More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0481 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_0481  integrase catalytic region  100 
 
 
463 aa  953    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2721  Integrase catalytic region  68.84 
 
 
330 aa  476  1e-133  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.562875  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2422  Integrase catalytic region  68.45 
 
 
330 aa  473  1e-132  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1668  Integrase catalytic region  68.55 
 
 
330 aa  473  1e-132  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.412192  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0692  Integrase catalytic region  68.55 
 
 
330 aa  473  1e-132  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.229145  normal  0.133209 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3258  Integrase catalytic region  68.45 
 
 
330 aa  471  1e-132  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1875  Integrase catalytic region  68.15 
 
 
355 aa  468  9.999999999999999e-131  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0702445 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2917  integrase, catalytic region  67.96 
 
 
321 aa  465  9.999999999999999e-131  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.437302 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2291  Integrase catalytic region  68.15 
 
 
348 aa  468  9.999999999999999e-131  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.152349 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2899  integrase, catalytic region  65.77 
 
 
327 aa  464  1e-129  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0219368 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2918  integrase, catalytic region  65.57 
 
 
316 aa  459  9.999999999999999e-129  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0308  integrase, catalytic region  65.47 
 
 
316 aa  457  1e-127  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0481  integrase, catalytic region  65.47 
 
 
316 aa  457  1e-127  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.791017  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1097  integrase, catalytic region  65.47 
 
 
316 aa  457  1e-127  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.495543  normal  0.303219 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1296  integrase, catalytic region  65.47 
 
 
316 aa  457  1e-127  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1717  integrase, catalytic region  65.47 
 
 
316 aa  457  1e-127  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0171721  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2225  integrase, catalytic region  65.17 
 
 
316 aa  456  1e-127  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00213091  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2818  integrase, catalytic region  65.47 
 
 
316 aa  457  1e-127  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3743  hypothetical protein  64.07 
 
 
319 aa  435  1e-120  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1814  integrase catalytic subunit  64.07 
 
 
319 aa  435  1e-120  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0485004  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0053  integrase catalytic subunit  64.07 
 
 
319 aa  435  1e-120  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.142705  normal  0.776199 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3839  hypothetical protein  64.07 
 
 
319 aa  435  1e-120  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.247548  normal  0.0595051 
 
 
-
 
NC_002978  WD0176  transposase, putative  60.9 
 
 
320 aa  426  1e-118  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5447  Integrase catalytic region  67.58 
 
 
277 aa  412  1e-114  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.681137  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1293  integrase, catalytic region  60.96 
 
 
329 aa  408  1e-113  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.345302  normal  0.407109 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0366  integrase, catalytic region  60.66 
 
 
329 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.680873 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0122  integrase, catalytic region  96.59 
 
 
221 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0224  integrase catalytic subunit  54.35 
 
 
316 aa  351  2e-95  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1054  integrase catalytic subunit  54.35 
 
 
316 aa  351  2e-95  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.161609  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1353  integrase catalytic subunit  54.35 
 
 
316 aa  351  2e-95  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.4232  normal  0.0729626 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1767  integrase catalytic subunit  54.35 
 
 
316 aa  351  2e-95  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.417793 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1780  integrase catalytic subunit  54.35 
 
 
316 aa  351  2e-95  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0228632  normal  0.851382 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2400  integrase catalytic subunit  54.35 
 
 
316 aa  351  2e-95  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.61618  normal  0.0278741 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3372  integrase catalytic region  52.41 
 
 
321 aa  345  7e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0838  integrase, catalytic region  59.26 
 
 
286 aa  344  2e-93  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.204021  hitchhiker  0.00436144 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2850  integrase, catalytic region  60.78 
 
 
329 aa  343  2.9999999999999997e-93  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0952  hypothetical protein  50 
 
 
320 aa  338  9e-92  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1273  hypothetical protein  51.42 
 
 
314 aa  337  2.9999999999999997e-91  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0999856 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0554  hypothetical protein  52.48 
 
 
314 aa  337  2.9999999999999997e-91  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000279647 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1176  hypothetical protein  52.04 
 
 
284 aa  309  6.999999999999999e-83  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.118975 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7134  Integrase catalytic core  63.6 
 
 
303 aa  303  4.0000000000000003e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25530  Integrase, catalytic domain-containing protein  53.9 
 
 
265 aa  299  7e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3474  hypothetical protein  68.02 
 
 
206 aa  278  1e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.180544 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1515  integrase catalytic region  72.73 
 
