More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4731 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4731  Resolvase domain protein  100 
 
 		 187 aa  373  1e-103  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0068  resolvase  38.95 
 
 		 181 aa  143  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0902003  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  47.51 
 
 		 219 aa  143  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  45.09 
 
 		 184 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.623719 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4383  resolvase  45.88 
 
 		 193 aa  139  3e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0202  resolvase  39.53 
 
 		 183 aa  138  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0233  resolvase  39.53 
 
 		 183 aa  138  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  45.35 
 
 		 188 aa  138  4.999999999999999e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  45.88 
 
 		 184 aa  137  7e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0466  resolvase  45.88 
 
 		 193 aa  137  7e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.736746  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3045  Resolvase domain protein  43.02 
 
 		 189 aa  136  2e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2813  resolvase-like protein  41.95 
 
 		 184 aa  136  2e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.493253  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  50.33 
 
 		 197 aa  136  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0536  resolvase domain-containing protein  46.86 
 
 		 203 aa  135  3.0000000000000003e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  45.3 
 
 		 188 aa  135  4e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6748  resolvase domain-containing protein  45.35 
 
 		 201 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.167425 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3714  resolvase domain-containing protein  44.19 
 
 		 188 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.566828  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5037  resolvase domain-containing protein  44 
 
 		 201 aa  134  7.000000000000001e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.931406  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0108  hypothetical protein  45.51 
 
 		 309 aa  132  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5431  Resolvase domain protein  43.93 
 
 		 185 aa  132  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  44.71 
 
 		 185 aa  131  3.9999999999999996e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  44.12 
 
 		 188 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4685  resolvase domain-containing protein  42.78 
 
 		 193 aa  131  5e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  44.71 
 
 		 185 aa  131  6e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2702  resolvase domain-containing protein  45.2 
 
 		 307 aa  131  6e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.264305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2944  resolvase domain-containing protein  45.2 
 
 		 307 aa  131  6e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.857733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  44.19 
 
 		 194 aa  130  6.999999999999999e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  42.86 
 
 		 191 aa  130  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  42.86 
 
 		 182 aa  130  1.0000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0167  resolvase domain-containing protein  41.53 
 
 		 196 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4123  resolvase domain-containing protein  44.13 
 
 		 185 aa  128  5.0000000000000004e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0694671 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  43.86 
 
 		 185 aa  128  6e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0019  ISSod9, DNA-invertase  42.77 
 
 		 185 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0170  ISSod9, DNA-invertase  42.77 
 
 		 185 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.579928  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0052  hypothetical protein  39.08 
 
 		 201 aa  125  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  42.94 
 
 		 188 aa  125  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3440  invertase/recombinase protein  40.8 
 
 		 188 aa  125  4.0000000000000003e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.115695  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  42.94 
 
 		 187 aa  125  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  41.01 
 
 		 201 aa  124  6e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  42.37 
 
 		 190 aa  124  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2392  Resolvase domain  42.13 
 
 		 197 aa  124  9e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000064315  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2147  Resolvase domain protein  43.79 
 
 		 191 aa  124  9e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4249  resolvase domain-containing protein  43.79 
 
 		 191 aa  124  9e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.251845 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  39.44 
 
 		 199 aa  123  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2582  resolvase domain-containing protein  39.66 
 
 		 185 aa  121  7e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0854  invertase/recombinase like protein  40.11 
 
 		 198 aa  120  9.999999999999999e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.160403  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0095  resolvase domain-containing protein  37.99 
 
 		 189 aa  120  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0409  resolvase domain-containing protein  40.46 
 
 		 186 aa  119  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000318958  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1711  integrative genetic element Gsu5, resolvase  41.34 
 
 		 190 aa  119  3e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21550  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  42.86 
 
 		 218 aa  119  3e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.850113  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5126  Resolvase domain protein  43.65 
 
 		 197 aa  119  3e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.114051 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9833  Resolvase Protein  41.76 
 
 		 210 aa  118  3.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5459  resolvase domain-containing protein  40 
 
