241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2979 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_2979  resolvase domain-containing protein  100 
 
 		 98 aa  196  7e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000276011 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21550  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  68.67 
 
 		 218 aa  115  9.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.850113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2363  resolvase-like protein  59.76 
 
 		 228 aa  93.6  9e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.379523  normal  0.343568 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  48.89 
 
 		 219 aa  84  7e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  48.72 
 
 		 191 aa  81.3  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6375  hypothetical protein  56.94 
 
 		 103 aa  77.4  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  47.5 
 
 		 182 aa  75.9  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2813  resolvase-like protein  38.75 
 
 		 184 aa  71.2  0.000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.493253  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4991  resolvase domain-containing protein  46.91 
 
 		 189 aa  70.9  0.000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6608  resolvase domain-containing protein  50 
 
 		 189 aa  70.1  0.000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.525053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9833  Resolvase Protein  47.37 
 
 		 210 aa  69.3  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0235  resolvase domain-containing protein  41.98 
 
 		 187 aa  69.3  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3338  resolvase domain-containing protein  43.9 
 
 		 186 aa  68.6  0.00000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3007  resolvase-like protein  43.42 
 
 		 204 aa  67.8  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0154323 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4042  serine-based site-specific recombinase activity  43.42 
 
 		 204 aa  67.8  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.890679  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4975  serine-based site-specific recombinase activity  43.42 
 
 		 204 aa  67.8  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.283487  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  40 
 
 		 199 aa  67  0.00000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0481  integrase catalytic region  47.44 
 
 		 463 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3256  Fis family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 116 aa  65.5  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0578977  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2347  Resolvase domain protein  44.74 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  31.96 
 
 		 201 aa  64.7  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0019  ISSod9, DNA-invertase  46.34 
 
 		 185 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0170  ISSod9, DNA-invertase  46.34 
 
 		 185 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.579928  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0014  resolvase domain-containing protein  41.25 
 
 		 184 aa  64.7  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.125158  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3045  Resolvase domain protein  45.68 
 
 		 189 aa  64.7  0.0000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1209  putative resolvase  39.53 
 
 		 176 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4319  resolvase-like protein  43.82 
 
 		 206 aa  64.7  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0202  resolvase  37.5 
 
 		 183 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0233  resolvase  37.5 
 
 		 183 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0068  resolvase  40 
 
 		 181 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0902003  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5037  resolvase domain-containing protein  40 
 
 		 201 aa  63.9  0.0000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.931406  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1568  helix-turn-helix, Fis-type  43.42 
 
 		 204 aa  62.8  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2668  helix-turn-helix, Fis-type  43.42 
 
 		 204 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00804941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  40 
 
 		 199 aa  63.2  0.000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  44.3 
 
 		 188 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  45.57 
 
 		 188 aa  63.2  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  38.2 
 
 		 194 aa  63.5  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  38.27 
 
 		 188 aa  63.2  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0095  resolvase domain-containing protein  42.05 
 
 		 189 aa  63.2  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0409  resolvase domain-containing protein  40.74 
 
 		 186 aa  63.2  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000318958  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  46.84 
 
 		 184 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.623719 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4382  resolvase domain-containing protein  39.24 
 
 		 194 aa  61.6  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4685  resolvase domain-containing protein  41.38 
 
 		 193 aa  62  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25710  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  35.23 
 
 		 201 aa  61.6  0.000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0041  resolvase domain-containing protein  40 
 
 		 184 aa  61.6  0.000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.0000573211 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0991  resolvase domain-containing protein  42.11 
 
 		 205 aa  62  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0378771  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  45.57 
 
 		 184 aa  61.2  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  44.3 
 
 		 188 aa  61.6  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  43.9 
 
 		 185 aa  61.2  0.000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  44.3 
 
 		 190 aa  61.2  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1397  Resolvase domain protein  37.5 
 
 		 209 aa  60.8  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.954133  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2172  recombinase  39.77 
 
 		 214 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0678128  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4775  resolvase domain-containing protein  40.23 
 
 		 189 aa  60.8  0.000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4668  resolvase domain-containing protein  40.23 
 
 		 189 aa  60.8  0.000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  44.3 
 
 		 187 aa  60.8  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3694  resolvase domain-containing protein  40.79 
 
 		 206 aa  60.8  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0536  resolvase domain-containing protein  42.5 
 
 		 203 aa  60.5  0.000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2550  Resolvase domain  40.74 
 
 		 196 aa  60.1  0.000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.819685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5298  DNA-invertase hin  38.55 
 
 		 186 aa  60.1  0.000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  44.3 
 
 		 188 aa  60.5  0.000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0053  hypothetical protein  38.96 
 
 		 90 aa  60.1  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  38.75 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3440  invertase/recombinase protein  35.8 
 
 		 188 aa  60.1  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.115695  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  42.68 
 
 		 185 aa  59.7  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  42.68 
 
 		 185 aa  59.7  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  43.04 
 
 		 197 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0149  resolvase  34.18 
 
 		 189 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6634  resolvase domain-containing protein  41.84 
 
 		 198 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000708994  hitchhiker  0.0000367715 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0052  hypothetical protein  42.31 
 
 		 201 aa  58.2  0.00000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0002  DNA-invertase, C-terminal region  33.33 
 
 		 114 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1645  resolvase-like protein  38.1 
 
 		 213 aa  58.2  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.27327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3714  resolvase domain-containing protein  41.77 
 
 		 188 aa  58.2  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.566828  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0167  resolvase domain-containing protein  40.74 
 
 		 196 aa  57.8  0.00000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2144  Resolvase domain protein  38.1 
 
 		 196 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0618608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009660  Krad_4707  resolvase domain-containing protein  52.56 
 
 		 190 aa  57.8  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2702  resolvase domain-containing protein  48.15 
 
 		 307 aa  57.8  0.00000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.264305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2944  resolvase domain-containing protein  48.15 
 
 		 307 aa  57.8  0.00000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.857733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1490  resolvase domain-containing protein  37.5 
 
 		 183 aa  57.8  0.00000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.832501  hitchhiker  0.00333462 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4137  resolvase domain-containing protein  38.64 
 
 		 224 aa  57.8  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.130251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2795  resolvase family site-specific recombinase  36.49 
 
 		 81 aa  57  0.00000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.127054  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3683  resolvase domain-containing protein  44.59 
 
 		 215 aa  57  0.00000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  35.71 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6307  resolvase domain-containing protein  43.42 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0466  resolvase  40.7 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.736746  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3876  resolvase domain-containing protein  35.56 
 
 		 199 aa  56.2  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.3792 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5431  Resolvase domain protein  41.46 
 
 		 185 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4081  resolvase domain-containing protein  35.56 
 
 		 199 aa  56.2  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0381075 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0471  resolvase  33.75 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2111  Resolvase domain protein  40.48 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.813305  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3680  resolvase domain-containing protein  35.56 
 
 		 199 aa  56.2  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1202  resolvase domain-containing protein  37.5 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4123  resolvase domain-containing protein  41.46 
 
 		 185 aa  56.2  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0694671 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3562  resolvase domain-containing protein  43.24 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2392  Resolvase domain  40 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000064315  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4459  resolvase  34.48 
 
 		 190 aa  55.1  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4290  resolvase  34.48 
 
 		 190 aa  55.1  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4190  resolvase  34.48 
 
 		 190 aa  55.1  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5399  resolvase domain-containing protein  36.25 
 
 		 186 aa  55.1  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00909416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2147  Resolvase domain protein  41.33 
 
 		 191 aa  54.7  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4249  resolvase domain-containing protein  41.33 
 
 		 191 aa  54.7  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.251845 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>