More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3256 on replicon NC_009467
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009467  Acry_3256  Fis family transcriptional regulator  100 
 
 		 116 aa  234  3e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0578977  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3338  resolvase domain-containing protein  92.78 
 
 		 186 aa  179  1e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1615  resolvase family site-specific recombinase  68.04 
 
 		 197 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5399  resolvase domain-containing protein  53.12 
 
 		 186 aa  99.8  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00909416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2245  resolvase domain-containing protein  49.45 
 
 		 183 aa  89.7  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0071186  normal  0.011182 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1090  resolvase domain-containing protein  48.35 
 
 		 159 aa  88.2  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21550  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  49.06 
 
 		 218 aa  87.4  5e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.850113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0014  resolvase domain-containing protein  37.27 
 
 		 184 aa  85.5  2e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.125158  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0041  resolvase domain-containing protein  38.18 
 
 		 184 aa  85.9  2e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.0000573211 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3847  resolvase-like protein  45.36 
 
 		 191 aa  84.3  5e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.388128  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5396  resolvase domain-containing protein  46.24 
 
 		 180 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.859533  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5450  resolvase domain-containing protein  48.94 
 
 		 184 aa  80.5  0.000000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3553  resolvase domain-containing protein  49.45 
 
 		 181 aa  80.1  0.000000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.467372  n/a   
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2813  resolvase-like protein  47.73 
 
 		 184 aa  78.6  0.00000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.493253  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  46.59 
 
 		 182 aa  75.5  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2258  resolvase domain-containing protein  46.59 
 
 		 195 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.880923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1490  resolvase domain-containing protein  38.3 
 
 		 183 aa  74.7  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.832501  hitchhiker  0.00333462 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0039  resolvase  44.21 
 
 		 181 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  44.94 
 
 		 219 aa  74.3  0.0000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  46.15 
 
 		 201 aa  73.9  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  40.91 
 
 		 192 aa  73.9  0.0000000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  43.02 
 
 		 191 aa  72.8  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  43.96 
 
 		 194 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0991  resolvase domain-containing protein  46.43 
 
 		 205 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0378771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1445  Resolvase domain  45.98 
 
 		 188 aa  70.5  0.000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  35.05 
 
 		 199 aa  70.1  0.000000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2392  Resolvase domain  41.67 
 
 		 197 aa  70.5  0.000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000064315  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2823  resolvase domain-containing protein  39.77 
 
 		 197 aa  70.1  0.000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2746  resolvase domain-containing protein  39.77 
 
 		 197 aa  70.1  0.000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2550  Resolvase domain  43.33 
 
 		 196 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.819685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4731  Resolvase domain protein  48.35 
 
 		 187 aa  70.1  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  36.08 
 
 		 201 aa  69.3  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  40.7 
 
 		 188 aa  69.7  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2144  Resolvase domain protein  43.33 
 
 		 196 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0618608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2668  helix-turn-helix, Fis-type  44.05 
 
 		 204 aa  68.2  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00804941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1568  helix-turn-helix, Fis-type  44.05 
 
 		 204 aa  68.2  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2363  resolvase-like protein  43.64 
 
 		 228 aa  68.2  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.379523  normal  0.343568 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5126  Resolvase domain protein  44.83 
 
 		 197 aa  68.2  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.114051 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4319  resolvase-like protein  44.09 
 
 		 206 aa  68.2  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6608  resolvase domain-containing protein  43.88 
 
 		 189 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.525053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25710  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  41.24 
 
 		 201 aa  67.4  0.00000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2147  Resolvase domain protein  44.58 
 
 		 191 aa  67.4  0.00000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4249  resolvase domain-containing protein  44.58 
 
 		 191 aa  67.4  0.00000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.251845 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  39.77 
 
 		 188 aa  67  0.00000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3045  Resolvase domain protein  47.62 
 
 		 189 aa  66.2  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0854  invertase/recombinase like protein  39.58 
 
 		 198 aa  66.6  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.160403  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25950  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  46.51 
 
 		 195 aa  66.2  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1052  Resolvase domain  39.08 
 
