More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C1209 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C1209  putative resolvase  100 
 
 		 176 aa  350  8e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3007  resolvase-like protein  96 
 
 		 204 aa  286  8e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0154323 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4042  serine-based site-specific recombinase activity  96 
 
 		 204 aa  286  8e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.890679  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4975  serine-based site-specific recombinase activity  96 
 
 		 204 aa  286  8e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.283487  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2347  Resolvase domain protein  87.01 
 
 		 204 aa  272  2.0000000000000002e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3694  resolvase domain-containing protein  85.14 
 
 		 206 aa  258  4e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9833  Resolvase Protein  77.18 
 
 		 210 aa  233  1.0000000000000001e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0991  resolvase domain-containing protein  66.67 
 
 		 205 aa  211  4.9999999999999996e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0378771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2668  helix-turn-helix, Fis-type  70.07 
 
 		 204 aa  209  1e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00804941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2332  resolvase domain-containing protein  72 
 
 		 227 aa  209  1e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1568  helix-turn-helix, Fis-type  70.07 
 
 		 204 aa  209  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3683  resolvase domain-containing protein  65.99 
 
 		 215 aa  196  2.0000000000000003e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5126  Resolvase domain protein  59.71 
 
 		 197 aa  149  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.114051 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0854  invertase/recombinase like protein  53.9 
 
 		 198 aa  145  4.0000000000000006e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.160403  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0022  resolvase-like protein  91.03 
 
 		 133 aa  142  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.119432  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2392  Resolvase domain  53.73 
 
 		 197 aa  139  1.9999999999999998e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000064315  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  55.97 
 
 		 182 aa  139  1.9999999999999998e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  56.82 
 
 		 219 aa  139  3e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0052  hypothetical protein  52.52 
 
 		 201 aa  131  3.9999999999999996e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5037  resolvase domain-containing protein  50.76 
 
 		 201 aa  131  3.9999999999999996e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.931406  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4931  resolvase domain-containing protein  55.77 
 
 		 208 aa  131  5e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.107506  normal  0.566204 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  51.88 
 
 		 191 aa  131  5e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  50.74 
 
 		 201 aa  127  7.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  51.49 
 
 		 194 aa  127  9.000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  52.34 
 
 		 199 aa  127  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0235  resolvase domain-containing protein  50.71 
 
 		 187 aa  126  2.0000000000000002e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1397  invertase/recombinase like protein  57.94 
 
 		 176 aa  124  9e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4991  resolvase domain-containing protein  48.87 
 
 		 189 aa  123  1e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0409  resolvase domain-containing protein  50.78 
 
 		 186 aa  123  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000318958  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21550  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  51.77 
 
 		 218 aa  122  3e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.850113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0167  resolvase domain-containing protein  46.76 
 
 		 196 aa  121  4e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6307  resolvase domain-containing protein  48.2 
 
 		 209 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3562  resolvase domain-containing protein  48.98 
 
 		 208 aa  120  9.999999999999999e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0108  hypothetical protein  46.31 
 
 		 309 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2111  Resolvase domain protein  47.06 
 
 		 191 aa  119  3e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.813305  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4479  Resolvase domain protein  47.06 
 
 		 197 aa  118  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000147912 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3440  invertase/recombinase protein  47.79 
 
 		 188 aa  118  3.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.115695  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1852  Resolvase domain  47.06 
 
 		 197 aa  118  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.064893  hitchhiker  0.000000000000388244 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5339  DNA-invertase  47.06 
 
 		 192 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.687343  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1477  Resolvase domain  47.06 
 
 		 197 aa  118  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.79192  unclonable  0.0000000000000150315 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6748  resolvase domain-containing protein  58.04 
 
 		 201 aa  118  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.167425 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2944  resolvase domain-containing protein  47.48 
 
 		 307 aa  117  7e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.857733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2702  resolvase domain-containing protein  47.48 
 
 		 307 aa  117  7e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.264305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009660  Krad_4707  resolvase domain-containing protein  55.73 
 
 		 190 aa  117  9.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4382  resolvase domain-containing protein  47.73 
 
 		 194 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1093  Resolvase domain  52.99 
 
 		 196 aa  115  3e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.531001  normal  1 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  42.42 
 
