More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1615 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1615  resolvase family site-specific recombinase  100 
 
 		 197 aa  387  1e-107  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3338  resolvase domain-containing protein  69.68 
 
 		 186 aa  213  1.9999999999999998e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5399  resolvase domain-containing protein  56.35 
 
 		 186 aa  207  1e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00909416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5396  resolvase domain-containing protein  50.56 
 
 		 180 aa  178  5.999999999999999e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.859533  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  47.03 
 
 		 199 aa  176  1e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0039  resolvase  49.45 
 
 		 181 aa  175  3e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  46.49 
 
 		 201 aa  174  7e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2245  resolvase domain-containing protein  51.12 
 
 		 183 aa  174  8e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0071186  normal  0.011182 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  50.83 
 
 		 188 aa  171  5.999999999999999e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0041  resolvase domain-containing protein  44.86 
 
 		 184 aa  169  2e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.0000573211 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0014  resolvase domain-containing protein  44.81 
 
 		 184 aa  167  1e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.125158  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3553  resolvase domain-containing protein  51.12 
 
 		 181 aa  167  1e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.467372  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3847  resolvase-like protein  45.65 
 
 		 191 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.388128  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1490  resolvase domain-containing protein  46.45 
 
 		 183 aa  165  4e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.832501  hitchhiker  0.00333462 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  50.28 
 
 		 182 aa  162  4.0000000000000004e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  47.75 
 
 		 185 aa  161  6e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  47.75 
 
 		 185 aa  161  6e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  47.75 
 
 		 185 aa  159  2e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1052  Resolvase domain  47.8 
 
 		 186 aa  159  3e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0536  resolvase domain-containing protein  53.04 
 
 		 203 aa  158  5e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2813  resolvase-like protein  47.28 
 
 		 184 aa  157  7e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.493253  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  47.22 
 
 		 188 aa  156  1e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  46.63 
 
 		 188 aa  155  3e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  45.26 
 
 		 188 aa  152  2e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  44.92 
 
 		 197 aa  152  2e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5450  resolvase domain-containing protein  48.31 
 
 		 184 aa  152  2.9999999999999998e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4319  resolvase-like protein  47.75 
 
 		 206 aa  152  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6307  resolvase domain-containing protein  46.63 
 
 		 209 aa  151  7e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3670  resolvase domain-containing protein  47.73 
 
 		 185 aa  150  8e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1711  integrative genetic element Gsu5, resolvase  45.81 
 
 		 190 aa  150  1e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0019  ISSod9, DNA-invertase  45.36 
 
 		 185 aa  150  1e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0170  ISSod9, DNA-invertase  45.36 
 
 		 185 aa  150  1e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.579928  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  46.11 
 
 		 184 aa  150  1e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.623719 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2147  Resolvase domain protein  48 
 
 		 191 aa  150  1e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4249  resolvase domain-containing protein  48 
 
 		 191 aa  150  1e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.251845 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  46.41 
 
 		 191 aa  150  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  46.07 
 
 		 184 aa  149  3e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5459  resolvase domain-containing protein  50 
 
 		 190 aa  149  3e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1132  Resolvase domain  47.73 
 
 		 184 aa  149  3e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  48.09 
 
 		 199 aa  149  3e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21550  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  50 
 
 		 218 aa  149  3e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.850113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  48.62 
 
 		 219 aa  149  4e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0466  resolvase  48.3 
 
 		 193 aa  148  4e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.736746  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6748  resolvase domain-containing protein  45.81 
 
 		 201 aa  148  5e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.167425 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4685  resolvase domain-containing protein  44.69 
 
 		 193 aa  148  5e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0235  resolvase domain-containing protein  46.45 
 
 		 187 aa  147  7e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0409  resolvase domain-containing protein  48.09 
 
 		 186 aa  147  7e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000318958  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3045  Resolvase domain protein  46.67 
 
 		 189 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  44.09 
 
 		 188 aa  146  2.0000000000000003e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1006  Resolvase domain protein  45.45 
 
 		 189 aa  145  4.0000000000000006e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3124  resolvase domain-containing protein  43.46 
 
 		 194 aa  145  5e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0904767  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5431  Resolvase domain protein  44.26 
 