 		 186 aa  65.5  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2173  resolvase domain-containing protein  37.5 
 
 		 196 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2084  resolvase domain-containing protein  37.5 
 
 		 196 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0536  resolvase domain-containing protein  47.87 
 
 		 203 aa  65.9  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4991  resolvase domain-containing protein  41.76 
 
 		 189 aa  65.9  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0481  integrase catalytic region  48.28 
 
 		 463 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2979  resolvase domain-containing protein  43.9 
 
 		 98 aa  65.5  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000276011 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4419  resolvase domain-containing protein  37.5 
 
 		 196 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00736052  normal  0.464308 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4223  resolvase domain-containing protein  36.61 
 
 		 194 aa  65.5  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.150601  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0019  ISSod9, DNA-invertase  43.02 
 
 		 185 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0170  ISSod9, DNA-invertase  43.02 
 
 		 185 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.579928  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  44.05 
 
 		 185 aa  65.1  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1397  Resolvase domain protein  42.27 
 
 		 209 aa  65.1  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.954133  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4382  resolvase domain-containing protein  43.02 
 
 		 194 aa  65.1  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0348  Resolvase domain protein  49.4 
 
 		 209 aa  65.1  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4459  resolvase  39.8 
 
 		 190 aa  64.7  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4290  resolvase  39.8 
 
 		 190 aa  64.7  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4190  resolvase  39.8 
 
 		 190 aa  64.7  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4128  Resolvase domain protein  45.05 
 
 		 231 aa  64.7  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20410  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  43.3 
 
 		 194 aa  64.3  0.0000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0661103 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1803  resolvase domain-containing protein  37.27 
 
 		 193 aa  64.3  0.0000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3683  resolvase domain-containing protein  41.57 
 
 		 215 aa  64.3  0.0000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9833  Resolvase Protein  48.86 
 
 		 210 aa  64.3  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0167  resolvase domain-containing protein  44.44 
 
 		 196 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2132  resolvase domain-containing protein  39.53 
 
 		 198 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0356691 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2100  Resolvase domain protein  33.06 
 
 		 196 aa  63.5  0.0000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000956779  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0002  DNA-invertase, C-terminal region  37.78 
 
 		 114 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01345  predicted site-specific recombinase  33.06 
 
 		 196 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01504  predicted site-specific recombinase  33.06 
 
 		 196 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.133152  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2272  Resolvase domain protein  33.06 
 
 		 196 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.861059  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  42.86 
 
 		 185 aa  62.8  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01357  hypothetical protein  33.06 
 
 		 196 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01515  hypothetical protein  33.06 
 
 		 196 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.088804  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1754  site-specific recombinase resolvase family protein PinR  33.06 
 
 		 196 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0427296  n/a   
 
 
-
 
NC_008264  CPR_B0006  resolvase  36.46 
 
 		 189 aa  63.2  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00548662  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2113  resolvase domain-containing protein  33.06 
 
 		 196 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0120982  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0052  hypothetical protein  43.33 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1635  site-specific recombinase resolvase family protein PinR  33.06 
 
 		 196 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00540929  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4668  resolvase domain-containing protein  37.61 
 
 		 189 aa  62  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4775  resolvase domain-containing protein  37.61 
 
 		 189 aa  62  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6748  resolvase domain-containing protein  40.57 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.167425 
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0002  resolvase  35.42 
 
 		 190 aa  62.8  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141759  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  45.35 
 
 		 184 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.623719 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6307  resolvase domain-containing protein  42.86 
 
 		 209 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3694  resolvase domain-containing protein  41.67 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0095  resolvase domain-containing protein  40.91 
 
 		 189 aa  62.4  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5459  resolvase domain-containing protein  44.05 
 
 		 190 aa  61.6  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3662  Resolvase domain protein  33.7 
 
 		 188 aa  61.6  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  45.24 
 
 		 184 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0471  resolvase  36.08 
 
 		 197 aa  61.2  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  40.7 
 
 		 199 aa  61.2  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0011  resolvase, putative  33.65 
 
 		 181 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2172  recombinase  40 
 
 		 214 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0678128  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>