 		 192 aa  115  3.9999999999999997e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2363  resolvase-like protein  49.65 
 
 		 228 aa  115  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.379523  normal  0.343568 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  44.58 
 
 		 188 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0466  resolvase  49.24 
 
 		 193 aa  115  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.736746  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4383  resolvase  49.26 
 
 		 193 aa  115  5e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3714  resolvase domain-containing protein  49.28 
 
 		 188 aa  114  8.999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.566828  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4459  resolvase  47.52 
 
 		 190 aa  113  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4290  resolvase  47.52 
 
 		 190 aa  113  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4190  resolvase  47.52 
 
 		 190 aa  113  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2147  Resolvase domain protein  60.19 
 
 		 191 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4249  resolvase domain-containing protein  60.19 
 
 		 191 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.251845 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6634  resolvase domain-containing protein  47.1 
 
 		 198 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000708994  hitchhiker  0.0000367715 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  47.76 
 
 		 188 aa  112  3e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0019  ISSod9, DNA-invertase  49.23 
 
 		 185 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0170  ISSod9, DNA-invertase  49.23 
 
 		 185 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.579928  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  46.88 
 
 		 188 aa  111  4.0000000000000004e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4123  resolvase domain-containing protein  46.3 
 
 		 185 aa  111  5e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0694671 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4835  Resolvase domain protein  49.64 
 
 		 201 aa  111  6e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.291279 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  47.1 
 
 		 185 aa  111  6e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5431  Resolvase domain protein  48.48 
 
 		 185 aa  111  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2813  resolvase-like protein  46.32 
 
 		 184 aa  110  7.000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.493253  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  47.06 
 
 		 185 aa  110  8.000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5424  Resolvase domain  48.44 
 
 		 194 aa  110  8.000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0348  Resolvase domain protein  55.81 
 
 		 209 aa  110  8.000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4137  resolvase domain-containing protein  45 
 
 		 224 aa  110  8.000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.130251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5457  hypothetical protein  48.44 
 
 		 194 aa  110  8.000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4685  resolvase domain-containing protein  44.76 
 
 		 193 aa  108  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  47.73 
 
 		 185 aa  108  3e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  48.51 
 
 		 197 aa  108  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0068  resolvase  40.74 
 
 		 181 aa  108  5e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0902003  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2258  resolvase domain-containing protein  45.52 
 
 		 195 aa  108  5e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.880923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  47.52 
 
 		 188 aa  107  6e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0536  resolvase domain-containing protein  50.38 
 
 		 203 aa  107  9.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201567  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  48.2 
 
 		 184 aa  107  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1490  resolvase domain-containing protein  41.91 
 
 		 183 aa  107  1e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.832501  hitchhiker  0.00333462 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  48.2 
 
 		 184 aa  105  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.623719 
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2746  resolvase domain-containing protein  40.91 
 
 		 197 aa  105  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2823  resolvase domain-containing protein  40.91 
 
 		 197 aa  105  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0095  resolvase domain-containing protein  45.11 
 
 		 189 aa  104  6e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4731  Resolvase domain protein  44.6 
 
 		 187 aa  103  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4319  resolvase-like protein  46.67 
 
 		 206 aa  103  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0202  resolvase  39.55 
 
 		 183 aa  102  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0233  resolvase  39.55 
 
 		 183 aa  102  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0585  resolvase-like protein  51.15 
 
 		 189 aa  103  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.698292  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0041  resolvase domain-containing protein  39.71 
 
 		 184 aa  102  3e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.0000573211 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1202  resolvase domain-containing protein  42.14 
 
 		 194 aa  102  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0014  resolvase domain-containing protein  38.97 
 
 		 184 aa  102  4e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.125158  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3045  Resolvase domain protein  56.7 
 
 		 189 aa  101  6e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  55.43 
 
 		 188 aa  101  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  55.43 
 
 		 190 aa  100  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  55.43 
 
 		 187 aa  100  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  35.62 
 
 		 199 aa  100  9e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3570  resolvase domain-containing protein  50.74 
 
 		 197 aa  100  1e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3497  resolvase domain-containing protein  50.74 
 
 		 219 aa  99.8  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.503079  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>