 		 190 aa  118  3.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2984  putative site-specific recombinases, DNA invertase Pin  39.2 
 
 		 203 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200056  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4991  resolvase domain-containing protein  42.69 
 
 		 189 aa  117  9e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  38.46 
 
 		 188 aa  117  9e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1490  resolvase domain-containing protein  35.8 
 
 		 183 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.832501  hitchhiker  0.00333462 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  37.91 
 
 		 192 aa  117  9.999999999999999e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6307  resolvase domain-containing protein  41.76 
 
 		 209 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0039  resolvase  38.86 
 
 		 181 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0991  resolvase domain-containing protein  42.46 
 
 		 205 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0378771  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0348  Resolvase domain protein  47.06 
 
 		 209 aa  115  3e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1202  resolvase domain-containing protein  41.43 
 
 		 194 aa  115  3e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009660  Krad_4707  resolvase domain-containing protein  46.82 
 
 		 190 aa  115  3.9999999999999997e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4137  resolvase domain-containing protein  40.66 
 
 		 224 aa  115  3.9999999999999997e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.130251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6634  resolvase domain-containing protein  41.14 
 
 		 198 aa  115  5e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000708994  hitchhiker  0.0000367715 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4459  resolvase  40.74 
 
 		 190 aa  115  5e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4290  resolvase  40.74 
 
 		 190 aa  115  5e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4190  resolvase  40.74 
 
 		 190 aa  115  5e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2172  recombinase  41.81 
 
 		 214 aa  114  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0678128  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4537  Resolvase domain protein  39.57 
 
 		 198 aa  114  6.9999999999999995e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.41321 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  33.33 
 
 		 199 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4319  resolvase-like protein  42.77 
 
 		 206 aa  113  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5093  resolvase domain-containing protein  40.33 
 
 		 201 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.993134 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  33.89 
 
 		 201 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4560  resolvase domain-containing protein  36.76 
 
 		 192 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0235  resolvase domain-containing protein  38.15 
 
 		 187 aa  113  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5436  Resolvase domain  41.52 
 
 		 193 aa  112  3e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  36.21 
 
 		 188 aa  112  3e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6782  resolvase domain-containing protein  44.51 
 
 		 184 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.504828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0189  resolvase domain-containing protein  36.22 
 
 		 206 aa  111  6e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0086  resolvase family site-specific recombinase  36.61 
 
 		 196 aa  111  6e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.464664  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1992  resolvase domain-containing protein  36.22 
 
 		 206 aa  111  6e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2144  Resolvase domain protein  36.87 
 
 		 196 aa  111  6e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0618608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0014  resolvase domain-containing protein  35.96 
 
 		 184 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.125158  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3007  resolvase-like protein  40.93 
 
 		 204 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0154323 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4042  serine-based site-specific recombinase activity  40.93 
 
 		 204 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.890679  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4975  serine-based site-specific recombinase activity  40.93 
 
 		 204 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.283487  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3477  resolvase domain-containing protein  36.61 
 
 		 196 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6785  resolvase domain-containing protein  43.86 
 
 		 195 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2668  helix-turn-helix, Fis-type  42.54 
 
 		 204 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00804941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2823  resolvase domain-containing protein  38.12 
 
 		 197 aa  109  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2746  resolvase domain-containing protein  38.12 
 
 		 197 aa  109  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1568  helix-turn-helix, Fis-type  42.54 
 
 		 204 aa  109  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0041  resolvase domain-containing protein  35.63 
 
 		 184 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.0000573211 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3694  resolvase domain-containing protein  40 
 
 		 206 aa  108  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4835  Resolvase domain protein  38.07 
 
 		 201 aa  108  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.291279 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1052  Resolvase domain  37.85 
 
 		 186 aa  108  5e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5396  resolvase domain-containing protein  38.15 
 
 		 180 aa  107  8.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.859533  n/a   
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6497  resolvase domain-containing protein  41.52 
 
 		 193 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>