 
178 aa  268  2e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.60322  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2557  integrase, catalytic region  72.26 
 
 
188 aa  242  1e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.805017  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0529  integrase, catalytic core  52.24 
 
 
259 aa  239  1e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0142  integrase, catalytic region  90.99 
 
 
111 aa  214  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2839  integrase, catalytic region  60 
 
 
153 aa  200  5e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.489873  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1128  integrase catalytic subunit  47.83 
 
 
280 aa  193  5e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2660  integrase catalytic subunit  37.2 
 
 
323 aa  174  3.9999999999999995e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.271661 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1301  integrase catalytic subunit  34.89 
 
 
321 aa  172  9e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.117909 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1251  integrase catalytic subunit  34.89 
 
 
333 aa  172  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.093017 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4152  transposase ISRme5 (copy d)  34.89 
 
 
321 aa  172  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.29962  normal  0.334182 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1280  integrase catalytic subunit  34.89 
 
 
463 aa  172  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.722165  normal  0.296416 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1401  integrase catalytic subunit  36.86 
 
 
323 aa  167  5e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3549  integrase catalytic region  44.56 
 
 
216 aa  166  8e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.032093 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1424  integrase catalytic subunit  36.86 
 
 
323 aa  166  9e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3709  Integrase catalytic region  36.95 
 
 
325 aa  162  1e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal  0.108327 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0021  putative integrase  36.48 
 
 
332 aa  160  4e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.468061 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0344  Integrase catalytic region  36.76 
 
 
325 aa  160  5e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000845152  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0793  putative integrase  36.48 
 
 
343 aa  160  6e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.638394 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1631  Integrase catalytic region  34.03 
 
 
329 aa  159  7e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3472  hypothetical protein  54.97 
 
 
170 aa  159  8e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.119399 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2535  integrase catalytic subunit  36.25 
 
 
323 aa  158  2e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.557756 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0443  integrase, catalytic region  90 
 
 
83 aa  155  1e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.818125 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0120  hypothetical protein  32.25 
 
 
497 aa  145  2e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2194  putative transposase  32.65 
 
 
329 aa  144  2e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2728  putative transposase  32.65 
 
 
441 aa  145  2e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7791  Integrase catalytic region  33.02 
 
 
323 aa  144  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.562755  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0917  transposase  32.65 
 
 
327 aa  144  3e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2179  transposase  32.65 
 
 
325 aa  144  3e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2250  putative transposase  32.65 
 
 
333 aa  144  3e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2493  transposase, putative  32.65 
 
 
325 aa  144  3e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1378  putative integrase  32.26 
 
 
325 aa  143  6e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00372186  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1782  putative integrase  32.35 
 
 
325 aa  142  9e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4022  Integrase catalytic region  30.15 
 
 
330 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.500717  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5037  Integrase catalytic region  32.89 
 
 
274 aa  121  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  53.97 
 
 
199 aa  115  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  55.96 
 
 
182 aa  114  4.0000000000000004e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2447  integrase catalytic subunit  34.23 
 
 
238 aa  114  5e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  55.56 
 
 
219 aa  111  3e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  53.78 
 
 
191 aa  111  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0409  resolvase domain-containing protein  57.69 
 
 
186 aa  110  7.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000318958  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0235  resolvase domain-containing protein  54.63 
 
 
187 aa  108  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4382  resolvase domain-containing protein  51.28 
 
 
194 aa  106  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4991  resolvase domain-containing protein  50.93 
 
 
189 aa  104  4e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2147  Resolvase domain protein  55.24 
 
 
191 aa  103  6e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4249  resolvase domain-containing protein  55.24 
 
 
191 aa  103  6e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.251845 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  52.48 
 
 
194 aa  101  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5037  resolvase domain-containing protein  45.05 
 
 
201 aa  101  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.931406  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  45.31 
 
 
201 aa  101  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33450  integrase, catalytic core  56.25 
 
 
185 aa  100  5e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5016  hypothetical protein  66.25 
 
 
114 aa  99  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6497  resolvase domain-containing protein  46.09 
 
 
193 aa  99.4  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6403  resolvase domain-containing protein  45.69 
 
 
193 aa  99  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4685  resolvase domain-containing protein  50.44 
 
 
193 aa  99  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6373  resolvase domain-containing protein  45.69 
 
 
193 aa  99  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01280  transposase  38.07 
 
 
216 aa  98.2  3e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0995831  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00518  transposase  38.07 
 
 
216 aa  98.2  3e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21550  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  52.78 
 
 
218 aa  97.8  4e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.850113  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>