 		 185 aa  144  9e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4123  resolvase domain-containing protein  44.81 
 
 		 185 aa  144  1e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0694671 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  41.5 
 
 		 201 aa  142  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0002  resolvase  40 
 
 		 190 aa  143  2e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141759  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3714  resolvase domain-containing protein  43.33 
 
 		 188 aa  142  4e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.566828  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01209  bacteriocin production protein  40.43 
 
 		 198 aa  141  5e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000702686  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2144  Resolvase domain protein  45.23 
 
 		 196 aa  141  5e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0618608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4383  resolvase  46.02 
 
 		 193 aa  141  8e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2582  resolvase domain-containing protein  43.96 
 
 		 185 aa  140  9e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0466  Resolvase domain  46.49 
 
 		 205 aa  140  9.999999999999999e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.418385  normal  0.0169839 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2355  Resolvase domain protein  46.07 
 
 		 186 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.230305  normal  0.6636 
 
 
-
 
NC_008264  CPR_B0006  resolvase  38.42 
 
 		 189 aa  140  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00548662  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  45.83 
 
 		 194 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5126  Resolvase domain protein  44.75 
 
 		 197 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.114051 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2363  resolvase-like protein  46.15 
 
 		 228 aa  139  3e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.379523  normal  0.343568 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0167  resolvase domain-containing protein  41.62 
 
 		 196 aa  138  4.999999999999999e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20410  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  41.15 
 
 		 194 aa  137  8.999999999999999e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0661103 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25710  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  47.06 
 
 		 201 aa  135  3.0000000000000003e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1090  resolvase domain-containing protein  46.41 
 
 		 159 aa  135  4e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  38.38 
 
 		 192 aa  135  4e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5093  resolvase domain-containing protein  47.19 
 
 		 201 aa  135  5e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.993134 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0854  invertase/recombinase like protein  42.08 
 
 		 198 aa  134  7.000000000000001e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.160403  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0011  RlgA  47.25 
 
 		 186 aa  134  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.928686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5037  resolvase domain-containing protein  42.11 
 
 		 201 aa  134  8e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.931406  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4991  resolvase domain-containing protein  47.19 
 
 		 189 aa  134  9e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1326  resolvase domain-containing protein  43.41 
 
 		 180 aa  134  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3678  Resolvase domain  41.3 
 
 		 190 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134045  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6634  resolvase domain-containing protein  45.11 
 
 		 198 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000708994  hitchhiker  0.0000367715 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0233  resolvase  38.04 
 
 		 183 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4835  Resolvase domain protein  45.11 
 
 		 201 aa  132  3.9999999999999996e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.291279 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0202  resolvase  38.04 
 
 		 183 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0605  resolvase domain-containing protein  45.6 
 
 		 186 aa  132  5e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.177837 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0580  resolvase domain-containing protein  45.6 
 
 		 186 aa  132  5e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0611  Resolvase domain protein  45.6 
 
 		 186 aa  132  5e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0260  resolvase family site-specific recombinase  43.65 
 
 		 205 aa  131  6e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1082  resolvase family site-specific recombinase  43.65 
 
 		 205 aa  131  6e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271311  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4228  resolvase family site-specific recombinase  40.45 
 
 		 187 aa  130  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.623835  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0021  resolvase-like protein  44.94 
 
 		 189 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2392  Resolvase domain  40.86 
 
 		 197 aa  130  1.0000000000000001e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000064315  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0471  resolvase  42.63 
 
 		 197 aa  130  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3112  Resolvase domain protein  44.94 
 
 		 184 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0149  resolvase  40.32 
 
 		 189 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4382  resolvase domain-containing protein  44.75 
 
 		 194 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5298  DNA-invertase hin  39.46 
 
 		 186 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3256  Fis family transcriptional regulator  68.04 
 
 		 116 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0578977  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D08  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  42.24 
 
 		 193 aa  129  3e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.942713  n/a   
 
 
-
 
NC_009660  Krad_4707  resolvase domain-containing protein  46.96 
 
 		 190 aa  129  3e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2172  recombinase  45.25 
 
 		 214 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0678128  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08245  resolvase  40.33 
 
 		 179 aa  128  5.0000000000000004e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>