185 aa  111  7.000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2813  resolvase-like protein  35.91 
 
 		 184 aa  110  8.000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.493253  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2245  resolvase domain-containing protein  35.56 
 
 		 183 aa  110  8.000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0071186  normal  0.011182 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2084  resolvase domain-containing protein  35.14 
 
 		 196 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4419  resolvase domain-containing protein  35.14 
 
 		 196 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00736052  normal  0.464308 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2173  resolvase domain-containing protein  35.14 
 
 		 196 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4249  resolvase domain-containing protein  35.2 
 
 		 191 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.251845 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2147  Resolvase domain protein  35.2 
 
 		 191 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3678  Resolvase domain  34.43 
 
 		 190 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134045  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5066  resolvase domain-containing protein  37.16 
 
 		 313 aa  109  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.436238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2027  resolvase domain-containing protein  36.9 
 
 		 185 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0466  resolvase  34.07 
 
 		 193 aa  109  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.736746  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  33.88 
 
 		 185 aa  109  3e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4379  resolvase-like protein  36.7 
 
 		 197 aa  109  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.907706  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4555  resolvase-like protein  36.7 
 
 		 197 aa  109  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.849085  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  32.79 
 
 		 188 aa  109  3e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  35.48 
 
 		 201 aa  108  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5399  resolvase domain-containing protein  34.24 
 
 		 186 aa  108  5e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00909416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1397  invertase/recombinase like protein  40.97 
 
 		 176 aa  108  5e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2239  resolvase domain-containing protein  36.22 
 
 		 187 aa  108  5e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0095  resolvase domain-containing protein  35 
 
 		 189 aa  108  5e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1445  Resolvase domain  33.69 
 
 		 188 aa  108  6e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  32.24 
 
 		 191 aa  108  6e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2746  resolvase domain-containing protein  36.46 
 
 		 197 aa  107  8.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2823  resolvase domain-containing protein  36.46 
 
 		 197 aa  107  8.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0884  Resolvase domain protein  36.26 
 
 		 187 aa  107  8.000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000364698  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  36.07 
 
 		 197 aa  107  9.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4560  resolvase domain-containing protein  32.24 
 
 		 192 aa  107  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3847  resolvase-like protein  34.81 
 
 		 191 aa  107  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.388128  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3670  resolvase domain-containing protein  34.44 
 
 		 185 aa  107  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5126  Resolvase domain protein  34.95 
 
 		 197 aa  107  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.114051 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0108  hypothetical protein  34.07 
 
 		 309 aa  106  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1811  Resolvase domain protein  34.64 
 
 		 183 aa  106  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0297206  hitchhiker  0.00833685 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0086  resolvase family site-specific recombinase  31.69 
 
 		 196 aa  106  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.464664  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1992  resolvase domain-containing protein  32.24 
 
 		 206 aa  106  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  35.2 
 
 		 188 aa  106  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0189  resolvase domain-containing protein  32.24 
 
 		 206 aa  106  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  35.36 
 
 		 182 aa  106  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3928  resolvase domain-containing protein  36.26 
 
 		 191 aa  106  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.272515  hitchhiker  0.0000753359 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6307  resolvase domain-containing protein  38.76 
 
 		 209 aa  106  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1132  Resolvase domain  35.56 
 
 		 184 aa  105  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3477  resolvase domain-containing protein  31.69 
 
 		 196 aa  105  3e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0068  resolvase  35.16 
 
 		 181 aa  105  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0902003  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  34.83 
 
 		 184 aa  105  4e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.623719 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2351  resolvase-like protein  33.86 
 
 		 235 aa  105  5e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.329475 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2264  resolvase-like protein  34.97 
 
 		 183 aa  104  6e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0723164  hitchhiker  0.00531394 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  34.43 
 
 		 188 aa  104  7e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  34.25 
 
 		 194 aa  104  8e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  34.27 
 
 		 184 aa  104  9e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0019  ISSod9, DNA-invertase  33.33 
 
 		 185 aa  103  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0170  ISSod9, DNA-invertase  33.33 
 
 		 185 aa  103  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.579928  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5298  DNA-invertase hin  35.29 
 
 		 186 aa  103  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0021  resolvase-like protein  34.78 
 
 		 189 aa  103  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3231  transposon Tn2501 resolvase  37.63 
 
 		 191 aa  103  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0011  RlgA  35.91 
 
 		 186 aa  103  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.928686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4223  resolvase domain-containing protein  34.05 
 
 		 194 aa  103  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.150601  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>