94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6375 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6375  hypothetical protein  100 
 
 		 103 aa  202  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2363  resolvase-like protein  91.3 
 
 		 228 aa  167  4e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.379523  normal  0.343568 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21550  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  71.83 
 
 		 218 aa  98.6  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.850113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2979  resolvase domain-containing protein  56.94 
 
 		 98 aa  77.4  0.00000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000276011 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  47.06 
 
 		 219 aa  62  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0014  resolvase domain-containing protein  43.48 
 
 		 184 aa  58.5  0.00000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.125158  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4975  serine-based site-specific recombinase activity  43.04 
 
 		 204 aa  58.5  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.283487  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4042  serine-based site-specific recombinase activity  43.04 
 
 		 204 aa  58.5  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.890679  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3007  resolvase-like protein  43.04 
 
 		 204 aa  58.5  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0154323 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  42.25 
 
 		 191 aa  57  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3683  resolvase domain-containing protein  41.77 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2347  Resolvase domain protein  42.31 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1568  helix-turn-helix, Fis-type  38.37 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0991  resolvase domain-containing protein  40.51 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0378771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1209  putative resolvase  41.77 
 
 		 176 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2668  helix-turn-helix, Fis-type  38.37 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00804941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0466  resolvase  51.52 
 
 		 193 aa  54.7  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.736746  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4991  resolvase domain-containing protein  45.59 
 
 		 189 aa  54.3  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  42.65 
 
 		 194 aa  53.9  0.0000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4382  resolvase domain-containing protein  41.03 
 
 		 194 aa  53.9  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0041  resolvase domain-containing protein  40.58 
 
 		 184 aa  54.3  0.0000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.0000573211 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6403  resolvase domain-containing protein  43.48 
 
 		 193 aa  52.8  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6373  resolvase domain-containing protein  43.48 
 
 		 193 aa  52.8  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4383  resolvase  48.48 
 
 		 193 aa  52.4  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6497  resolvase domain-containing protein  43.48 
 
 		 193 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  39.47 
 
 		 201 aa  51.6  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5037  resolvase domain-containing protein  36.25 
 
 		 201 aa  52  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.931406  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9833  Resolvase Protein  42.65 
 
 		 210 aa  51.2  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  36.84 
 
 		 201 aa  51.2  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1490  resolvase domain-containing protein  39.13 
 
 		 183 aa  50.8  0.000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.832501  hitchhiker  0.00333462 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5436  Resolvase domain  41.67 
 
 		 193 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3694  resolvase domain-containing protein  36.05 
 
 		 206 aa  50.4  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6450  resolvase domain-containing protein  40 
 
 		 193 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3562  resolvase domain-containing protein  42.03 
 
 		 208 aa  48.9  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0481  integrase catalytic region  39.71 
 
 		 463 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0053  hypothetical protein  42.03 
 
 		 90 aa  49.3  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0233  resolvase  37.68 
 
 		 183 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2702  resolvase domain-containing protein  45.07 
 
 		 307 aa  48.5  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.264305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2944  resolvase domain-containing protein  45.07 
 
 		 307 aa  48.5  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.857733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0202  resolvase  37.68 
 
 		 183 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3045  Resolvase domain protein  44.74 
 
 		 189 aa  48.5  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3714  resolvase domain-containing protein  43.94 
 
 		 188 aa  47.4  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.566828  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2392  Resolvase domain  37.14 
 
 		 197 aa  47.4  0.00007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000064315  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4190  resolvase  37.84 
 
 		 190 aa  47  0.00009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4290  resolvase  37.84 
 
 		 190 aa  47  0.00009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4459  resolvase  37.84 
 
 		 190 aa  47  0.00009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  36.84 
 
 		 199 aa  47  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2023  resolvase helix-turn-helix region  43.48 
 
 		 78 aa  46.6  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0068  resolvase  39.71 
 
 		 181 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0902003  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4319  resolvase-like protein  45.31 
 
 		 206 aa  45.8  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  41.89 
 
 		 199 aa  46.2  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0854  invertase/recombinase like protein  35.71 
 
 		 198 aa  45.4  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.160403  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6307  resolvase domain-containing protein  43.28 
 
 		 209 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  42.03 
 
 		 188 aa  44.7  0.0004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  44.93 
 
 		 188 aa  45.1  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0212  resolvase  39.66 
 
 		 69 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00171512 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  40 
 
 		 182 aa  44.7  0.0005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0235  resolvase domain-containing protein  42.19 
 
 		 187 aa  44.3  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6608  resolvase domain-containing protein  46.15 
 
 		 189 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.525053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0108  hypothetical protein  39.44 
 
 		 309 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3338  resolvase domain-containing protein  42.42 
 
 		 186 aa  43.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0167  resolvase domain-containing protein  39.44 
 
 		 196 aa  43.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0536  resolvase domain-containing protein  45.31 
 
 		 203 aa  43.5  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5431  Resolvase domain protein  43.06 
 
 		 185 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  42.86 
 
 		 188 aa  43.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0002  DNA-invertase, C-terminal region  39.19 
 
 		 114 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0052  hypothetical protein  37.5 
 
 		 201 aa  43.5  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3440  invertase/recombinase protein  34.85 
 
 		 188 aa  42.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.115695  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4731  Resolvase domain protein  38.57 
 
 		 187 aa  42.4  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0170  ISSod9, DNA-invertase  42.47 
 
 		 185 aa  42.7  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.579928  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1202  resolvase domain-containing protein  37.66 
 
 		 194 aa  42.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0019  ISSod9, DNA-invertase  42.47 
 
 		 185 aa  42.7  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1645  resolvase-like protein  51.16 
 
 		 213 aa  42.4  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.27327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4137  resolvase domain-containing protein  37.66 
 
 		 224 aa  42.4  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.130251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0540  Resolvase domain protein  47.46 
 
 		 190 aa  42  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  40.58 
 
 		 185 aa  41.6  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0409  resolvase domain-containing protein  46.15 
 
 		 186 aa  42  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000318958  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0149  resolvase  38.24 
 
 		 189 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  40 
 
 		 197 aa  41.2  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2795  resolvase family site-specific recombinase  39.06 
 
 		 81 aa  41.2  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.127054  n/a   
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0002  resolvase  35 
 
 		 190 aa  41.2  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141759  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  41.1 
 
 		 185 aa  41.2  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1993  transcriptional regulator, TetR family  47.06 
 
 		 202 aa  40.8  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00019531  normal  0.0761383 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  41.1 
 
 		 185 aa  40.8  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4685  resolvase domain-containing protein  51.11 
 
 		 193 aa  40.8  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2351  resolvase-like protein  38.46 
 
 		 235 aa  40.8  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.329475 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2332  resolvase domain-containing protein  35.29 
 
 		 227 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  35.21 
 
 		 192 aa  40.4  0.008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_009660  Krad_4707  resolvase domain-containing protein  52.86 
 
 		 190 aa  40.4  0.008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3256  Fis family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 116 aa  40.4  0.008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0578977  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5399  resolvase domain-containing protein  36.76 
 
 		 186 aa  40.4  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00909416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2813  resolvase-like protein  37.88 
 
 		 184 aa  40.4  0.009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.493253  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6748  resolvase domain-containing protein  48.84 
 
 		 201 aa  40  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.167425 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4123  resolvase domain-containing protein  41.67 
 
 		 185 aa  40  0.01  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0694671 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>